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KRT20公司角蛋白20[智人（人类）]

基因ID:54474，更新日期2024年4月16日

总结

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官方符号
KRT20公司由提供HGNC公司
官方全名
角蛋白20由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:20412
请参阅相关
乐团：ENSG00000171431 MIM:608218； 联盟基因组：HGNC:20412
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorrhini公司；卡塔里尼；人科；人类
也称为
K20；CD20；CK20；CK-20；KRT21公司
总结
该基因编码的蛋白质是角蛋白家族的一员。角蛋白是负责上皮细胞结构完整性的中间丝蛋白，分为细胞角蛋白和毛发角蛋白。I型细胞角蛋白由酸性蛋白组成，这些酸性蛋白排列成一对异型角蛋白链。这种细胞角蛋白是成熟肠细胞和杯状细胞的主要细胞蛋白，在胃和肠粘膜中特异表达。I型细胞角蛋白基因聚集在染色体17q12-q21的一个区域。[由RefSeq提供，2008年7月]
表达式
小肠（RPKM 435.8）、结肠（RPKM405.3）和其他3种组织中的偏倚表达查看更多
直系同源
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基因组背景

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位置：
17季度21.2
外显子计数：
8
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 17 NC_000017.11（40875889..40885242，补码）
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 17 NC_060941.1（41740198..41749557，补码）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 17 NC_000017.10（39032141..39041494，补码）

17号染色体-NC_000017.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr17:38975907-38977106 Neighboring gene KRT10 antisense RNA 1 Neighboring gene CDK7 strongly-dependent group 2 enhancer GRCh37_chr17:38983418-38984617 Neighboring gene keratin 10 Neighboring gene uncharacterized LOC105371777 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 3631 Neighboring gene keratin 12 Neighboring gene uncharacterized LOC107985072 Neighboring gene keratin 23 Neighboring gene CDK7 strongly-dependent group 2 enhancer GRCh37_chr17:39109689-39110888 Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr17:39112787-39113986 Neighboring gene keratin 39

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：项目管理标识号24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 确定KRT20是头颈鳞癌淋巴转移的潜在关键基因。 张义夫，等Technol癌症研究治疗，2022年1月-12月，PMID 35815926，免费PMC文章
  2. 细胞角蛋白20染色在默克尔细胞癌中的临床意义。 坂田Y，等《药物发现疗法》，2021年。PMID 34234066号
  3. 膀胱原位尿路上皮癌：CK20表达与适应性免疫抵抗、卡介苗治疗反应和临床结果的相关性。 伦巴多KA，等《应用免疫组织化学分子形态》，2021年2月1日。PMID 32858539，免费PMC文章
  4. 大切片细胞角蛋白20在检测中低位直肠癌患者肠壁浸润和系膜转移中的作用。 掸KS，等《癌症研究与治疗杂志》，2019年。项目管理标识号30964123
  5. 外周血和淋巴结中细胞角蛋白20 mRNA的异常表达表明胃癌患者存在微转移和预后不良。 你X，等Technol癌症研究治疗，2019年1月1日。PMID 30827194，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（116）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
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  7. 监督机器学习算法将KRT20、BATF和TP63确定为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者膀胱活检标本的生物相关标记物。
    标题：监督机器学习算法将KRT20、BATF和TP63确定为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者膀胱活检标本的生物相关生物标志物。
  8. 生物标记物CDX2、CK20、CK7在学龄期胃炎患儿中对胃癌家族易感性的认识。
    标题：生物标记物CDX2、CK20、CK7在学龄儿童胃炎中对胃癌家族易感性的认识。
  9. CK7、CK20、CDX2在肠型和胰胆管癌中的差异表达。
    标题：CK7、CK20、CDX2在肠和胰胆管癌前病变中的差异表达。
  10. 细胞角蛋白20染色在默克尔细胞癌中的临床意义。
    标题：细胞角蛋白20染色模式在默克尔细胞癌中的临床意义。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GeneRIF（94）

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

EBI GWAS目录

描述
韩国人群中影响身高的15个基因座的鉴定。
EBI GWAS目录

变更

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参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC35423型

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
使细胞骨架的结构成分成为可能 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与凋亡过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞对饥饿的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与上皮细胞分化 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
涉及中间纤维组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
涉及中间纤维组织 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白质分泌调节 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
细胞骨架中的活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于胞浆中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
定位于胞浆中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
位于中间灯丝中 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
 公共医学 
定位于中间丝细胞骨架 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
角蛋白，I型细胞骨架20
姓名
细胞角蛋白20
角蛋白20，I型
蛋白质IT

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_012286.1参考序列基因

    范围
    4986..14339
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. NM_019010.3号→NP_061883.1号角蛋白，I型细胞骨架20前体

    参见NP_061883.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    源序列
    BC031559、DA426874、DB242980
    共识CDS
    CCDS11379.1号文件
    UniProtKB/瑞士Prot
    B2R6W7型,第35900页
    相关的
    ENSP0000167588.3标准,恩斯特00000167588.4
    保守领域（1）总结
    pfam00038型
    位置：69→380
    长丝；中间丝蛋白

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000017.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    40875889.40885242补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

参考GRCh38.p14 ALT_REF_LOCI_1

基因组学

  1. NW_003871091.1参考GRCh38.p14 ALT_REF_LOCI_1

    范围
    25157.34510补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060941.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    41740198..41749557补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第3590.1页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P35900

基因链接输出

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