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GSE157375系列 GSE157375的查询数据集
状态 2020年11月29日公开
标题 SATB2-LEMD2相互作用将核形状可塑性与认知相关基因的调控联系起来
有机体 小家鼠
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 SATB2编码一种核染色体支架蛋白,是一种精神分裂症风险基因,与人类智力有遗传关联。SATB2如何在分子水平上影响认知,目前尚不清楚。我们的数据表明,SATB2和内核膜蛋白LEMD2之间的相互作用协调了锥体神经元中与认知能力和精神障碍病因相关的基因表达程序。我们表明,作为a-异染色质链的候选成分,LEMD2与SATB2结合,这两种蛋白质发挥重叠的细胞功能。SATB2对神经元活动触发的核膜可塑性至关重要,这需要LEMD2以及ESCRT-III/VPS4复合物。与SATB2消融一样,皮层神经元中LEMD2的缺失会影响多个神经元活性调节基因的表达。LEMD2和SATB2调节的基因集显著重叠,LEMD2基因集富含SATB2结合基因。在人类遗传数据中,LEMD2调节的基因在自闭症、智力残疾和精神分裂症中的功能缺失突变中富集,并且与SATB2调节的基因一样,与认知功能相关。
 
总体设计 荷包牡丹碱刺激或NBQX沉默后,LEMD2缺失与干扰siRNA转染皮层神经元以及Satb2敲除与漂浮皮层培养中转录组变化的分析
 
贡献者 Feurle P公司阿本通ACera I公司沃尔N阿波斯托洛娃GDechant G公司
引文 33319920
提交日期 2020年9月2日
上次更新日期 2020年12月16日
联系人姓名 加琳娜·阿波斯托洛娃
电子邮件 Galina.Apostolova@i-med.ac.at邮箱:
组织名称 因斯布鲁克医科大学
部门 神经科学研究所
门诊化验室 Dechant实验室
街道地址 Innrain酒店66
西蒂 因斯布鲁克
省/自治区 蒂罗尔
邮政编码 6020
国家 奥地利
 
平台(2)
GPL13112型 Illumina HiSeq 2000(小家鼠)
GPL24247型 Illumina NovaSeq 6000(小家鼠)
样品(38)
GSM4763816标准 Flx1 NBQX型
GSM4763817标准 Flx1银行识别码
GSM4763818标准 cKO1 NBQX公司
关系
生物项目 PRJNA661080型
SRA公司 SRP279838号文件

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处理后的数据作为补充文件提供

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