跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2008年1月;36(数据库问题):D735-40。
doi:10.1093/nar/gkm1005。 Epub 2007年12月1日。

TreeFam:2008更新

附属公司

TreeFam:2008更新

觉阮等。 核酸研究. 2008年1月.

摘要

TreeFam公司(http://www.treefam.org)其目的是为所有动物基因家族提供精心策划的系统发育树,以及直系和副系分配。TreeFam的4.0版包含1314个家族的管理树和14351个家族的自动生成树。我们已经扩展了TreeFam,包括25个完全测序的动物基因组,以及来自植物和真菌外群物种的四个基因组。我们还引入了更精确的方法,用于将基因自动分组到家族中,用于构建系统发育树,以及推断同源和副同源。用于查看系统发育树和家族信息的用户界面得到了改进。此外,一个新的perl API允许用户轻松地从TreeFam mysql数据库中提取数据。

PubMed免责声明

数字

图1。
图1。
TreeView小程序的屏幕截图。

类似文章

引用人

工具书类

    1. 惠誉WM。区分同源蛋白质和类似蛋白质。系统。Zool(动物园)。1970;19:99–113.-公共医学
    1. 科宁EV。正态、平行和进化基因组学。每年。修订版Genet。2005;39:309–338.-公共医学
    1. Brown D,Sjolander K。利用系统发育推断进行功能分类。公共科学图书馆计算。生物学2006;2:e77。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Li H,Coghlan A,Ruan J,Coin LJ,Heriche JK,Osmothly L,Li R,Liu T,Zhang Z,et al.TreeFam:动物基因家族系统发育树的策展数据库。2006年《核酸研究》;34:D572–D580。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. O'Brien KP,Remm M,Sonnhammer EL。Inparanoid:真核生物同源基因的综合数据库。核酸研究2005;33:D476–D480。-项目管理咨询公司-公共医学

出版物类型

赠款和资金