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YBX1型Y盒结合蛋白1[智人（人类）]

基因ID:4904，更新日期2024年4月11日

总结

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官方符号
YBX1型由提供HGNC公司
官方全名
Y盒结合蛋白1由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:8014
请参阅相关
乐团：ENSG0000065978 MIM:154030； 联盟基因组：HGNC:8014
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
也称为
YB1；BP-8；CSDB；DBPB；YB-1；CBF-A；CSDA2；EFI-A；NSEP1；NSEP-1；MDR-NF1型
总结
该基因编码一种高度保守的冷休克域蛋白，具有广泛的核酸结合特性。编码的蛋白质兼具DNA和RNA结合蛋白的功能，并参与许多细胞过程，包括转录和翻译调节、前mRNA剪接、DNA修复和mRNA包装。该蛋白也是信使核糖核蛋白（mRNP）复合物的组成部分，可能在微RNA加工中发挥作用。这种蛋白可以通过非经典途径分泌，并作为细胞外有丝分裂原发挥作用。该基因的异常表达与许多组织中的癌症增殖有关。该基因可能是某些癌症预后不良和耐药性的预后标志。交替剪接导致多个转录变体。该基因的假基因存在于多条染色体上。[由RefSeq提供，2015年9月]
表达式
睾丸（RPKM 220.6）、脂肪（RPKM121.2）和25个其他组织中普遍表达查看更多信息
直系同源
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新款
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基因组背景

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参见中的YBX1基因组数据查看器
位置：
第1页第34.2页
外显子计数：
9
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 1 NC_0000011.11（42682418..42703805）
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 1 NC_060925.1（42552913…42574300）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 1 NC_000001.10（43148089..43169476）

染色体1-NC_000001.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene coiled-coil domain containing 30 Neighboring gene uncharacterized LOC124904162 Neighboring gene RNA, U6 small nuclear 536, pseudogene Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 895 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 763 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 765 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 764 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 766 Neighboring gene peptidylprolyl isomerase H Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr1:43207264-43207866 Neighboring gene MPRA-validated peak195 silencer Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr1:43216651-43217315 Neighboring gene claudin 19 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 896 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 767 Neighboring gene prolyl 3-hydroxylase 1

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：项目管理标识号24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 【Y盒结合蛋白1通过肝癌细胞中细胞外信号调节蛋白激酶途径介导索拉非尼耐药】。 刘涛，等.中华甘藏炳杂志，2023年4月20日。项目管理标识37248979
  2. YB1调节髓母细胞瘤的DNA损伤反应。 麦克斯温LF，等科学代表，2023年5月19日。PMID 37208357中，免费PMC文章
  3. YBX1整合致癌PI3K/mTOR信号调节恶性上皮细胞的适应性。 白Y，等《国家通讯》，2023年3月22日。PMID 36949044，免费PMC文章
  4. [人Y-box结合蛋白1（YB-1）的真核表达促进人HepG2细胞的增殖和迁移]。 史Y，等.西宝玉芬子棉衣学杂志，2022年11月PMID 36328428
  5. ABL激酶通过Y-box-binding蛋白1调节HER2+细胞的翻译，促进大脑定植。 麦凯南CM，等细胞代表，2022年8月30日。PMID 36044842，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（651）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. RNAm[5]C修饰以依赖于YBX1相分离的方式上调E2F1的表达，并促进卵巢癌的肿瘤进展。
    标题：RNA m（5）C修饰以依赖YBX1相分离的方式上调E2F1的表达，并促进卵巢癌的肿瘤进展。
  2. 男性和女性实体瘤中YBX1的总体生存率的电子分析。
    标题：男性和女性实体肿瘤中YBX1总生存率的电子分析。
  3. YBX-1减轻脓毒症刺激的肺上皮细胞损伤。
    标题：YBX-1减轻脓毒症刺激的肺上皮细胞损伤。
  4. 无嘌呤/无嘧啶内切脱氧核糖核酸酶1（APE1）通过YBX1磷酸化促进卵巢癌中应激颗粒的形成。
    标题：无嘌呤/无嘧啶内切脱氧核糖核酸酶1（APE1）通过YBX1磷酸化促进卵巢癌中应激颗粒的形成。
  5. 细胞外小泡中的Y-box结合蛋白1减少间充质干细胞向成骨细胞的分化，这对急性髓性白血病的影响。
    标题：小细胞外囊泡中的Y-box结合蛋白1减少间充质干细胞向成骨细胞的分化——对急性髓性白血病的影响。
  6. 电离辐射刺激下YBX1相分离成应力颗粒。
    标题：YBX1在电离辐射刺激下相分离成应力颗粒。
  7. Hsa_circ_0007990通过抑制YBX1蛋白降解激活E2F1转录促进乳腺癌生长。
    标题：Hsa_circ_0007990通过抑制YBX1蛋白降解激活E2F1转录促进乳腺癌生长。
  8. RBM10通过调节PPM1B和YBX1活性调节人类癌细胞的致瘤潜能。
    标题：RBM10通过调节PPM1B和YBX1的活性来调节人类癌细胞的致瘤潜能。
  9. LINC00665通过与YBX1结合激活Wnt3a/β-catenin信号，促进胃癌的增殖和转移。
    标题：LINC00665通过与YBX1结合激活Wnt3a/β-catenin信号，促进胃癌增殖和转移。
  10. USP47稳定YBX1以促进急性髓细胞白血病的进展。
    标题：USP47稳定YBX1以促进急性髓细胞白血病的进展。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（372）

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

变更

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参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

HIV-1相互作用

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复制交互

互动 酒吧
siRNA敲除YBX1增强HIV-1复制；EZR限制HIV-1复制 公共医学
siRNA敲低Y盒结合蛋白1（YBX1）抑制感染VSV-G假型HIV-1的293T细胞中HIV-1复制的早期阶段 公共医学

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的Y盒结合蛋白1（YBX1）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
Gag-Pol公司 gag-pol公司 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的Y盒结合蛋白1（YBX1）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
奈夫 nef（奈夫） 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的Y盒结合蛋白1（YBX1）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
Pr55（间隙） 堵住 串联亲和纯化和质谱分析鉴定从HIV-1表达细胞分离的staufen1 RNP复合物中并入的Y盒结合蛋白1（YBX1）、HIV-1 Gag、Gag/Pol、gp120和Nef 公共医学
Tat公司 塔特 YB-1与HIV-1 Tat相互作用并增强Tat诱导的HIV-1 LTR启动子激活 公共医学
塔特 YB-1与HIV-1 Tat的结合通过Tat的C末端区域（氨基酸48-72）和YB-1的氨基酸75-203介导 公共医学
矩阵 堵住 HIV-1 MA与YBX1相互作用 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC104858、MGC110976、MGC117250

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
启用含C5-甲基胞苷的RNA阅读器活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
启用DNA绑定 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 公共医学 
启用GTPase绑定 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
启用RNA结合 HDA公司 公共医学 
启用RNA结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
启用染色质结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
支持双链DNA结合 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 公共医学 
启用mRNA结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用miRNA结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
使核酸结合 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
实现序列特异性双链DNA结合 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
支持单链DNA结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
参与CRD介导的mRNA稳定 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与CRD介导的mRNA稳定 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与RNA剪接 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与RNA转运 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
白细胞介素-7参与细胞反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与胚胎形态发生 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与表皮发育 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与子宫胚胎发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与mRNA加工 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与mRNA稳定 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与miRNA转运 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞衰老的负调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与核转录mRNA分解代谢过程的负调控，二烯基化依赖性衰变 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与横纹肌细胞分化的负调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与RNA聚合酶II对转录的负调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
翻译中的负调节 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与细胞分裂的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞质翻译的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白在细胞质应激颗粒中的定位 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与DNA模板转录的调节 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与基因表达调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与tRNA转运 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
CRD介导的信使核糖核酸稳定复合物的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
CRD介导的信使核糖核酸稳定复合物的一部分 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
位于P型车身中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
U12型剪接体复合体的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于细胞质应激颗粒 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于胞浆中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于胞浆中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
定位内质网 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
定位于胞外外体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于细胞外区域 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
组蛋白前mRNA 3’末端处理复合物的一部分 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
定位于细胞内膜结合细胞器 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
核糖核蛋白复合物部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于突触 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
Y盒结合蛋白1
姓名
CCAAT结合转录因子I亚单位A
DNA-结合蛋白B
Y盒转录因子
增强因子I亚单位A
主要组织相容性复合体，II类，Y盒结合蛋白I
核酸酶敏感元件结合蛋白1

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_004559.5号→NP_004550.2号Y盒结合蛋白1

    参见NP_004550.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    描述
    转录变体：该变体（1）代表较长的转录并编码功能蛋白。
    源序列
    AC098484、BC090038、CN353145
    共识CDS
    标准立方英尺470.1
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第16990页,第16991页,第67809页,问题14972,问题15325,Q5FVF0型
    相关的
    ENSP0000361626.3标准,ENST00000321358.12标准
    保守领域（1）总结
    pfam00313型
    位置：59→128
    CSD；'冷休克DNA结合域

核糖核酸

  1. 132737.2尼泊尔卢比RNA序列

    状态：已审阅

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（2）包含一个替代的5'外显子，缺少一个内部外显子。由于预测的蛋白质不符合RefSeq质量标准，因此该变体表示为非编码。
    源序列
    电话：098484，电话：013838

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000001.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    42682418..42703805
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_047421495.1号→XP_047277451.1号Y盒结合蛋白1亚型X1

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060925.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    42552913..42574300
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_054336798.1号→XP_054192773.1号Y盒结合蛋白1亚型X1

核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第67809.3页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P67809

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学品信息
分子生物学数据库
研究材料
工具
其他