CLUSTALW的多序列比对
ETE3型
MAFFT公司
CLUSTALW公司
项目注册号
帮助
一般设置参数:
输出格式
:
群集
GCG(无国界医生)
GDE公司
个人识别码
Phylip公司
美国金融服务贸易协会
成对对齐:
快速/近似
缓慢/准确
输入您的
序列
(带标签)如下(复制和粘贴):
蛋白质
DNA
支持格式:FASTA(Pearson)、NBRF/PIR、EMBL/瑞士Prot、GDE、CLUSTAL和GCG/MSF
或者提供包含查询的文件名
更多详细信息参数。。。
成对对齐参数:
对于快速/近似:
K元组(字)大小:
,
窗口大小:
,
差距惩罚:
顶对角线数:
,
评分方法:
百分比
绝对的
对于慢速/准确:
缺口开放惩罚:
,
间隙扩展惩罚:
选择
权重矩阵
:
BLOSUM(蛋白质)
PAM(蛋白质)
GONNET(蛋白质)
ID(蛋白质)
宫内节育器(用于DNA)
CLUSTALW(用于DNA)
(请注意,只有上述“成对对齐”指定的算法参数有效。)
多个对齐参数:
缺口开放惩罚:
,
间隙扩展惩罚:
重量转换:
对
(值:
),
不
蛋白质的亲水残留物:
亲水间隙:
对
不
选择
权重矩阵
:
BLOSUM(蛋白质)
PAM(蛋白质)
GONNET(蛋白质)
ID(蛋白质)
宫内节育器(用于DNA)
CLUSTALW(用于DNA)
类型
其他选项
(由空格分隔)如下:
(
-选项
寻求帮助)
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