.2014年6月18日;9(6):e100343。
doi:10.1371/journal.pone.0100343。
2014年电子收集。
OsDREB1b启动子调控区组蛋白H3的差异乙酰化促进冷应激期间染色质重塑和转录激活
附属公司
附属公司
- 1印度西孟加拉邦Kolkta-700054,C.I.T.Scheme VII M,P-1/12,Bose Institute(Centenary Campus)植物生物学部。
- 2韩国庆山延南大学生物技术学院。
剪贴板中的项目
OsDREB1b启动子调控区组蛋白H3的差异乙酰化促进冷应激期间染色质重塑和转录激活
蒂潘·罗伊等。
公共科学图书馆一号.
.
.2014年6月18日;9(6):e100343。
doi:10.1371/journal.pone.0100343。
2014年电子收集。
附属公司
- 1印度西孟加拉邦Kolkta-700054,C.I.T.Scheme VII M,P-1/12,Bose Institute(Centenary Campus)植物生物学部。
- 2韩国庆山延南大学生物技术学院。
剪贴板中的项目
勘误表in
- 《公共科学图书馆·综合》。2014;9(8):e105229
摘要
水稻DREB1同源基因OsDREB1b是由冷胁迫转录诱导的,OsDREB1b的过度表达导致对高盐和低温胁迫的耐受性增加。OsDREB1b的这种时空表达之前是启动子和基因激活上游区域染色质结构的变化。OsDREB1b基因的启动子和上游区域似乎排列成核小体阵列。OsDREB1b上游约700 bp区域的核小体定位显示,两个位于-610至-258之间的核小体和一个位于核心启动子和TSS的弱定位核小体。在冷胁迫下,上游区域的核小体排列发生了显著变化,顺式元件和核心启动子TATA盒附近的DNaseI超敏反应或MNase消化增加。ChIP测定显示组蛋白H3K9在整个基因座中高度乙酰化,而在H3K14ac和H3K27ac中观察到区域特异性增加。此外,在转录激活期间,启动子区域的RNA PolII占有率增加。OsDREB1b基因座的H3占有率没有显著变化,这抵消了低温胁迫期间核小体丢失的可能性。有趣的是,当逆境植物恢复到正常温度时,发现逆境诱导的OsDREB1b转录水平增强以及上游区域组蛋白H3乙酰化作用减弱。结果表明,在低温胁迫下,OsDREB1b基因的转录上调需要改变染色质构象。综合结果表明,在转录“关闭”状态下,OsDREB1b上游和启动子区域存在闭合的染色质构象。在寒冷胁迫期间,区域特异性组蛋白修饰标记的变化促进染色质结构的改变,以促进转录机制的结合,从而实现适当的基因表达。
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赠款和资金
这项工作得到了生物技术部的支持;印度政府;赠款编号(BT/AB/05/02/2007)。迪潘·罗伊衷心感谢CSIR;印度政府,感谢他的奖学金[09/015(0412)/2010-EMR-I.]。作者衷心感谢Bose Institute对机构资金的支持。本手稿的内容仅由作者负责,不一定代表资助机构的官方观点。资助者在研究设计、数据收集和分析、决定出版或编写手稿方面没有任何作用。