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数据库SNP 短遗传变异

欢迎阅读参考SNP(rs)报告

所有等位基因都在前进方向。单击变量详细信息选项卡有关基因组位置、基因和氨基酸变化的详细信息。HGVS名称位于HGVS选项卡.

参考SNP(rs)报告

此页面报告来自新重新设计的dbSNP构建的单个dbSNP参考SNP变体(RefSNP或rs)的数据。
页面顶部报告了rs的简要摘要,下面的相应选项卡中包含了更具体的详细信息。
所有等位基因均为正向。使用基因组视图检查变体两侧的核苷酸及其相邻的核苷酸。
有关更多信息,请参阅帮助文档.

rs9658356美元

当前版本156

已发布2022年9月21日

有机体
智人
职位
电话:12:117286213(GRCh38.第14页)帮助

此RefSNP的锚定位置。包括所有可能受此变化影响的核苷酸,因此它可能不同于右移的HGVS。请参见在这里详细信息。

等位基因
T> G公司
变体类型
SNV公司单核苷酸变异
频率
G=0.003325(880/264690,TOPMED)
G=0.004384(1094/249552,GnomAD_exome)
G=0.006268(1291/205964,ALFA)(+还有19个)
G=0.004420(620/140278,GnomAD)
G=0.004348(525/120740,ExAC)
G=0.00159(125/78702,第页_STUDY)
G=0.00582(75/12882,GO-ESP)
G=0.0012(8/64041000G_30x)
G=0.0014(7/50081000G)
G=0.0281(126/4480,爱沙尼亚语)
G=0.0026(10/3854,ALSPAC)
G=0.0040(15/3708,TWINSUK)
G=0.0044(1128年5月,达赫斯坦)
G=0.005(1998年5月,荷兰政府)
G=0.008(890年7月,HapMap)
G=0.003(2/600,瑞典北部)
G=0.002(1/534,MGP)
G=0.010(3/304,金融风险)
G=0.009(2/216,卡塔尔)
G=0.00(0/86,古撒丁岛)
T=0.5(1/2,SGDP_PRJ)
G=0.5(1/2,SGDP_PRJ)
临床意义
在中报告ClinVar公司
基因:后果
NOS1:误判变量
出版物
0引用
基因组视图
在上查看rs基因组

ALFA等位基因频率
ALFA项目提供了dbGaP的聚集等位基因频率。有关该项目的更多信息第页包括描述、数据访问和使用条款。

发布版本: 20230706150541
人口 样本大小 参考通道 Alt Allele(Alt通道)
总计 全球的 222470 T=0.993873 G=0.006127
欧洲的 附属的 184674 T=0.993199 G=0.006801
非洲的 附属的 10944 T=0.99881 G=0.00119
非洲其他国家 附属的 390 T=1.000 G=0.000
非裔美国人 附属的 10554 T=0.99877 G=0.00123
亚洲的 附属的 6354 T=1.0000 G=0.0000
东亚 附属的 4504 T=1.0000 G=0.0000
其他亚洲人 附属的 1850 T=1.0000 G=0.0000
拉丁美洲1 附属的 804 T=0.994 G=0.006
拉丁美洲2 附属的 974 T=0.998 G=0.002
南亚 附属的 280 T=0.996 G=0.004
其他 附属的 18440 T=0.99534 G=0.00466


帮助

频率选项卡显示了不同研究和人群报告的参考和替代等位基因频率表。表中的行,其中Population=“Global”指整个研究人群,而行,其中Group=“Sub”指研究特定的人群亚组(即AFR、CAU等)(如果可用)。交替等位基因(Alt allele)的频率是观察到的样本与总数的比率,其中分子(观察到的样品)是研究中存在次要等位基因的染色体数量(见“样本大小”,其中组=“Sub”),分母(总样本)是变体研究中所有染色体的总数(见“样本大小”,其中Group=“study-wide”,Population=“Global”)。

下载
书房 人口 样本大小 参考通道 Alt Allele(Alt通道)
TopMed公司 全球的 研究范围 264690 T=0.996675 G=0.003325
gnomAD-外显子 全球的 研究范围 249552 温度=0.995616 G=0.004384
gnomAD-外显子 欧洲的 附属的 134822 温度=0.993325 G=0.006675
gnomAD-外显子 亚洲的 附属的 48576 温度=0.99926 G=0.00074
gnomAD-外显子 美国人 附属的 34524 T=0.99794 G=0.00206
gnomAD-外显子 非洲的 附属的 15494 温度=0.99923 G=0.00077
gnomAD-外显子 德系犹太人 附属的 10072 T=0.99613 G=0.00387
gnomAD-外显子 其他 附属的 6064 T=0.9941 G=0.0059
等位基因频率聚合器 总计 全球的 205964 温度=0.993732 G=0.006268
等位基因频率聚合器 欧洲的 附属的 174458 温度=0.993139 G=0.006861
等位基因频率聚合器 其他 附属的 16988 温度=0.99547 G=0.00453
等位基因频率聚合器 亚洲的 附属的 6354 T=1.0000 G=0.0000
等位基因频率聚合器 非洲的 附属的 6106 T=0.9985 G=0.0015
等位基因频率聚合器 拉丁美洲2 附属的 974 T=0.998 G=0.002
等位基因频率聚合器 拉丁美洲1 附属的 804 T=0.994 G=0.006
等位基因频率聚合器 南亚 附属的 280 T=0.996 G=0.004
gnomAD-基因组 全球的 研究范围 140278 温度=0.995580 G=0.004420
gnomAD-基因组 欧洲的 附属的 75968 温度=0.99284 G=0.00716
gnomAD-基因组 非洲的 附属的 42048 T=0.99924 G=0.00076
gnomAD-基因组 美国人 附属的 13654 T=0.99788 G=0.00212
gnomAD-基因组 德系犹太人 附属的 3324 T=0.9964 G=0.0036
gnomAD-基因组 东亚 附属的 3132 T=1.0000 G=0.0000
gnomAD-基因组 其他 附属的 2152 T=0.9986 G=0.0014
ExAC公司 全球的 研究范围 120740 T=0.995652 G=0.004348
ExAC公司 欧洲 附属的 73326 T=0.99358 G=0.00642
ExAC公司 亚洲的 附属的 25126 T=0.99940 G=0.00060
ExAC公司 美国人 附属的 11566 T=0.99792 G=0.00208
ExAC公司 非洲的 附属的 9820 T=0.9991 G=0.0009
ExAC公司 其他 附属的 902 T=0.993 G=0.007
PAGE研究 全球的 研究范围 78702 T=0.99841 G=0.00159
PAGE研究 非裔美国人 附属的 32516 T=0.99920 G=0.00080
PAGE研究 墨西哥人 附属的 10810 T=0.99787 G=0.00213
PAGE研究 亚洲的 附属的 8318 T=1.0000 G=0.0000
PAGE研究 波多黎各人 附属的 7918 T=0.9982 G=0.0018
PAGE研究 夏威夷土著 附属的 4534 T=0.9991 G=0.0009
PAGE研究 古巴 附属的 4230 温度=0.9939 G=0.0061
PAGE研究 多米尼加 附属的 3828 T=0.9963 G=0.0037
PAGE研究 中美洲 附属的 2450 T=0.9976 G=0.0024
PAGE研究 南美 附属的 1982 T=0.9965 G=0.0035
PAGE研究 美国原住民 附属的 1260 T=0.9960 G=0.0040
PAGE研究 南亚 附属的 856 T=1.000 G=0.000
GO Exome测序项目 全球的 研究范围 12882 T=0.99418 G=0.00582克
GO Exome测序项目 欧洲裔美国人 附属的 8580 T=0.9922 G=0.0078
GO Exome测序项目 非裔美国人 附属的 4302 T=0.9981 G=0.0019
1000基因组_30x 全球的 研究范围 6404 T=0.9988 G=0.0012
1000基因组_30x 非洲的 附属的 1786 T=1.0000 G=0.0000
1000基因组_30x 欧洲 附属的 1266 T=0.9945 G=0.0055
1000基因组_30x 南亚 附属的 1202 T=1.0000 G=0.0000
1000基因组_30x 东亚 附属的 1170 T=1.0000 G=0.0000
1000基因组_30x 美国人 附属的 980 T=0.999 G=0.001
1000基因组 全球的 研究范围 5008 T=0.9986 G=0.0014
1000基因组 非洲的 附属的 1322 T=1.0000 G=0.0000
1000基因组 东亚 附属的 1008 T=1.0000 G=0.0000
1000基因组 欧洲 附属的 1006 T=0.9940 G=0.0060
1000基因组 南亚 附属的 978 T=1.000 G=0.000
1000基因组 美国人 附属的 694 T=0.999 G=0.001
爱沙尼亚人口的遗传变异 爱沙尼亚语 研究范围 4480 T=0.9719 G=0.0281
雅芳父子纵向研究 父母和孩子科霍特 研究范围 3854 T=0.9974 G=0.0026
英国10K研究-双胞胎 双胞胎COHORT 研究范围 3708 T=0.9960 G=0.0040
达赫斯坦的全基因组纯合子 全球的 研究范围 1128 T=0.9956 G=0.0044
达赫斯坦的全基因组纯合子 达吉斯坦 附属的 626 T=0.995 G=0.005
达赫斯坦的全基因组纯合子 附近_东部 附属的 144 T=0.993 G=0.007
达赫斯坦的全基因组纯合子 中亚 附属的 122 T=1.000 G=0.000
达赫斯坦的全基因组纯合子 欧洲 附属的 102 T=0.990 G=0.010
达赫斯坦的全基因组纯合子 南亚 附属的 98 T=1.00 G=0.00
达赫斯坦的全基因组纯合子 高加索 附属的 36 T=1.00 G=0.00
荷兰基因组第5版 荷兰基因组 研究范围 998 T=0.995 G=0.005
人类基因组单体型图 全球的 研究范围 890 T=0.992 G=0.008
人类基因组单体型图 非洲的 附属的 402 T=0.995 G=0.005
人类基因组单体型图 美国人 附属的 226 T=0.996 G=0.004
人类基因组单体型图 欧洲 附属的 176 T=0.977 G=0.023
人类基因组单体型图 亚洲的 附属的 86 T=1.00 G=0.00
瑞典北部 ACPOP公司 研究范围 600 T=0.997 G=0.003
医学基因组计划西班牙人群健康对照 西班牙控制 研究范围 534 T=0.998 G=0.002
金融风险 芬兰语源于FINRISK项目 研究范围 304 T=0.990 G=0.010
卡塔尔 全球的 研究范围 216 T=0.991 G=0.009
古代撒丁岛全基因组1240k捕获数据生成和分析 全球的 研究范围 86 T=1.00 G=0.00
SGDP_PRJ公司 全球的 研究范围 2 T=0.5 G=0.5
帮助

变体详细信息选项卡显示了基因组序列上的已知变体位置:染色体(NC_)、RefSeqGene、假基因或基因组区域(NG_),以及在单独的表中:转录物(NM_)和蛋白质序列(NP_)。相应的转录物和蛋白质位置列在相邻行中,以及分子后果序列本体当没有蛋白质放置时,只列出转录本。“Codon[氨基酸]”列显示了“Reference>Alternate”等位基因格式中的实际碱基变化,包括转录物中的核苷酸密码子变化和蛋白质中的氨基酸变化,允许已知的核糖体滑移位点。要查看与变体相邻的核苷酸,请使用页面底部的基因组视图-放大序列,直到变体周围的核苷酸可见。

基因组植入
序列名称 更改
GRCh38.p14第12页 NC_000012.12:g.117286213T>g
GRCh37.p13第12页 NC_000012.11:g.117724018T>g
NOS1参考序列基因 NG_011991.2:g.80565A>C
基因:NOS1号,一氧化氮合酶1(减股)
分子类型 更改 氨基酸[密码子] SO术语
NOS1转录变体1 NM_000620.5:c.1181A>c D类[G公司A类C类]>答[G公司C类C类] 编码序列变量
一氧化氮合酶1亚型1 NP_000611.1:p.Asp394Ala D(天冬氨酸)>A(丙氨酸) 误读变量
NOS1转录物变体4 NM_001204214.2:c.173A>c D类[G公司A类C类]>答[G公司C类C类] 编码序列变量
一氧化氮合酶1亚型3 NP_001191143.1:p.Asp58Ala D(天冬氨酸)>A(丙氨酸) 误读变量
NOS1转录变体2 NM_001204218.2:c.1181A>c D类[G公司A类C类]>答[G公司C类C类] 编码序列变量
一氧化氮合酶1亚型2 NP_001191147.1:p.Asp394Ala D(天冬氨酸)>A(丙氨酸) 误读变量
NOS1转录变体3 NM_001204213.2:c.173A>c D类[G公司A类C类]>答[G公司C类C类] 编码序列变量
一氧化氮合酶1亚型3 NP_001191142.1:p.Asp58Ala D(天冬氨酸)>A(丙氨酸) 误读变量
帮助

“临床意义”选项卡显示临床意义ClinVar中与每个等位基因变异相关的条目。点击RCV登录(即。RCV000001615.2型)或通道ID(即。12274)以访问完整的ClinVar报告。

等位基因:G(等位基因ID:702155)
ClinVar加入 疾病名称 临床意义
RCV000954872.4型 不提供的 可能是良性的
帮助

别名选项卡显示HGVS名称,表示每个等位基因在基因组、转录物和蛋白质序列上的变异位置和等位基因变化。HGVS名称是用于报告序列加入和版本、序列类型、位置和等位基因变化的表达式。“注释”列可以有两个值:“diff”表示HGVS名称中报告的位置参考等位基因(变异间隔)与其他HGVSs名称中报告参考等位蛋白之间存在差异,以及“rev”是指HGVS名称中报告的位置处该变化间隔的序列与其他未标记为“rev”的HGVS名称中该变化的序列方向相反。

安置 吨= G公司
GRCh38.p14第12页 NC_000012.12:g.117286213号文件= NC_000012.12:g.117286213T>g
GRCh37.p13第12页 NC_000012.11:g.117724018= NC_000012.11:g.117724018T>g
NOS1参考序列基因 NG_011991.2:g.80565= NG_011991.2:g.80565A>C
NOS1转录变体1 NM_000620.5:c.1181= NM_000620.5:c.1181A>c
NOS1转录变体1 NM_000620.4:c.1181= NM_000620.4:c.1181A>c
NOS1转录变体2 NM_001204218.2:约1181= NM_001204218.2:c.1181A>c
NOS1转录变体2 NM_001204218.1:约1181= NM_001204218.1:c.1181A>c
NOS1转录变体3 NM_001204213.2:约173= NM_001204213.2:c.173A>c
NOS1转录变体3 NM_001204213.1:约173= NM_001204213.1:c.173A>c
NOS1转录物变体4 NM_001204214.2:约173= NM_001204214.2:c.173A>c
NOS1转录物变体4 NM_001204214.1:约173= NM_001204214.1:c.173A>c
一氧化氮合酶1亚型1 NP_000611.1:第Asp394页= NP_000611.1:p.Asp394Ala
一氧化氮合酶1亚型2 NP_001191147.1:p.Asp394= NP_001191147.1:p.Asp394Ala
一氧化氮合酶1亚型3 NP_001191142.1:p.Asp58= NP_001191142.1:p.Asp58Ala
一氧化氮合酶1亚型3 NP_001191143.1:p.Asp58= NP_001191143.1:p.Asp58Ala
帮助

Submissions选项卡显示最初提交给dbSNP的变体,现在支持这个RefSNP集群。当提交首次出现时,我们显示提交者句柄、提交标识符、日期和内部版本号。直接提交给dbSNP的Submission ID采用ss-prefixed number(ss#)的形式。表中列出了其他支持变量,但没有ss#。

76 SubSNP,21频率,1个ClinVar提交
提交人 提交ID 日期(生成)
1 EGP_SNPS公司 不锈钢13452690 2003年12月5日(119)
2 佩勒根 ss69122153号 2007年5月16日(127)
AFFY公司 编号74818025 2007年8月16日(128)
4 伊利诺伊州 第74899857页 2007年12月7日(129)
5 上海通用汽车 ss99307667号 2009年2月2日(130)
6 伊利诺伊州 不锈钢174885244 2010年7月4日(132)
7 1000个基因组 ss463149772号 2011年9月17日(135)
8 1000个基因组 不锈钢491052606 2012年5月4日(137)
9 EXOME_芯片 ss491474419号 2012年5月4日(137)
10 CLINSEQ_SNP公司 ss491673410号 2012年5月4日(137)
11 伊利诺伊州 第537621386页 2015年9月8日(146)
12 NHLBI-ESP公司 ss713122457号 2013年4月25日(138)
13 伊利诺伊州 ss780693221号 2014年8月21日(142)
14 伊利诺伊州 ss783367070标准 2014年8月21日(142)
15 EVA-CONL公司 ss990005910号 2014年8月21日(142)
16 JMKIDD_LAB公司 不锈钢1067538175 2014年8月21日(142)
17 1000个基因组 第1346816588号标准 2014年8月21日(142)
18 液压锤_LAB ss1397647007号 2015年9月8日(146)
19 EVA_风险 第1584084829号标准 2015年4月1日(144)
20 EVA_UK10K_ALSPAC公司 ss1629543345号 2015年4月1日(144)
21 EVA_DECODE(蒸发排放_记录) 编号1642114262 2015年4月1日(144)
22 EVA_UK10K_TWINSUK公司 第1672537378页 2015年4月1日(144)
23 EVA_EXAC公司 ss1691134335号 2015年4月1日(144)
24 蒸发排放_MGP 不锈钢1711344759 2015年4月1日(144)
25 伊利诺伊州 编号1752049033 2015年9月8日(146)
26 伊利诺伊州 编号:1917879441 2016年2月12日(147)
27 WEILL_CORNELL_DGM ss1933358949号 2016年2月12日(147)
28 伊利诺伊州 ss1946351170号 2016年2月12日(147)
29 伊利诺伊州 标准1959470313 2016年2月12日(147)
30 CSHL公司 ss2136803266号 2017年11月8日(151)
31 人的距离 ss2193562544号 2016年12月20日(150)
32 GNOMAD公司 ss2740174386号 2017年11月8日(151)
33 GNOMAD公司 ss2748972950号 2017年11月8日(151)
34 GNOMAD公司 第2915684941页 2017年11月8日(151)
35 AFFY公司 ss2984992586号 2017年11月8日(151)
36 AFFY公司 ss2985628542号 2017年11月8日(151)
37 瑞典 不锈钢3010421519 2017年11月8日(151)
38 伊利诺伊州 不锈钢3021471292 2017年11月8日(151)
39 伊利诺伊州 第3626979982号标准 2018年10月12日(152)
40 伊利诺伊州 第3626979983号标准 2018年10月12日(152)
41 伊利诺伊州 ss3634526210号 2018年10月12日(152)
42 伊利诺伊州 第3637989756号 2018年10月12日(152)
43 伊利诺伊州 第3640233543页 2018年10月12日(152)
44 伊利诺伊州 第3642981166页 2018年10月12日(152)
45 伊利诺伊州 第3644604181号标准 2018年10月12日(152)
46 伊利诺伊州 ss3651854518号 2018年10月12日(152)
47 伊利诺伊州 第3653762564页 2018年10月12日(152)
48 EGCUT_WGS系统 ss3677722996号 2019年7月13日(153)
49 EVA_DECODE(蒸发排放_记录) ss3694558510号 2019年7月13日(153)
50 伊利诺伊州 ss3725361954号 2019年7月13日(153)
51 ACPOP公司 ss3739421725号 2019年7月13日(153)
52 伊利诺伊州 编号3744401689 2019年7月13日(153)
53 伊利诺伊州 ss3744827019号 2019年7月13日(153)
54 页码_CC 编号3771721008 2019年7月13日(153)
55 伊利诺伊州 ss3772326205号 2019年7月13日(153)
56 经济增加值 ss3824776525号 2020年4月27日(154)
57 经济增加值 3825829916号不锈钢 2020年4月27日(154)
58 SGDP_PRJ公司 ss3879205130号 2020年4月27日(154)
59 北RUP_AU ss3983908484号 2021年4月26日(155)
60 FSA-实验室 ss3984038544号 2021年4月26日(155)
61 经济增加值 ss3985617956号 2021年4月26日(155)
62 经济增加值 ss3986588268号 2021年4月26日(155)
63 经济增加值 ss4017613331号 2021年4月26日(155)
64 TOPMED公司 不锈钢4934316857 2021年4月26日(155)
65 经济增加值 ss5237660945号 2022年10月16日(156)
66 1000G_高_覆盖 ss5292391397号 2022年10月16日(156)
67 经济增加值 不锈钢5408516418 2022年10月16日(156)
68 HUGCELL_USP(轮毂) ss5486979827号 2022年10月16日(156)
69 1000G_高_覆盖 不锈钢5590690966 2022年10月16日(156)
70 SANFORD_IMAGENETICS公司 不锈钢5654043058 2022年10月16日(156)
71 经济增加值 ss5838575715号 2022年10月16日(156)
72 经济增加值 ss5847685412号 2022年10月16日(156)
73 经济增加值 ss5848364271号 2022年10月16日(156)
74 经济增加值 ss5906204179号 2022年10月16日(156)
75 经济增加值 ss5945455828号 2022年10月16日(156)
76 经济增加值 编号5979405767 2022年10月16日(156)
77 1000基因组 NC_000012.11-117724018 2018年10月12日(152)
78 1000基因组_30x NC_000012.12-117286213号 2022年10月16日(156)
79 雅芳父子纵向研究 NC_000012.11-117724018号 2018年10月12日(152)
80 达赫斯坦的全基因组纯合子 NC_000012.10-116208401 2020年4月27日(154)
81 爱沙尼亚人口的遗传变异 NC_000012.11-117724018号 2018年10月12日(152)
82 ExAC公司 NC_000012.11-117724018号 2018年10月12日(152)
83 金融风险 NC_000012.11-117724018号 2020年4月27日(154)
84 gnomAD-基因组 NC_000012.12-117286213号 2021年4月26日(155)
85 gnomAD-外显子 NC_000012.11-117724018号 2019年7月13日(153)
86 GO Exome测序项目 NC_000012.11-117724018号 2018年10月12日(152)
87 荷兰基因组第5版 NC_000012.11-117724018号 2020年4月27日(154)
88 人类基因组单体型图 NC_000012.12-117286213号 2020年4月27日(154)
89 医学基因组计划西班牙人群健康对照 NC_000012.11-117724018号 2020年4月27日(154)
90 瑞典北部 NC_000012.11-117724018号 2019年7月13日(153)
91 PAGE研究 NC_000012.12-117286213号 2019年7月13日(153)
92 古代撒丁岛全基因组1240k捕获数据生成和分析 NC_000012.11-117724018号 2021年4月26日(155)
93 卡塔尔 NC_000012.11-117724018号 2020年4月27日(154)
94 SGDP_PRJ公司 NC_000012.11-117724018号 2020年4月27日(154)
95 TopMed公司 NC_000012.12-117286213号 2021年4月26日(155)
96 英国10K研究-双胞胎 NC_000012.11-117724018号 2018年10月12日(152)
97 阿尔法 NC_000012.12-117286213号 2021年4月26日(155)
98 ClinVar公司 RCV000954872.4号机组 2022年10月16日(156)
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“历史记录”选项卡显示了以前版本(内部版本)中的RefSNP(关联ID),这些版本现在支持当前RefSNP,以及更新每个关联ID(历史记录更新)的历史记录的日期。

关联ID 历史记录已更新(内部版本)
52829369卢比 2007年9月21日(128)
386624116卢比 2014年8月21日(142)
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提交ID 观察SPDI公司 标准SPDI公司 源RSID
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