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HMOX1型血红素加氧酶1[智人(人类)]

基因ID:3162,更新日期2024年4月16日

总结

官方符号
HMOX1型由提供HGNC公司
官方全名
血红素加氧酶1由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:5013
请参阅相关
乐团:ENSG00000100292 MIM:141250; 联盟基因组:HGNC:5013
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡他病;人科;人类
也称为
HO-1;HSP32;HMOX1D;bK286B10型
总结
血红素加氧酶是血红素分解代谢中的一种必需酶,它分解血红素形成胆绿素,胆绿素随后被胆绿素还原酶和一氧化碳(一种假定的神经递质)转化为胆红素。血红素加氧酶活性由其底物血红素和各种非血红素物质诱导。血红素加氧酶以2种同工酶形式存在,一种是诱导型血红素氧化酶-1,另一种是组成型血红素加氧酶-2。HMOX1和HMOX2属于血红素加氧酶家族。[由RefSeq提供,2008年7月]
表达式
在脾脏(RPKM 208.2)、卵巢(RPKM68.8)和17个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

位置:
22季度12.3
外显子计数:
5
注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 22 NC_000022.11(35381096..35394207)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 22 NC_060946.1(35839114..35852226)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 22 NC_000022.10(35777089..35790200)

染色体22-NC_000022.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene target of myb1 membrane trafficking protein Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35732808-35733717 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35745310-35745842 Neighboring gene microRNA 3909 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35745843-35746375 Neighboring gene microRNA 6069 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13654 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35746966-35747474 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35748292-35749167 Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr22:35772530-35773729 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13655 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13656 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18904 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18905 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18906 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18907 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18908 Neighboring gene minichromosome maintenance complex component 5 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35821835-35822340 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35822341-35822848 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr22:35822849-35823354 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35831135-35831636 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 18909 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35844065-35845031 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:35845032-35845997 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr22:35874918-35875095 Neighboring gene tRNA methyltransferase subunit 11-2 pseudogene 8

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:项目管理标识号24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

PubMed上的相关文章

GeneRIFs:功能中的基因参考

什么是GeneRIF?

表型

相关条件

描述 测验
COPD,严重早发
MedGen公司:1847014年 OMIM公司:606963 基因审查:无法使用的
比较实验室
血红素加氧酶1缺乏
MedGen公司:1841651元 OMIM公司:614034 基因审查:无法使用的
比较实验室

EBI GWAS目录

描述
在西班牙裔人群中确定了儿童肥胖病理生理学的新基因位点。

HIV-1相互作用

复制交互

互动 酒吧
HIV-1(BAL-1、Jago、SF162、YU2、ADA、89.6、Doge、JR-CSF、BL-3、JRFL和HIV-2 TYBE)复制降低了单核细胞衍生巨噬细胞中HMOX1的表达;复制程度似乎与HMOX1缺乏程度成正比 公共医学

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 HIV-1 gp120显著上调人类星形胶质细胞中的Nrf2,并与关键抗氧化防御酶血氧合酶(HO-1)和NAD(P)H脱氢酶醌1(Nqo1)水平升高有关 公共医学
奈夫 nef(奈夫) HMOX1 mRNA选择性地保留在HIV-1 Nef表达的细胞外泌体中,靶向HMOX1mRNA的五种miRNAs(miR-15b、miR-26b*、miR-125b、let-7a和let-7e*)选择性地分泌在这些细胞的外泌体内 公共医学
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat上调SH-SY5Y细胞中NQO1、CAT、SOD1、SOD2和HMOX1(HO1)mRNA水平 公共医学
塔特 HO-1调节雷公藤红素对HIV-1Tat诱导的人脑星形胶质瘤细胞ICAM-1和VCAM-1上调以及CXCL10、IL-8和MCP-1释放的抑制作用 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

相互作用

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 GOA提供

过程 证据代码 酒吧
参与血管生成 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与细胞对含砷物质的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞对镉离子的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与顺铂的细胞反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞对热的反应 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞缺氧反应 IEP公司
从表达式模式推断
更多信息
公共医学 
参与内皮细胞增殖 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与上皮细胞凋亡过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与红细胞稳态 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与血红素分解代谢过程 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与血红素分解代谢过程 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与血红素氧化 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与血红素氧化 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞内铁离子稳态 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞内铁离子稳态 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞内信号转导 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与低密度脂蛋白颗粒清除 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与宏观自噬 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与多细胞生物水平铁离子稳态 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
通过死亡域受体参与外源性凋亡信号通路的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与白细胞迁移的负调控 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与宏观自噬的负调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与平滑肌细胞增殖的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与血管生成的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
血管内皮细胞增殖的正调控参与新生血管生成 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与典型NF-kappaB信号转导的正调控 HMP公司 公共医学 
参与细胞迁移的正调控参与新生血管生成 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与趋化因子产生的正调控 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与上皮细胞凋亡过程的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与宏观自噬的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与平滑肌细胞增殖的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与血管生成的调节 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
RNA聚合酶II参与转录调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
与过氧化氢反应有关 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
对尼古丁有反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与氧化应激反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与氧化应激反应 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
涉及平滑肌增生 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
创伤愈合参与炎症反应 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
组件 证据代码 酒吧
定位于胞浆中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
定位内质网 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位内质网 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
定位内质网膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于内质网膜中 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
定位内质网膜 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
位于细胞外间隙 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
定位膜 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
位于线粒体外膜 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
位于核内 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
位于细胞质核周区 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
血红素加氧酶1
姓名
热休克蛋白,32-kD
血红素加氧酶(脱环)1
NP_002124.1号

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_023030.1参考序列基因

    范围
    5030..18141
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. NM_002133.3号NP_002124.1号血红素加氧酶1

    参见NP_002124.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    源序列
    BP288767、CA306357、X06985
    共识CDS
    邮编:13914.1
    UniProtKB/瑞士Prot
    P09601号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B2R7U4型,2009年2月,Q6FH11型,Q96DI8问题
    相关的
    ENSP00000216117.8号文件,ENST00000216117.9号
    保守领域(2)总结
    cd00232号
    位置:127154
    类HemeO;扭结螺旋[结构图案]
    pfam01126型
    位置:11216
    血红素氧合酶;血红素加氧酶

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14主要组件

基因组学

  1. NC_000022.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    35381096..35394207
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备用T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060946.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    35839114..35852226
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)