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Y盒结合蛋白1亚型X1[弗朗索瓦氏沙棘]

蛋白质分类

冷休克域蛋白(域体系结构ID 10448154)

含有冷休克结构域的蛋白质,类似于哺乳动物的Y盒结合蛋白,是参与各种过程的DNA和RNA结合蛋白,如翻译抑制、RNA稳定、mRNA剪接、DNA修复和转录调节

CATH(有线电视系统):2.40.50.140
基因本体:转到:0003676

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姓名 加入 描述 间隔 E值
CSD公司 pfam00313型
‘冷休克’DNA结合域;
59-128 1.53e-25

‘冷休克’DNA结合域;


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Pssm-ID:278729  Cd长度:66  比特分数:96.93  E值:1.53e-25
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姓名 加入 描述 间隔 E值
CSD公司 pfam00313型
‘冷休克’DNA结合域;
59至128 1.53e-25

‘冷休克’DNA结合域;


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CSP_CDS公司 cd04458
冷休克蛋白(CSP)包含一个类似S1的冷休克结构域(CSD),在。。。
61-127 1.69e-23

冷休克蛋白(CSP)包含一个在真核生物、原核生物和古菌中发现的类S1冷休克结构域(CSD)。CSP包括细菌中的主要冷休克蛋白CspA和CspB,以及真核基因调控因子Y-box蛋白。生长温度的突然下降上调了CSP的表达。CSP也在正常条件下低水平表达。冷休克蛋白的功能尚不完全清楚。它们优先结合单链RNA和DNA的多嘧啶区域。CSP被认为结合mRNA并调节核糖体翻译、mRNA降解和转录终止速率。含有CSD的人类Y-box蛋白调节启动子中含有Y-box序列的基因的转录和翻译。CSD的这种特殊ssDNA-结合特性是Y盒蛋白与启动子Y盒序列结合所必需的,从而调节转录。


Pssm-ID:239905  Cd长度:65  比特分数:91.49  E值:1.69e-23
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CspC公司 COG1278号文件
冷休克蛋白,CspA家族【转录】;
61-126 2.50e-19

冷休克蛋白,CspA家族[转录];


Pssm-ID:440889  Cd长度:67  比特分数:80.24  E值:2.50e-19
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CSP公司 智能00357
冷休克蛋白结构域;在细菌中起RNA-衣壳酮作用的RNA-结合域。。。
61-128 3.42e-16页

冷休克蛋白结构域;在细菌中起RNA伴侣作用并参与调节真核生物翻译的RNA结合结构域。包含Rho转录终止因子中RNA结合域的亚家族。


Pssm-ID:214633[多域]Cd长度:64  比特分数:71.86  E值:3.42e-16页
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cspE公司 邮编09507
冷休克样蛋白CspE;
57-126 3.42e-15页

冷休克样蛋白CspE;


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姓名 加入 描述 间隔 E值
CSD公司 pfam00313型
‘冷休克’DNA结合域;
59-128 1.53e-25

‘冷休克’DNA结合域;


Pssm-ID:278729  Cd长度:66  比特分数:96.93  E值:1.53e-25
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CSP_CDS公司 cd04458
冷休克蛋白(CSP)包含一个类似S1的冷休克结构域(CSD),在。。。
61-127 1.69e-23

冷休克蛋白(CSP)包含一个在真核生物、原核生物和古菌中发现的类S1冷休克结构域(CSD)。CSP包括细菌中主要的冷休克蛋白CspA和CspB以及真核基因调节因子Y-box蛋白。生长温度的突然下降上调了CSP的表达。CSP也在正常条件下低水平表达。冷休克蛋白的功能尚不完全清楚。它们优先结合单链RNA和DNA的多嘧啶区。CSP被认为结合mRNA并调节核糖体翻译、mRNA降解和转录终止速率。含有CSD的人类Y-box蛋白调节启动子中含有Y-box序列的基因的转录和翻译。CSD的这种特殊ssDNA-结合特性是Y盒蛋白与启动子Y盒序列结合所必需的,从而调节转录。


Pssm-ID:239905  Cd长度:65比特分数:91.49  E值:1.69e-23
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抄送:cd04458   GTVKWF公司DDEK公司G公司F类GFI公司TPD公司D类GG公司EDVFVH公司A类LEGDG公司----F类RS系列G公司博士VEF公司电气工程师D类公斤性能确认A类V(V)无电压RL公司 65
CspC公司 COG1278号文件
冷休克蛋白,CspA家族【转录】;
61-126 2.50e-19

冷休克蛋白,CspA家族【转录】;


Pssm-ID:440889  Cd长度:67  比特分数:80.24E值:2.50e-19
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CSP公司 智能00357
冷休克蛋白结构域;在细菌中起RNA-衣壳酮作用的RNA-结合域。。。
61-128 3.42e-16页

冷休克蛋白结构域;RNA-结合域,在细菌中起到RNA-受体的作用,并参与调节真核生物的翻译。包含Rho转录终止因子中RNA结合域的亚家族。


Pssm-ID:214633[多域]Cd长度:64  比特分数:71.86  E值:3.42e-16页
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cspE公司 PRK09507号
冷休克样蛋白CspE;
57-126 3.42e-15页

冷休克样蛋白CspE;


Pssm-ID:169931  Cd长度:69  比特分数:69.30  E值:3.42e-15页
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PRK09890号 PRK09890号
冷休克蛋白CspG;临时的
55至125 1.93e-14号机组

冷休克蛋白CspG;临时的


Pssm-ID:77467  Cd长度:70  比特分数:67.10  E值:1.93e-14号机组
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邮编10354 PRK10354型
RNA伴侣/抗终止剂CspA;
55-126 2014年7月27日

RNA伴侣/抗终止剂CspA;


Pssm-ID:182402  Cd长度:70  比特分数:65.77E值:2014年7月27日
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抄送:PRK10354  1味精K(K)机器翻译G公司VKWFN公司ADK公司G公司F类GFI公司TPD公司D类葛兰素史克DVFVH电视可行性研究人工智能QNDG公司----YK公司S公司本地设计院G公司QK公司V(V)S公司F类领带G公司A类公斤巴基斯坦A类G公司NVT公司 68
2009年3月 PRK10943型
冷休克样蛋白CspC;临时的
58-126 1.71e-11页

冷休克样蛋白CspC;临时的


Pssm-ID:170841个Cd长度:69  比特分数:58.93  E值:1.71e-11页
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吉1825867674 58K(K)VL公司G公司T型VKWFN虚拟现实网络G公司GFI公司尼泊尔卢比D类TKE公司DVFVH电视QT公司人工智能KK公司N个N个prky公司LRSVGD公司G公司电子技师VEF公司DVVE公司G公司E类公斤不良事件A类A类NVT公司 126
抄送:PRK10943  K(K)IK(IK)G公司VKWFN公司ESK公司G公司F类GFI公司每年生产能力D类葛兰素史克DVFVH电视可行性研究人工智能QG公司N个G公司----FKTLAE公司G公司QN(质量)VEF公司环境影响质量指标G公司公斤巴基斯坦A类V(V)NVT公司 67
PRK09937号 PRK09937号
冷休克样蛋白CspD;
61-134 5.83e-09

冷休克样蛋白CspD;


Pssm-ID:77494个Cd长度:74  比特分数:52.04  E值:5.83e-09
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吉1825867674 61GTVKWFN公司虚拟现实网络G公司GFI公司NRNDTK公司经修订的V(V)F类V(V)H(H)QTA公司KKNN公司prky公司L(左)SVGD公司G公司电子技师V(V)E类FDV公司价值工程G公司E类公斤不良事件A类ANV公司tgpgg公司虚拟专用车 134
抄送:PRK09937  4GTVKWFN公司NAK公司G公司F类GFI公司中国石油天然气集团公司经修订的F类A类H(H)YST系统QMDG公司----TLKA公司G公司质量体系V(V)FDV公司总部G公司P(P)公斤全日空航空公司A类SVI公司-----虚拟专用车E类 68
PRK14998型 PRK14998型
冷休克样蛋白CspD;临时的
60-139 8.89e-08

冷休克样蛋白CspD;临时的


Pssm-ID:184960  Cd长度:73  比特分数:48.89  E值:8.89e-08
10 20 30 40 50 60 70 80
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吉1825867674 60L(左)GTVKWFN公司虚拟现实网络G公司GFI公司NRNDTK公司经修订的V(V)F类V(V)H(H)QTA公司KKNN公司prky公司L(左)SVGD公司G公司电子技师V(V)E类FDV公司价值工程G公司E类公斤不良事件A类ANV公司tgpgg公司副总裁VQGSKY公司A类 139
抄送:PRK14998  T型GTVKWFN公司纳克G公司F类GFI公司中国石油天然气集团公司经修订的F类A类H(H)YST系统QMDG公司----TLKA公司G公司质量体系V(V)FDV公司总部G公司P(P)公斤全日空航空公司A类SVI公司-----副总裁IEAEAV公司A类 73
PRK15463型 PRK15463型
冷休克样蛋白CspF;临时的
55-125 6.49至06

冷休克样蛋白CspF;临时的


Pssm-ID:185360  Cd长度:70  比特分数:43.35  E值:6.49至06
10        20        30        40        50        60        70
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吉1825867674 55进气温度(IAT)K(K)VL公司G公司T型VK公司W公司F类NVRN公司G公司G公司F类尼泊尔卢比D类TKE公司数码摄像F类VH公司QT公司A类IKKNNPR公司基尔SVGD公司G公司电子技师VEF公司DVVE公司G公司EK公司G公司不良事件AANV公司 125
合同编号:PRK15463  1汽水分离再热器K(K)机器翻译G公司VK公司T型F类DGKS公司G公司K(K)G公司L(左)测试程序集D类GRK公司数码摄像VH公司A类LNLRDAE公司----ELTT公司G公司左后VEF公司CRIN公司G公司左后G公司PT公司AANV公司 67
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CD搜索/cdd低复杂度过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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