1千卡,1B72型,1FJL公司,1BW5型,1磅72,1NK2号机组,1华侨城,1CQT公司,2个LFB


保守蛋白结构域家族
同源结构域

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cd00086:同源结构域
单击图像以查看Cn3D的交互式视图
Homeodomain;参与关键真核生物发育过程转录调控的DNA结合域;可以以序列特异的方式作为单体或同源和/或异二聚体与DNA结合。
链接
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资料来源: 聪明
分类: 真核生物
公共医学: 12个链接
蛋白质: 代表
特异性蛋白质
相关蛋白质
相关结构
体系结构
超级家族: 第00084条
统计
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PSSM-Id: 238039
对齐: 317行
阈值位分数: 31.4449
创建: 2000年11月1日
更新时间: 2020年10月2日
结构
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程序:
图纸:
对齐行:
 
特定DNADNA结合
保存的站点包含6个残留物-单击图像可使用Cn3D进行交互式查看
特点1:特异性DNA碱基接触[核酸结合位点]
证据:
  • 备注:与主要和次要沟核苷酸的序列特异性相互作用
  • 备注:与小凹槽(helix1)相互作用的残基的位置在子群中移动
  • 引用:PMID 9154919
  • 结构:1AKH;材料α1
    视图结构使用Cn3D

序列对齐
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格式: 行显示: 彩色位: 类型选择:
功能1######
1AKH_B型    3P(P)Y(Y)G公司H(H)F类T型K(K)E类N个V(V)L(左)E类S公司W公司F类A类k个n个---e(电子)n个P(P)Y(Y)L(左)D类T型K(K)G公司L(左)E类N个L(左)M(M)K(K)N个T型S公司-----L(左)S公司K(K)N个W公司V(V)S公司N个K(K)E类K(K)T型T型 64 面包酵母
4138131   731K(K)K(K)T型M(M)N个D类E类V(V)M(M)L(左)E类A类L(左)L(左)d日e(电子)----第页d日M(M)N个A类A类S公司L(左)S公司W公司A类D类K(K)L(左)S公司小时d日V(V)T型P(P)S公司K(K)N个W公司L(左)N个N个K(K)A类L(左)A类T型A类 796 莲花
7510366   460P(P)K(K)P(P)K(K)S公司Y(Y)S公司K(K)F类E类D类E类T型M(M)E类K(K)A类Y(Y)M(M)第页t吨v(v)k个n个第页S公司Y(Y)E类S公司D类L(左)L(左)E类S公司S公司S公司L(左)-----M(M)S公司L(左)K(K)V(V)H(H)E类W公司F类N个N个K(K)F类V(V)D类S公司V(V)S公司 524 秀丽隐杆线虫
NP_598305号 3A类T型G公司S公司G公司P(P)T型E类D类V(V)E类L(左)E类Y(Y)N个F类N个k个v(v)-----n个K(K)H(H)P(P)D类P(P)T型T型L(左)C类L(左)A类A类E类A类G公司-----L(左)T型E类E类T型K(K)W公司F类K(K)L(左)A类E类W公司S公司E类 62 挪威鼠
AAC12733号  240E类K(K)S公司T型F类T型P(P)D类L(左)E类A类L(左)E类A类F类N个第页-----小时Y(Y)P(P)T型D类P(P)F类N个D类N个M(M)S公司N个K(K)V(V)D类-----L(左)S公司T型V(V)D类V(V)K(K)P(P)S公司S公司C类S公司T型T型S公司V(V)A类 299 佛罗里达柳杉
544148    582L(左)S公司P(P)G公司P(P)P(P)L(左)K(K)N个L(左)L(左)S公司L(左)L(左)K(K)A类Y(Y)Y(Y)A类------n个A类P(P)S公司A类E类E类L(左)S公司K(K)A类D类S公司V(V)N个-----L(左)P(P)L(左)D类V(V)V(V)K(K)K(K)W公司F类E类K(K)M(M)A类G公司S公司V(V) 640 
7503266   318E类K(K)N个W公司S公司S公司F类S公司Y(Y)D类A类H(H)F类L(左)E类E类Y(Y)k个------t吨K(K)Y(Y)S公司S公司T型D类C类K(K)S公司E类K(K)H(H)-----L(左)D类E类E类L(左)E类K(K)W公司F类A类A类T型S公司K(K)E类A类 376 秀丽隐杆线虫
O60315号机组    645M(M)T型S公司P(P)N个P(P)Y(Y)K(K)D类H(H)M(M)S公司V(V)L(左)K(K)A类Y(Y)Y(Y)A类------n个M(M)E类P(P)N个S公司D类E类L(左)L(左)K(K)S公司A类V(V)G公司-----L(左)P(P)E类F类V(V)K(K)E类W公司F类E类K(K)V(V)Y(Y)Y(Y)S公司N个S公司 703 人类
7503437   464E类K(K)T型S公司N个L(左)D类Y(Y)A类S公司L(左)E类K(K)F类A类n个------第页A类N个L(左)L(左)P(P)S公司D类L(左)V(V)D类L(左)E类K(K)T型G公司-----W公司T型L(左)D类E类S公司E类W公司F类E类T型E类K(K)L(左)E类E类 522 秀丽隐杆线虫
NP_196688号 283W公司S公司A类K(K)V(V)K(K)K(K)A类H(H)E类T型L(左)E类K(K)V(V)Y(Y)第页------K(K)P(P)T型N个A类V(V)V(V)S公司S公司V(V)V(V)T型N个-----L(左)P(P)K(K)V(V)L(左)K(K)W公司F类E类D类K(K)A类E类D类G公司V(V)P(P)D类 341 阿拉伯芥

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