LogOdds徽标
LogOdds徽标是一个基于web的应用程序，旨在生成生物序列比对的序列标识很简单。建立在网络徽标3源代码，LogOddsLogo使用per-observation multi-alignment log-odds分数作为信息度量每个徽标位置的内容。这些测量具有适当的统计基础，尤其是对于蛋白质而言，在识别功能相关的排列柱方面可能优于早期的测量。
A类序列徽标是氨基酸的图形表示或由开发的核酸多序列比对汤姆·施耐德和迈克·斯蒂芬斯。标志中的每个位置对应一个对齐“列”，由一堆字母组成。堆栈的高度表示某个位置的序列保持，而堆栈中每个字母的高度与该位置相应氨基酸或核苷酸的观察频率成正比。一般来说，序列标志比一致序列提供了更丰富、更精确的序列主题描述。
参考文献
Yu YK、Capra JA、Stojmirovic A、Landsman D、Altschul、SF。Log-odds序列徽标。
生物信息学31:324-31, (2015).
Altschul SF、Wootton JC、Zaslavsky E、Yu YK。用于多序列比对的log-odds替代分数的构造和使用。
公共科学图书馆计算生物学。6:e1000852，（2010）。
Crooks GE，Hon G，Chandonia JM，Brenner SE。WebLogo：序列徽标发电机。 基因组研究14:1188-1190, (2004).
施耐德TD，斯蒂芬斯RM。序列标识：一种显示一致序列的新方式。
核酸研究。 18：6097-6100，（1990年）。
确认
我们感谢Zvezdana Stojmirovic为LogOddsLogo设计横幅，以及莱昂纳多·马里诺·拉米雷斯（Leonardo Marino-Ramírez）、马克·瓜兹（Marc Gwadz）和纳马达·桑基（Narmada Thanki），以供审查网站。
反馈
请将有关LogOddsLogo的问题和反馈直接发送给Yi-Kuo Yu先生.