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PDBsum条目2vzg

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蛋白质 配体 蛋白质-蛋白质界面 链接
细胞粘附 PDB id
2vzg

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元15年。
公元126年。 *
配体
前列腺素4
前列腺素E
EDO公司 ×5
水域 ×65
*残留物保存分析
PDB id:
2vzg
姓名: 细胞粘附
标题: α-parvin与paxillin ld2基序复合物C端calponin同源结构域的晶体结构
结构: 帕西林。链:a.片段:paxillin ld1基序,残基141-160。工程设计:是的。阿尔法帕文。链:b.片段:c-末端calponin同源结构域,残基242-372。同义词:actopaxin,ch-ilkbp,钙调素样整合素连接激酶结合蛋白,基质重塑相关蛋白2。
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:pxn。表达单位:大肠杆菌。表达式_system_taxid:511693。基因:parva,mxra2。在大肠杆菌bl21。表达_系统_轴:511693
分辨率:
1.80Å     R系数:   0.187     无R:   0.221
作者: S.Lorenz、I.Vakonakis、E.D.Lowe、I.D.Campbell、M.E.M.Noble、M.K.Hoeller
密钥参考:
S.洛伦兹等。(2008年)。paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。结构,16,1521-1531.PubMed编号:18940607 DOI(操作界面):2016年10月10日/j.str.2008.08.007
日期:
2008年8月1日 发布日期:   2008年10月28日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
普法姆   架构模式
第49023页 (巴基斯坦胡曼)-来自智人的帕西林
序号:
结构:
 
顺序:
结构:
公元591年。
公元15年。
蛋白质链
Pfam公司   架构模式
Q9NVD7号机组 (帕瓦胡曼)-智人的Alpha-parvin
序号:
结构:
公元372年。
公元126年。
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域

酶反应
酶类: 链条A、B: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
内政部编号:2016年10月10日/j.str.2008.08.007 结构 16:1521-1531(2008)
PubMed编号:18940607  
 
 
paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。
S.Lorenz, I.瓦科纳基斯, E.D.Lowe, I.D.Campbell, M.E.Noble, M.K.霍勒。
 
  摘要  
 
衔接蛋白paxillin包含五个保守的富含亮氨酸(LD)基序与多种黏附蛋白如α-帕文相互作用。在这里,我们报道了C末端钙调素同源性的第一个晶体结构alpha-parvin的域(CH(C)),分辨率为1.05 A,并表明它能够结合所有LD基序,对LD1、LD2和LD4具有一定的选择性。共晶体带有这些LD基序的结构揭示了它们的分子细节与alpha-parvin-CH(C)上常见结合位点的相互作用,该结合位点位于位于典型褶皱边缘,包括CH-间域的一部分链接器。令人惊讶的是,这个结合位点可以容纳两个LD基序反平行方向。综合来看,这些结果揭示了一个不同寻常的paxillin/alpa-parin系统中的结合简并度促进细胞内动态信号复合物的组装。
 
  所选图形  
 
图4。
图4。α-Parvin-CH[C]的共晶结构帕罗西林LD1
的功能区表示的叠加蓝色α-parvin-CH[C]及其与LD1肽的复合物金色和绿色。次要结构元件为表明。
图5。
图5。自旋标记LD1的预实验
(A)富集230μM^15N的^1H-^15N HSQC光谱的详细信息α-细小蛋白CH[C]和250μM PROXYL标记的LD1肽不存在(左)和存在(右)5mM抗坏血酸盐。这个后者用于减少自旋标签,从而消除PRE影响。晶体中LD1的结合方向结构表示为“向前”
(B) 功能区α-parvin-CH[C]用金色表示,LD1用绿色表示。这个α-parvin残基257和370的位置在蓝色和红色。
 
  以上数字为重印摘自Cell Press出版的开放存取出版物:结构(2008,16,1521-1531)版权所有2008。  
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引用此PDB文件关键参考的文献参考

  公共医疗id 参考
20033063 S.A.Wickström, A.兰格, E.Montanez, R.Fässler先生(2010).
ILK/PINCH/细小病毒复合物:激酶已经死亡,假激酶万岁!
  欧洲工商管理硕士J,29,281-291.  
20005845 K.Fukuda, S.Gupta, K.Chen, C.吴, J.秦(2009年)。
ILK的假活性位点对其与α-胡萝卜素的结合和定位于局部粘连至关重要。
  分子电池,36,819-830.
PDB代码: 3公里 3公里瓦
最新的参考文献首先显示。引用数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将会有越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。

 

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