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PDBsum条目2vzg
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细胞粘附
PDB id
2vzg
加载。。。
目录
蛋白质
链
公元15年。
公元126年。
*
配体
前列腺素4
前列腺素E
EDO公司
×5
水域
×65
*
残留物保存分析
PDB id:
2vzg
链接
PDBe公司
雷达散射截面
MMDB公司
耶拿图书馆
蛋白质体
CATH公司
SCOP公司
PDBSWS公司
PDBePISA公司
ProSAT项目
姓名:
细胞粘附
标题:
α-parvin与paxillin ld2基序复合物C端calponin同源结构域的晶体结构
结构:
帕西林。
链:a.片段:paxillin ld1基序,残基141-160。
工程设计:是的。
阿尔法帕文。
链:b.片段:c-末端calponin同源结构域,残基242-372。
同义词:actopaxin,ch-ilkbp,钙调素样整合素连接激酶结合蛋白,基质重塑相关蛋白2。
资料来源:
智人。
人类。
有机体_出租车:9606。
基因:pxn。
表达单位:大肠杆菌。
表达式_system_taxid:511693。
基因:parva,mxra2。
在大肠杆菌bl21。
表达_系统_轴:511693
分辨率:
1.80Å
R系数:
0.187
无R:
0.221
作者:
S.Lorenz、I.Vakonakis、E.D.Lowe、I.D.Campbell、M.E.M.Noble、M.K.Hoeller
密钥参考:
S.洛伦兹
等。
(2008年)。
paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。
结构
,
16
,
1521-1531.
PubMed编号:
18940607
DOI(操作界面):
2016年10月10日/j.str.2008.08.007
日期:
2008年8月1日
发布日期:
2008年10月28日
PROCHECK检查
标题
工具书类
蛋白质链
?
第49023页
(巴基斯坦胡曼)-
来自智人的帕西林
序号:
结构:
顺序:
结构:
公元591年。
公元15年。
蛋白质链
?
Q9NVD7号机组
(帕瓦胡曼)-
智人的Alpha-parvin
序号:
结构:
公元372年。
公元126年。
密钥:
PfamA域
二级结构
CATH域
酶反应
酶类:
链条A、B:
电气控制。?
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
内政部编号:
2016年10月10日/j.str.2008.08.007
结构
16
:1521-1531
(2008)
PubMed编号:
18940607
paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。
S.Lorenz,
I.瓦科纳基斯,
E.D.Lowe,
I.D.Campbell,
M.E.Noble,
M.K.霍勒。
摘要
衔接蛋白paxillin包含五个保守的富含亮氨酸(LD)基序
与多种黏附蛋白如α-帕文相互作用。
在这里,我们报道了C末端钙调素同源性的第一个晶体结构
alpha-parvin的域(CH(C)),分辨率为1.05 A,并表明它能够
结合所有LD基序,对LD1、LD2和LD4具有一定的选择性。
共晶体
带有这些LD基序的结构揭示了它们的分子细节
与alpha-parvin-CH(C)上常见结合位点的相互作用,该结合位点位于
位于典型褶皱边缘,包括CH-间域的一部分
链接器。
令人惊讶的是,这个结合位点可以容纳两个LD基序
反平行方向。
综合来看,这些结果揭示了一个不同寻常的
paxillin/alpa-parin系统中的结合简并度
促进细胞内动态信号复合物的组装。
所选图形
图4。
图4。
α-Parvin-CH[C]的共晶结构
帕罗西林LD1
的功能区表示的叠加
蓝色α-parvin-CH[C]及其与LD1肽的复合物
金色和绿色。
次要结构元件为
表明。
图5。
图5。
自旋标记LD1的预实验
(A)
富集230μM^15N的^1H-^15N HSQC光谱的详细信息
α-细小蛋白CH[C]和250μM PROXYL标记的LD1肽
不存在(左)和存在(右)5mM抗坏血酸盐。
这个
后者用于减少自旋标签,从而消除PRE
影响。
晶体中LD1的结合方向
结构表示为“向前”
(B) 功能区
α-parvin-CH[C]用金色表示,LD1用绿色表示。
这个
α-parvin残基257和370的位置在
蓝色和红色。
以上数字为
重印
摘自Cell Press出版的开放存取出版物:
结构
(2008,
16
,
1521-1531)
版权所有2008。
数字是
挑选出来的
通过自动化流程。
引用此PDB文件关键参考的文献参考
公共医疗id
参考
20033063
S.A.Wickström,
A.兰格,
E.Montanez,
和
R.Fässler先生
(2010).
ILK/PINCH/细小病毒复合物:激酶已经死亡,假激酶万岁!
欧洲工商管理硕士J
,
29
,
281-291.
20005845
K.Fukuda,
S.Gupta,
K.Chen,
C.吴,
和
J.秦
(2009年)。
ILK的假活性位点对其与α-胡萝卜素的结合和定位于局部粘连至关重要。
分子电池
,
36
,
819-830.
PDB代码:
3公里
3公里瓦
最新的参考文献首先显示。
引用数据部分来自
CiteXlore公司
和部分
从自动收割过程中。
请注意,这可能是
由于并非所有期刊都包含在
任何一种方法。
然而,我们正在不断建立引文数据
因此,随着时间的推移,将会有越来越多的参考文献。
当参考描述PDB结构时,PDB
代码是
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