ITGAM整合素亚基αM[智人（人类）]-基因-NCBI

总结

官方符号: ITGAM公司由提供HGNC公司
官方全名: 整合素亚基αM由提供HGNC公司
主要来源: HGNC:HGNC:6149
请参阅相关: 乐团：ENSG00000169896 MIM:120980；联盟基因组：HGNC:6149
基因类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 检验过的
有机体: 智人
血统: 真核生物；后生动物；脊索动物；颅亚目；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
也称为: CR3A；MO1A；CD11B；MAC-1；MAC1A；SLEB6系列
总结: 该基因编码整合素αM链。整合素是由α链和β链组成的异二聚体整膜蛋白。这种含I结构域的α整合素与β2链（ITGB2）结合形成一种白细胞特异性整合素，称为巨噬细胞受体1（“Mac-1”）或失活的C3b（iC3b）受体3（“CR3”）。αMβ2整合素在中性粒细胞和单核细胞与受刺激内皮细胞的粘附以及补体包被颗粒的吞噬作用中起重要作用。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供，2009年3月]
表达式: 骨髓（RPKM 72.3）、阑尾（RPKM14.6）和6个其他组织中的偏倚表达查看更多
直系同源: 鼠标全部的
新款: 尝试新的基因表
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基因组背景

位置：: 16页第11.2页

外显子计数：: 31

注释发布	状态	装配	Chr公司	位置
2003年10月10日	现在的	GRCh38.p14型(GCF_000001405.40)	16	NC_000016.10（31259975..31332877）
2003年10月10日	现在的	T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号)	16	NC_060940.1（31647380..31720298）
105.20220307	上一个程序集	GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25)	16	NC_000016.9（31271296..31344198）

染色体16-NC_000016.10 描述邻近基因的基因组背景

基因组区域、转录物和产物

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基因组序列：

转到核苷酸： 绘图美国金融服务贸易协会 GenBank（基因银行）

表达式

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查看详细信息

项目名称：HPA RNA-seq正常组织
描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
生物项目：项目编号：4337
出版物：项目管理标识号24309898
分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

系统性红斑狼疮ITGAM rs1143679变异与血清钙化倾向增加相关。哈尔丰M，等《基因》（巴塞尔），2023年5月18日。PMID 37239465，免费PMC文章
补体受体3通过完整的子宫颈上皮细胞屏障介导HIV-1细胞转染：对女性HIV传播的新认识。 CJ日，等.mBio，2022年2月22日。PMID 35012346，免费PMC文章
ITGAM基因多态性（rs7193943）和生物电阻抗分析是慢性心力衰竭恶病质的潜在预测因子。 Sobieszek G，等科学代表，2021年10月11日。PMID 34635743，免费PMC文章
单核细胞迁移标记物CD11b与HIV感染者肺功能的相关性。 Kuniholm MH公司，等《获得性免疫缺陷综合征杂志》，2021年3月1日。PMID 33148999，免费PMC文章
中国rs1143679多态性系统性红斑狼疮患者的临床特征和I型干扰素诱导基因表达：一项单中心回顾性研究。徐伟，等《临床风湿病》，2021年3月，PMID 32785810

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GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？

ITGAM介导的巨噬细胞参与糖尿病肾病和动脉粥样硬化的基底膜损伤。
标题：ITGAM介导的巨噬细胞参与糖尿病肾病和动脉粥样硬化的基底膜损伤。
高血压患者外周血单核细胞上toll样受体4和CD11b/CD18表达降低与内皮损伤程度较小相关：一项初步研究。
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CD11b通过调节巨噬细胞浸润和极化介导高血压心脏重塑。
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免疫抑制分子PD-1同源物（VISTA）在黑色素瘤中与CD11b髓样细胞结肠癌，与不良预后相关。
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NFIL3通过促进川崎病患者ITGAM转录而加重人冠状动脉内皮细胞损伤。
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氨肽酶N/CD13交联促进整合素CD11b/CD18的活化和膜表达。
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Siglec-15的结构见解揭示了其通过整合素CD11b与T细胞相互作用的糖基化依赖性。
标题：Siglec-15的结构见解揭示了其通过整合素CD11b与T细胞相互作用的糖基化依赖性。
CD11b激动剂对STING干扰素信号的上下文依赖性激活可增强抗肿瘤免疫。
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系统性红斑狼疮的ITGAM rs1143679变异与血清钙化倾向增加有关。
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CD47与整合素Mac-1的CIS结合通过稳定扩展的整合素构象来调节巨噬细胞的反应。
标题：CD47与整合素Mac-1的CIS关联通过稳定扩展的整合素构象调节巨噬细胞反应。

提交：新GenerRIF 更正查看所有GenerRIF（268）

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

EBI GWAS目录

描述
系统性硬化症和系统性红斑狼疮pan-meta-GWAS揭示了新的共同易感性位点。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
系统性红斑狼疮与C8orf13-BLK和ITGAM-ITGAX的相关性。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
基于抗dsDNA自身抗体产生的系统性红斑狼疮的差异遗传关联。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
6q23上TNFAIP3附近的遗传变异与系统性红斑狼疮相关。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
系统性红斑狼疮女性的全基因组关联扫描确定ITGAM、PXK、KIAA1542和其他基因座的易感性变异。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
GWAS确定了新的SLE易感基因，并解释了HLA区域的关联。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
随后进行的荟萃分析和复制发现，CDKN1B、TET3、CD80、DRAM1和ARID5B中或附近的基因座与亚洲人的系统性红斑狼疮相关。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学

变更

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基因型

HIV-1相互作用

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蛋白质相互作用

蛋白质	基因	互动	酒吧
包膜表面糖蛋白gp120	环境价值	抗CD18单克隆抗体完全阻断HIV-1感染的U-937细胞和MT-4 T细胞之间的细胞融合，表明CD18或蛋白复合物CD11a-c/CD18除CD4外，还参与了HIV-1的感染和细胞病变作用	公共医学
奈夫	nef（奈夫）	HIV-1 Nef与补体受体3（CR3）相互作用，使CR3重新分布到巨噬细胞中细菌诱导的伪足	公共医学
Vpr（Vpr）	虚拟专用数据库	通过细胞培养中的氨基酸进行稳定同位素标记，结合基于质谱的蛋白质组学，确定HIV-1 Vpr在Vpr转导的巨噬细胞中上调整合素αM（ITGAM，CR3A）表达	公共医学
矩阵	堵住	HIV-1 MA与β2整合素、αM和αX整合素共同定位于细胞内厚厚的电子致密膜室中，其中包含连接整合素复合物和肌动蛋白细胞骨架的塔利班、小病毒素和帕西林	公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

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互动

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产品	交互作用者	其他基因	复杂	来源	酒吧	描述

一般基因信息

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标记

RH79892（e-PCR）
- 大学：89004

D16S753（e-PCR），检测多态性
- 大学：26598

GDB:180920（电子PCR）
- 大学：155125

同源性

NCBI正交测井

OrthoDB的Orthologs

克隆名称

MGC117044型

基因本体论 GOA提供

功能	证据代码	酒吧
启用淀粉样β结合	集成电路馆长推断更多信息
对货物受体活性的贡献	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
启用货物受体活动	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
启用补码组件C3b绑定	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
使热休克蛋白结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使整合素结合	IBA公司从祖先的生物学角度推断更多信息
使整合素结合	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
启用金属离子绑定	国际能源署从电子注释推断更多信息
实现蛋白质结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学

过程	证据代码	酒吧
淀粉样β清除相关蛋白	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与细胞粘附	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学
整合素介导的参与细胞粘附	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与细胞间粘附	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
通过质膜粘附分子参与细胞间粘附	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
参与细胞基质粘附	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与补体受体介导的信号通路	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与补体介导突触剪除	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与外胚层细胞分化	IEP公司从表达式模式推断更多信息	公共医学
参与前脑发育	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与异型细胞-细胞粘附	国际能源署从电子注释推断更多信息
参与先天性免疫反应	国际能源署从电子注释推断更多信息
参与整合素介导的信号通路	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与小胶质细胞活化	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与多巴胺代谢过程的负调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与吞噬、吞噬	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与小胶质细胞介导的细胞毒性正调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与中性粒细胞脱颗粒的正调控	IGI公司从遗传相互作用推断更多信息	公共医学
参与前列腺素E合成酶活性的正调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与靶向膜蛋白的正调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与超氧化物阴离子生成的正调控	IGI公司从遗传相互作用推断更多信息	公共医学
参与超氧阴离子生成的正调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
受累受体介导的内吞作用	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
涉及对革兰氏阳性菌的反应	国际能源署从电子注释推断更多信息
姜黄素参与反应	国际能源署从电子注释推断更多信息
与雌二醇反应有关	国际能源署从电子注释推断更多信息
参与缺血反应	国际能源署从电子注释推断更多信息
参与对机械刺激的反应	国际能源署从电子注释推断更多信息
脊椎动物眼睛特有的图案	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息

组件	证据代码	酒吧
位于单元格表面	HDA公司更多信息	公共医学
位于单元格表面	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
在质膜的外侧是活性的	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于质膜外侧	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
定位于胞外外体	HDA公司更多信息	公共医学
位于细胞外间隙	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
整合素αM-β2复合物的一部分	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
整合素复合物部分	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
定位于质膜	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
定位于质膜	TAS公司可追溯作者声明更多信息
定位于血浆膜筏	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
定位颗粒膜	TAS公司可追溯作者声明更多信息
定位于三级颗粒膜	TAS公司可追踪作者声明更多信息

一般蛋白质信息

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首选名称: 整合素α-M

姓名: CD11抗原样家族成员B; CR-3α链; 抗原CD11b（p170）; 细胞表面糖蛋白MAC-1亚单位α; 补体成分3受体3亚单位; 整合素，αM（补体成分3受体3亚单位）; 白细胞粘附受体MO1; 巨噬细胞抗原α多肽; 巨噬细胞1抗原α亚单位; 中性粒细胞粘附受体α-M亚单位

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

NG_011719.1参考序列基因

范围

5009..77911

下载

GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）,轻轨_1333

mRNA和蛋白质

NM_000632.4号→NP_000623.2号整合素α-M亚型2前体

参见NP_000623.2的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（2）在中心编码区域使用了一个备用的帧内拼接位点。与同种型1相比，得到的同种型（2）缺少一个内部氨基酸。

源序列

AA436312、AC093520、AK057856、BC096348

共识CDS

CCDS45470.1型

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第1215页,Q4VAK0号机组,Q4VAK1号机组,Q4VAK2号机组

相关的

ENSP0000441691.3标准,ENST00000544665.9号

保守领域（4）总结

智能00191
位置：516→562

Int_alpha；整合素α（β-螺旋桨重复）

cd01469
位置：149→324

vWA_integrins_alpha_subunit；整合素是一类粘附受体，将细胞外基质连接到细胞骨架，并与生长因子受体合作，促进细胞生存、细胞周期进展和细胞迁移。整合素由α和β组成。。。

pfam00357型
位置：1129→1143

整合素α；整合素α细胞质区

pfam08441型
位置：614→978

整合素_α2；整合素α
NM_001145808.2号→NP_001139280.1整合素α-M亚型1前体

参见NP_001139280.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的亚型（1）。

源序列

AC093520、BC096348、BM194233、J03925

共识CDS

CCDS54004.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第1215页

相关的

ENSP0000496959.1标准,ENST00000648685.1号

保守领域（4）总结

智能00191
位置：517→563

Int_alpha；整合素α（β-螺旋桨重复）

cd01469
位置：149→324

vWA_integrins_alpha_subunit；整合素是一类粘附受体，将细胞外基质连接到细胞骨架，并与生长因子受体合作，促进细胞生存、细胞周期进展和细胞迁移。整合素由α和β组成。。。

辉瑞00357
位置：1130→1144

整合素_α；整合素α细胞质区

pfam08441型
位置：615→979

整合素α2；整合素α

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

NC_000016.10参考GRCh38.p14初级组件

范围

31259975..31332877

下载

GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

XM_017023216.2→XP_016878705.1号整合素α-M亚型X2
XM_011545851.3号→XP_011544153.1号整合素α-M亚型X3

保守领域（2）总结

智能00191
位置：517→563

Int_alpha；整合素α（β-螺旋桨重复）

cd01469
位置：149→324

vWA_整合素α亚单位；整合素是一类粘附受体，将细胞外基质连接到细胞骨架，并与生长因子受体合作，促进细胞生存、细胞周期进展和细胞迁移。整合素由α和β组成。。。
XM_006721045.1号→XP_006721108.1号整合素α-M亚型X4

保守领域（2）总结

智能00191
位置：516→562

Int_alpha；整合素α（β-螺旋桨重复）

cd01469
位置：149→324

vWA_integrins_alpha_subunit；整合素是一类粘附受体，将细胞外基质连接到细胞骨架，并与生长因子受体合作，促进细胞生存、细胞周期进展和细胞迁移。整合素由α和β组成。。。
XM_011545850.3号→XP_011544152.1号整合素α-M亚型X1

保守领域（4）总结

智能00191
位置：455→501

Int_alpha；整合素α（β-螺旋桨重复）

cd01469
位置：87→262

vWA_整合素α亚单位；整合素是一类粘附受体，将细胞外基质连接到细胞骨架，并与生长因子受体合作，促进细胞生存、细胞周期进展和细胞迁移。整合素由α和β组成。。。

pfam00357型
位置：1068→1082

整合素_α；整合素α细胞质区

pfam08441型
位置：553→917

整合素_α2；整合素α