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.2011年2月;15(1):149-55.
doi:10.1007/s11030-010-9227-8。 Epub 2010年2月11日。

Quat-2L:预测蛋白质四元结构属性的网络服务器

附属公司

Quat-2L:预测蛋白质四元结构属性的网络服务器

宣晓等。 摩尔潜水员. 2011年2月.

摘要

通过将功能域和序列相关的伪氨基酸组成方法相结合,开发了一种称为“Quat-2L”的2层预测因子,用于仅根据蛋白质的序列信息预测蛋白质的四级结构属性。第一层是将查询蛋白识别为单体、同聚体或异聚体。如果由此获得的结果是同聚物或异聚物,则将自动继续预测,以进一步确定其属于以下六种亚型之一:(1)二聚体、(2)三聚体、(3)四聚体、、五聚体、六聚体和八聚体。Quat-2L用于第1层鉴定的总成功率为71.14%;而第二层的总成功率分别为76.91%和82.52%。这些比率是通过对严格的基准数据集进行折刀交叉验证测试得出的,在该数据集中,没有任何蛋白质与同一子集中的任何其他蛋白质具有≥60%的配对序列一致性。作为一个网络服务器,Quat-2L可以通过http://icpr.jci.jx.cn/bioinfo/Quat-2L,其中可以在大约15秒内获得2级结果。

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    1. 《理论生物学杂志》。2008年5月21日;252(2):350-6-公共医学
    1. BMC生物信息学。2003年9月11日;4:41-公共医学
    1. 氨基酸。2005年2月;28(1):57-61-公共医学
    1. Anal生物化学。2009年7月1日;390(1):68-73-公共医学
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