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.2008;8(18):1676-90.
doi:10.2174/156802608786786543。

用MARCH-INSIDE方法预测抗菌药物和靶点

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用MARCH-INSIDE方法预测抗菌药物和靶点

亨贝托·冈萨雷斯-迪亚斯等。 当前顶级药物化学. 2008.

摘要

MARCH-INSIDE方法是研究药物化学中定量结构-活性关系(QSAR)的一种简单而有效的计算方法。该方法使用马尔可夫链理论生成参数,以数字方式描述药物和药物靶标的化学结构。该方法生成了两种主要类型的参数:随机拓扑指数(Stochastic Topological Indices,sto-TIs)和随机三维地形指数(sto-TPGI)。使用这些参数可以在大型数据库中快速收集、注释、检索、比较和挖掘分子和大分子化学结构。在这里描述的工作中,我们回顾并评论了MARCH-INSIDE在抗菌药物药物化学中的几种应用及其分子靶点。首先,我们修订了经典sto-TIs的使用,以预测用于治疗法西斯的抗寄生虫化合物。接下来,我们修订了手性sto-TIs(sto-CTIs)的使用,以预测新的抗菌、抗病毒和抗球虫化合物。然后,我们回顾了多靶点sto-TIs(mt-sto-TIs),它将预测抗真菌、抗菌或抗寄生虫药物与多靶点(微生物物种)的QSAR模型统一起来。我们还讨论了使用mt-sto-TIs根据分子结构组装抗菌化合物的药物相似性复杂网络。最后,我们回顾了MARCH-INSIDE在抗菌药物蛋白质或RNA靶点生成大分子TIs和TPGIs方面的应用。

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