跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

点政府

政府意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2012;8(7):e1002829。
doi:10.1371/journal.pgen.1002829。 Epub 2012年7月19日。

GRHL3/GET1和trithorax小组成员合作激活表皮祖细胞分化程序

附属公司

GRHL3/GET1和trithorax小组成员合作激活表皮祖细胞分化程序

阿米莉亚·索托·霍普金等。 公共科学图书馆-基因. 2012.

摘要

Polycomb和Trithoris的拮抗作用负责确定哺乳动物组织中的适当细胞命运。在表皮,一种自我更新的上皮中,先前的研究表明,Polycomb抑制的释放只能部分解释分化基因的激活。我们现在表明,Trithorise也是表皮分化的关键调节器,不仅通过激活Polycomb在祖细胞中抑制的基因,还通过激活不受Polycomm调控的基因。分化相关转录因子GRHL3/GET1将普遍表达的Trithorise复合体招募到分化基因子集。

PubMed免责声明

利益冲突声明

提交人声明,不存在相互竞争的利益。

数字

图1
图1。Histone景观TGM1型发起人。
(A) 的qRT-PCRTGM1型在人膀胱上皮细胞(RT4)、未分化正常人表皮角质形成细胞(NHEK U)和分化正常人上皮角质形成淋巴细胞(NHEK-D)中的表达。(B) 人体示意图TGM1型基因。方框表示外显子,圆圈表示预测的GRHL3结合位点,箭头表示转录起始位点,数字对应于引物对的位置。(C) NHEK U和NHEK D细胞中的GRHL3 ChIP分析。X轴以下的数字表示B(D–F)ChIP分析中指定的引物,用于(D)NHEK U、(E)NHEK D和(F)RT4细胞中组蛋白3赖氨酸4(H3K4)单(1)和三(3)甲基化、H3K9乙酰化(Ac)和H3K27me3。X轴下方的数字表示B中指定的引物。对于ChIP分析,数据为平均值,误差条表示SD;mRNA表达数据为平均值,误差条代表SEM。
图2
图2。MLL2占有率和H3K4甲基化TGM1型启动子依赖于人表皮角质形成细胞中的GRHL3。
(A) H3K4-me1,-me2,-me3的ChIP分析TGM1型用GRHL3 siRNA和Neg siRNA处理NHEK D中的启动子。(B)TGM1型用指定的siRNAs处理后NHEK D细胞中的表达。(C) 用MLL1和MLL2抗体在NHEK D细胞中进行ChIP检测,用引物q-PCR检测第27页TGM1型发起人。第27页被用作MLL1 ChIP的阳性对照。(D) 在Neg siRNA和GRHL3 siRNA处理的NHEK D细胞中使用GRHL3和MLL2抗体进行ChIP分析,通过q-PCR和引物检测到TGM1型启动子区域。(E) 用引物q-PCR检测Neg siRNA和MLL2 siRNA处理的NHEK D细胞中GRHL3的ChIP分析TGM1型启动子区域。对于ChIP测定,数据是标准化为Neg siRNA的平均值,误差条表示SD;mRNA表达数据为平均值,误差条代表SEM。
图3
图3。GRHL3和MLL2的缺失影响角质形成细胞分化过程中表达谱定义的表皮分化基因。
(A–D)(A)前代、(B)早期、(C)中期和(D)晚期星团中的K-均值星团和相应GO类别的热图。(E–F)GO类基因在(E)GRHL3 siRNA和(F)MLL2 siRNA后显著下调维恩图显示了GRHL3和MLL2 siRNA显著下调的基因之间的重叠。(K) 根据Fisher精确检验计算出的GRHL3 siRNA和MLL2 siRNA.p值对属于A–D分化簇的基因重叠和基因下调的显著性。R(右) = 富集因子。
图4
图4。MLL2、MLL1和GRHL3共占人表皮角质形成细胞分化基因。
用阴性siRNA和GRHL3 siRNA处理的NHEK D细胞中的GRHL3(A)、MLL2(B)和H3K4me3(C)抗体进行(A–C)ChIP分析。用NHEK D细胞中的(D)MLL1和(E)SETD1A抗体进行ChIP分析。(F) 使用阴性siRNA和MLL2 siRNA处理的NHEK D细胞中的GRHL3抗体进行ChIP分析。引物对扩增每个基因启动子中预测的GRHL3结合位点所在的区域。
图5
图5。WDR5和GRHL3共占人表皮角质形成细胞分化基因。
(A) NHEK D细胞(上图)和HA-GRHL3转染的293T细胞(下图)中的共免疫沉淀。用所示抗体免疫沉淀细胞提取物,用所示的抗体探测印迹(IgG用作对照)。*表示预测的WDR5频带。(B) 说明WDR5和GRHL3 ChIP-seq峰重叠的基因数量的维恩图。(C) 8347个基因的GO类别具有重叠的WDR5和GRHL3 ChIP-seq峰值。(D–E)维恩图显示了在(D)GRHL3 siRNA介导的缺失和GRHL3占据的基因显著下调的基因之间的重叠,以及在(E)MLL2 siRNA介介导的耗尽和WDR5占据的基因之间下调的基因(通过Fisher精确检验计算的p值)。(F) WDR5和GRHL3共占基因示例,显示表皮角质形成细胞分化过程中的mRNA表达(顶部面板),以及显示siRNA耗尽GRHL3和MLL2后各自基因表达变化的表格(底部面板)。
图6
图6。PcG和trxG在表皮分化中的调节。
在NHEK D细胞中钙诱导分化后1小时和3小时,用H3K27me3和H3K4me3抗体进行(A–C)ChIP测定。(D) PcG和trxG或trxG单独介导的表皮角质形成细胞分化模型。

类似文章

引用人

  • 分化信号诱导无骨细胞3a通过GRHL3在鳞状上皮和鳞状细胞癌中的表达。
    Smith NJ、Reddin I、Policelli P、Oh S、Zainal N、Howes E、Jenkins B、Tracy I、Edmond M、Sharpe B、Amendra D、Zheng K、Egawa N、Doorbar J、Rao A、Mahadevan S、Carpenter MA、Harris RS、Ali S、Hanley C、Buisson R、King E、Thomas GJ、Fenton TR。 Smith NJ等人。 Res Sq[预打印]。2024年3月4日:rs.3.rs-3997426。doi:10.21203/rs.3.rs-3997426/v1。 Res Sq.2024号。 PMID:38496447 免费PMC文章。 预打印。
  • 改进特应性皮炎和银屑病诊断和治疗的多组学方法。
    Rusiñol L,普伊格L。 Rusiñol L等人。 国际分子科学杂志。2024年1月15日;25(2):1042. doi:10.3390/ijms25021042。 国际分子科学杂志。2024 PMID:38256115 免费PMC文章。 审查。
  • Mettl3-催化的m6A调节组蛋白修饰物和自我更新体细胞组织中的修饰表达。
    Maldonado López AM、Ko EK、Huang S、Pacella G、Kuprasertkul N、D'souza CA、Reyes Hueros RA、Shen H、Stoute J、Elashal H、Sinkfield M、Anderson A、Prouty S、Li HB、Seykora JT、Liu KF、Capell BC。 Maldonado López AM等人。 科学进展2023年9月;9(35):标题5234。doi:10.1126/sciadv.adg5234。Epub 2023年9月1日。 科学进展2023。 PMID:37656787 免费PMC文章。
  • 驱动基因组合决定皮肤鳞癌疾病的连续发展。
    Bailey P、Ridgway RA、Cammareri P、Treanor-Taylor M、Bailey UM、Schoenherr C、Bone M、Schreyer D、Purdie K、Thomson J、Rickaby W、Jackstadt R、Campbell AD、Dimonitsas E、Stratigos AJ、Arron ST、Wang J、Blyth K、Proby CM、Harwood CA、Sansom OJ、Leigh IM、Inman GJ。 Bailey P等人。 国家公社。2023年8月25日;14(1):5211. doi:10.1038/s41467-023-40822-9。 国家公社。2023 PMID:37626054 免费PMC文章。
  • IRX5促进DNA损伤修复和毛囊干细胞激活。
    Chen JK、Wiedemann J、Nguyen L、Lin Z、Tahir M、Hui CC、Plikus MV、Andersen B。 陈JK等。 干细胞报告。2023年5月9日;18(5):1227-1243. doi:10.1016/j.stemcr.2023.03.013。Epub 2023年4月20日。 干细胞报告。2023 PMID:37084727 免费PMC文章。

工具书类

    1. Schuettengruber B、Martinez AM、Iovino N、Cavalli G.三胸类蛋白质:打开基因并保持其活性。Nat Rev Mol细胞生物学。2011;12:799–814.-公共医学
    1. Breiling A,Sessa L,Orlando V.多梳和三疣类蛋白质的生物学。Int Rev细胞。2007;258:83-136。-公共医学
    1. Schuettengruber B、Chourrout D、Vervoort M、Leblanc B、Cavalli G。多梳和三疣蛋白对基因组的调控。单元格。2007;128:735–745.-公共医学
    1. Akam M.果蝇胚胎异基因模式的分子基础。发展。1987;101:1–22.-公共医学
    1. Beck S,Faradji F,Brock H,Peronnet F.Hox基因表达模式的维持。高级实验医学生物。2010;689:41–62.-公共医学

出版物类型

MeSH术语

关联数据