摘要
抗菌肽(AMPs),也称为宿主防御肽,是先天免疫反应中进化上保守的成分,存在于所有生命类别中。根据其特殊功能,AMP通常分为十类:抗菌肽、抗癌/肿瘤肽、抗真菌肽、抗-HIV肽、抗病毒肽、抗副作用肽、抗盈利肽、具有趋化活性的AMP、杀虫肽和杀精子肽。给定一个查询肽,我们如何识别它是AMP还是非AMP?如果是,我们能确定它属于哪种或哪些功能类型吗?特别是,由于AMP可能属于两个或多个函数类型,我们如何处理多类型问题?为了解决这些显然对基础研究和药物开发都非常重要的问题,基于伪氨基酸组成(PseAAC)和模糊K-最近邻(FKNN)算法开发了一种多标签分类器,其中PseAAA的成分具有五种物理化学性质。这种新型分类器被称为iAMP-2L,其中“2L”表示它是一个2级预测器。第一级是回答上面的第一个问题,而第二级是回答这个领域任何现有方法都无法解决的第二个和第三个问题。为了方便用户,在http://www.jci-bioinfo.cn/iAMP-2L。
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