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.2014年5月1日；23(9):2313-23.
doi:10.1093/hmg/ddt624。 Epub 2013年12月11日。

CLYBL是一种具有苹果酸合成酶和β-甲基苹果酸合酶活性的多态性人类酶

劳拉·斯特里特马特 1, 杨丽, 内森·J·中冢, 萨拉·卡尔沃, 泽农·格拉巴雷克, Vamsi K Mootha公司
附属公司

CLYBL是一种具有苹果酸合成酶和β-甲基苹果酸合酶活性的多态性人类酶

劳拉·斯特里特马特等。 人类分子遗传学. .

摘要

CLYBL是一种功能未知的人类线粒体酶，存在于多个真核生物类群中，对细菌保守。该蛋白在所有哺乳动物器官的线粒体中表达，在棕色脂肪和肾脏中表达最高。大约5%的人类在CLYBL中存在过早停止多态性，这与循环维生素B12水平降低有关。利用比较基因组学，我们现在表明，CLYBL与线粒体B12途径的其他成分强烈共表达，并与其他成分特异性共进化。我们确认CLYBL中的提前终止多态性导致蛋白质表达的缺失。为了阐明CLYBL的分子功能，我们使用了比较操纵子分析、结构建模和酶动力学。我们报道，CLYBL编码苹果酸/β-甲基苹果酸合成酶，将乙醛酸和乙酰辅酶a转化为苹果酸，或将乙醛酸酯和丙酰基辅酶a转换为β-甲基果酸。苹果酸合成酶因其在植物和低等生物的乙醛酸分流中的既定作用而广为人知，传统上被描述为不在人类中发生。苹果酸/β-甲基苹果酸合成酶在人体生理学中的广泛作用及其与维生素B12代谢的机制联系尚不清楚。

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数字

图1。
图1。
CLYBL域的组织和表达。(A类)CLYBL含有一个预测的22氨基酸MTS和一个“HpcH/HpaI醛缩酶/柠檬酸裂解酶家族”蛋白质域。预测的镁-（E171，D206）和基质-（R107，E171）结合位点以白色显示。自然发生的R259X停止多态性（rs41281112）用红色表示(B类)用于共表达分析的RNA和蛋白质数据集之间18个小鼠组织中Clybl RNA和蛋白质的表达水平相同。(C类)来自1000基因组项目的三个基因含有分离的CLYBL LOF等位基因，其淋巴母细胞为CLYBL(D类)基于qPCR和(E类)显示了基于免疫印迹的蛋白质表达。
图2。
图2。
CLYBL共同进化和共同表达。(A类)CLYBL的系统发育谱显示，预测的基因具有LLR>0的进化历史。蓝色表示CLYBL同源物。(B类)CLYBL与所有基因（左）和MitoCarta基因（右）的RNA共表达分布，基于公共基因表达图谱，集中于图1B（16）所示的18个小鼠组织。(C类)CLYBL与所有基因（左）和MitoCarta基因（右）共同表达的蛋白质分布，基于28个小鼠组织的公开蛋白质表达数据（17）。
图3。
图3。
CLYBL的比较操纵子分析(A类)在含有CLYBL（citE）和citD/F同源物的121个物种中，共出现在含CLYBL-操纵子中的前10个同源基因簇（COG）。(B类)前10个COG在281个包含CLYBL同源物但缺少citD/F同源物的物种中同时出现在含有CLYBL-操纵子中。
图4。
图4。
CLYBL具有苹果酸合酶和β-甲基苹果酸合成酶活性。(A类)苹果酸合成酶反应。(B类)LC-MS提取的离子色谱图显示，当含有镁、乙醛酸和ACoA的反应混合物与0或1µg CLYBL孵育时，在30分钟内检测到苹果酸标准物和苹果酸的积累。插图显示了苹果酸的代表性MS/MS光谱。(C类)β-甲基苹果酸合成酶反应。(D类)与（b）相同，但用于用PCoA代替ACoA生产β-甲基苹果酸。插图显示了β-甲基苹果酸的典型MS/MS光谱。
图5。
图5。
CLYBL的结构模型。该模型表明底物ACoA和乙醛酸适合活性位点，PCoA而不是ACoA有空间。黄色虚线表示直接键，而橙色虚线表示氢键。PyMOL（30）中显示了结构。
图6。
图6。
线粒体B12代谢背景下新鉴定的CLYBL酶活性。浅蓝色基因编码线粒体B12途径中的酶。品红中的基因编码与CLYBL高度共表达的转录物和蛋白质。实线表示一步反应，虚线表示多个酶步骤。
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    1. Banerjee R.、Gherasim C.、Padovani D.细胞内B12贩运中的修补工、裁缝和士兵。货币。操作。化学。《生物》2009；13:484–491.doi:10.1016/j.cbpa.2009.07.007.-内政部-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Gherasim C.、Lofgren M.、Banerjee R.在B12公路上航行：钴胺的同化、输送和紊乱。生物学杂志。化学。2013;288:13186–13193.doi:10.1074/jbc。113458810兰特.-内政部-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Lin X.，Lu D.，Gao Y.，Tao S.，Yang X.，Feng J.，Tan A.，Zhang H.，Hu Y.，Qin X.，et al.全基因组关联研究确定了与中国男性血清维生素B12水平相关的新基因座。嗯，分子遗传学。2012;21:2610–2617.doi:10.1093/hmg/dds062.-内政部-公共医学
    1. Grarup N.、Sulem P.、Sandholt C.H.、Thorleifsson G.、Ahluwalia T.S.、Steinthorsdottir V.、Bjarnason H.、Gudbjartsson D.F.、Magnusson O.T.、SparsöT.应用深度测序的大型数据集揭示了维生素B12和叶酸水平的遗传结构。公共科学图书馆-遗传学。2013;9:e1003530。doi:10.1371/journal.pgen.1003530.-内政部-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Subramanian S.，Sivaraman C.细菌柠檬酸裂解酶。生物科学杂志。1984;6:379–401.doi:10.1007/BF02703895.-内政部

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