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.2006年4月;4(4):e103。
doi:10.1371/journal.pbio.0040103。 Epub 2006年3月7日。

IAN家族对T淋巴细胞的生存和发育起关键性调节作用

附属公司

IAN家族对T淋巴细胞的生存和发育起关键性调节作用

武士·尼塔等。 公共科学图书馆生物. 2006年4月.

摘要

IAN(免疫相关核苷酸结合蛋白)家族是一个在脊椎动物免疫细胞和植物细胞抗菌反应期间表达的功能性无特征GTP结合蛋白家族。在这里,我们表明,编码在单个小鼠基因组簇中的所有八个IAN家族基因主要在淋巴细胞中表达,并且在胸腺选择T淋巴细胞后,IAN1、IAN4和IAN5的表达显著升高。获得功能实验表明,IAN1的过早过度表达会杀死未成熟的胸腺细胞,而短发夹RNA介导的功能丧失研究表明,IAN4支持阳性选择。IAN5的敲除扰乱了CD4/CD8双阳性胸腺细胞的最佳生成,并降低了成熟T淋巴细胞的存活率。我们也有证据表明,IAN4和IAN5与抗凋亡蛋白Bcl-2和Bcl-xL相关,而IAN1与促凋亡Bax相关。因此,IAN家族是一个新的T细胞受体反应蛋白家族,它对T淋巴细胞的胸腺发育和存活起关键性调节作用,并可能通过与Bcl-2家族蛋白的结合发挥调节功能。

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数字

图1
图1。IAN家族基因
(A) 指示物种基因组中的IAN家族基因簇。指出了小鼠IAN基因及其在人和大鼠中的同源序列。对于鸡、斑马鱼和水芹,箭头表示可能编码AIG1域蛋白的基因。在鸡中,预计有19个基因编码AIG1结构域蛋白,箭头表示有15个基因聚集在第2染色体上。在斑马鱼的16号染色体上发现了23个基因簇。在水芹中,14个预测基因中有10个聚集在1号染色体上。(B) 小鼠IAN家族蛋白的预测结构。数字是指全长蛋白质的氨基酸残基。(C) IAN蛋白AIG1结构域的邻接树。拟南芥AIG1,残基44–243;烟草N.tabacum NTGP4(AAD09518),残留量23–222;G.最大NTGP4(BI316235),残留物1–118;O.sativa AIG1(CAE04223),残留物31–230;Z.五月AIG1(AW120061),残基1–200;D.rerio IAN(BC053197),残留物1–200;五倍子IAN(XP_427942),残基3–202;小家鼠IAN1,残基31-230;褐家鼠IAN1,残基31-230;智人IAN1,残基45-244。基因组中未发现IAN基因果蝇(苍蝇),冈比亚按蚊,肠水蚤(海鞘),秀丽隐杆线虫,酿酒酵母(酵母),以及所有细菌和古菌。
图2
图2。小鼠IAN家族基因的表达
(A) 定量RT-PCR分析C57BL/6小鼠组织、纯化脾细胞亚群和纯化胸腺细胞亚群的总RNA。IAN家族基因的mRNA水平最初标准化为GAPDH公司水平,并进一步归一化为胸腺中表达的水平。胸腺组织中所有IAN家族基因的相对表达如1所示。(B) 相对信使核糖核酸水平IAN1、IAN4,IAN5公司CD4中+CD8(CD8)+,CD4+CD8(CD8)+CD5(CD5)低的和CD4+CD8(CD8)+CD5(CD5)高的C57BL/6(野生型)小鼠和CD4的胸腺细胞+CD8(CD8)+TCRα缺乏小鼠胸腺细胞[42]. (C)IAN1、IAN4、,IAN5公司CD4中的mRNA水平+CD8(CD8)+来自阳性选择器(AND-TCR Aβ)的胸腺细胞+/+和2C-TCRk/b(k/b)[43])TCR转基因小鼠和空选择子(and-TCR Aβ−/−[44]和2C-TCR千/千)TCR转基因小鼠。(D) 相对信使核糖核酸水平IAN1、IAN4、,IAN5公司总计,CD4+CD8(CD8)+CD69型低的,CD4+CD8(CD8)+CD69型高的,CD4+CD8(CD8)CD69型高的和CD4+CD8(CD8)CD69型低的C57BL/6小鼠胸腺细胞。(E) 将TCRα缺陷小鼠的胸腺细胞与佛波醇12-肉豆蔻酸13-醋酸盐(0.2 ng/ml)和离子霉素(0.2μg/ml)共同培养指定时间。(F) 来自Aβ的胸腺细胞−/−β2百万−/−老鼠[45]用或不用板结合抗CD3(克隆2C11)和抗CD28(克隆37.51)抗体培养24小时。条形图显示平均值±标准误差。
图3
图3。胸腺细胞发育中IAN1、IAN4和IAN5的过度表达
(A) MSCV逆转录病毒结构图。IRES,内部核糖体进入位点;LTR,长末端重复;Ψ,封装信号。(B) 用流式细胞术分析感染了表达IAN1-HA、IAN4、IAN5或EGFP的逆转录病毒的NIH-3T3细胞的EGFP荧光,用免疫印迹(IB)分析IAN蛋白的表达。显示了所示区域内细胞的频率和平均荧光强度(MFI)。(C) 第14.5天,在FTOC中重组感染指示逆转录病毒的胎儿胸腺细胞。EGFP公司+第6天纯化的细胞进行mRNA表达分析。(D) 总细胞(条纹条)和EGFP的活细胞数+第6天FTOC中的单元格(开放栏)。实心条表示显著减少(第页< 0.01). EGFP、,n个= 7; IAN1、,n个= 6; IAN4,n个= 6; IAN5,n个= 6. (E) 总细胞的EGFP直方图和EGFP的CD4/CD8谱+第6天FTOC中的细胞。点图中的数字显示框中单元格的频率。(F) 所示EGFP的Annexin V和PI染色+第6天FTOC中的胸腺细胞亚群。实心条表示显著增加(第页< 0.05). 条形图显示平均值±标准误差。NS,不显著(第页≥0.05)*第页< 0.05; **第页<0.01。EGFP中的CD4/CD8发育特征没有显著差异细胞群。
图4
图4。胸腺细胞发育中IAN1、IAN4和IAN5的敲除
(A) 逆转录病毒shRNA结构图。Puro公司,嘌呤霉素抗性基因。SIN-LTR,自我激励长末端重复。(B) 表达IAN1-HA、IAN4-HA或IAN5-HA的BW5147细胞被shRNA逆转录病毒感染,感染细胞通过嘌呤霉素选择富集。用抗HA IB分析蛋白质表达水平。萤光素酶(Luc)shRNA作为对照。(C) 第14.5天,用shRNA逆转录病毒感染的胎儿胸腺细胞在FTOC中重建。EGFP公司+第6天纯化的细胞进行mRNA表达分析。(D) 总细胞(条纹条)和EGFP的活细胞数+第6天FTOC中的单元格(开放栏)。(E) 总细胞的EGFP直方图和EGFP的CD4/CD8谱+第6天FTOC中的细胞。EGFP的频率+直方图中显示了所示区域中的细胞和平均荧光强度(MFI)。点图中的数字显示EGFP的频率+框中的单元格。(F) 第6天指示细胞群的频率。实心条表示与对照组的数值存在显著差异(吕克shRNA)(第页< 0.05). 条形图显示平均值±标准误差。NS,不显著(第页≥ 0.05);* 第页< 0.05;** 第页< 0.01. 在(D)和(F)中,吕克shRNA,n个= 11;国际机场一号shRNA,n个= 5;IAN4号机组shRNA,n个= 11;IAN5公司shRNA,n个= 8. EGFP中的CD4/CD8发育特征没有显著差异细胞群。
图5
图5。IAN4和IAN5在胸腺细胞发育中的差异作用
(A) 第14.5天,在FTOC中重建感染shRNA逆转录病毒的胎儿胸腺细胞。显示了第10天指示细胞群的频率。吕克shRNA,n个= 4;IAN4型shRNA,n个= 5. (B) 第14.5天,将来自AND-TCR转基因或2C-TCR转基因小鼠的胎儿胸腺细胞感染并在C57BL/6胎儿胸腺叶中重建6-8天。对于2C-TCR-转基因胸腺细胞,通过门控CD8SP CD5分析成熟CD8SP细胞高的人口。和-吕克shRNA,n个= 11; 和-IAN4号机组shRNA,n个= 12; 2摄氏度-吕克shRNA,n个= 5; 2摄氏度-IAN4号机组shRNA,n个=5。(C) 第14.5天,在FTOC中重组感染shRNA逆转录病毒的胎儿胸腺细胞(如图4C-4F)。EGFP公司+通过抗CD25和抗CD44抗体染色分析第6天胸腺细胞的DN亚群。勒克shRNA,n个= 6;IAN5公司shRNA,n个= 8. (D) CD4细胞CD8(CD8)CD25型CD44细胞通过去除表达CD4、CD8、CD25或CD44的细胞,从第17天的胎儿胸腺细胞中纯化DN4细胞,感染指示的逆转录病毒,并在FTOC中重组2天;n个= 4. 条形图显示平均值±标准误差。NS,不显著(第页≥ 0.05);* 第页< 0.05;** 第页< 0.01.
图6
图6。IAN家族蛋白与Bcl-2家族蛋白的相互作用
(A) 用FLAG标记的IAN分子与Bcl-2、Bcl-xL、HA标记的Bax、HA标记的Bak、HA标记的Bad、BimEL、HA标记的IκBα或EGFP共同转染293T细胞。细胞裂解物为具有抗FLAG M2抗体的IP和具有指示抗体的IB。(B) 仅表达EGFP(载体)、FLAG标记的IAN4或FLAG标记IAN5的23–1–8个T细胞是具有抗FLAG M2抗体的IP,而具有抗Bcl-2或抗Bcl-xL抗体的IB。(C) 表达FLAG标记IAN4或FLAG标记的IAN5的23–1–8个T细胞是具有正常IgG、抗Bcl-2或抗Bcl-xL抗体的IP细胞,以及具有抗FLAG M2抗体的IB细胞。箭头表示标记有FLAG的IAN4或标记有FLAG-的IAN5。(D) 在存在或不存在IL-2的情况下培养23–1–8个单独表达EGFP(载体)、FLAG标记的IAN4或FLAG标记IAN5的T细胞36小时。细胞裂解物为带有抗FLAG M2抗体的IP和带有抗Bax抗体的IB。(E) 由23–1–8个T细胞制备的核和重膜部分在含有1%CHAPS的缓冲液中进行裂解。裂解产物为具有正常兔IgG或抗IAN4抗体的IP和具有抗Bcl-2抗体的IB。平均值和标准误差(n个使用NIH Image软件分析了=4)条带的相对强度。* 第页< 0.05;** 第页< 0.01.
图7
图7。23–1–8 T淋巴细胞中IAN5的敲除
(A) 对表达shRNAs的23–1–8个T淋巴细胞克隆进行分析IAN5公司mRNA表达,并在有或无IL-2的情况下培养。细胞活性通过PI染色和流式细胞仪分析进行量化。(B和C)对48小时培养中的细胞进行凋亡诱导分析。显示了Annexin-V阳性细胞(B)或线粒体膜电位(Δψm)-阴性细胞(C)的频率。(D) 23–1–8个T细胞表达shRNAsBcl-xL公司分析了IAN5公司通过定量RT-PCR和人Bcl-xL公司常规RT-PCR表达(左面板)。细胞在存在或不存在IL-2的条件下培养72小时,或在存在IL-2和5μM helenalin的条件下培育48小时,并通过PI染色定量细胞活力(右侧)。图表显示平均值±标准误差。NS,不显著(第页≥ 0.05);** 第页< 0.01.

中的注释

  • T先生的教育。
    塞德威克C。 塞德威克C。 《公共科学图书馆·生物》。2006年4月;4(4):e117。doi:10.1371/journal.pbio.0040117。Epub 2006年3月7日。 《公共科学图书馆·生物》。2006 采购管理信息:20076555 免费PMC文章。 没有可用的摘要。

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