PDBsum条目6vgg

转录

PDB id

6伏/加仑

加载。。。

			蛋白质链

					公元98年。


					公元117年。


					公元121年。

			DNA/RNA

			配体

					QWP（质量工作计划） ×2个

			金属

					_MG公司

			水域 ×2

PDB标识：

6伏/加仑

链接

姓名：

转录

标题：

人类转录因子erg、与核心结合因子β（cbfb）结合的人类runx2和米特拉霉素与16mer DNA cagaggtgcttc复合物的DNA结合域的晶体结构

结构：

转录调节因子erg.链：a.片段：DNA结合域。同义词：转化蛋白erg。工程：是的。Other_details：n末端gphm序列在其裂解后从亲和标记中留下。。DNA（5'-d（p Cp Ap Gp Ap Gp Gp Gp Ap-Tp Gp Tp Gp Cp Tp C）-3'）。

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：erg。表达于：大肠杆菌bl21（de3）。表达式_系统_最大值：469008。合成：是的。基因：runx2，aml3，cbfa1，osf2，pebp2a。基因：cbfb。

分辨率：

4.31Å

R系数：

0.253

无R：

0.285

作者：

C.Hou、J.Rohr、O.V.Tsodikov

密钥参考：

C.侯等。(2021).米特拉霉素对致癌FLI1和ERG交易的变构干涉。结构,29,404PubMed编号：33275876 内政部：2016年10月10日/j.str.2020.11.012

日期：

2020年1月8日

发布日期：

2020年11月25日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^？

第11308页 （ERG_HUMAN）-智人转录调节因子ERG

序号：
结构：公元479年。
公元98年。*

蛋白质链

^？

问题13950 （RUNX2_HUMAN）-智人Runt-related转录因子2

序号：
结构：

序号：
结构：公元521年。
公元117年。

蛋白质链

^？

问题13951 （PEBB_胡曼）-智人核心结合因子β亚基

序号：
结构：公元182年。
公元121年。

密钥： PfamA域二级结构
* PDB和UniProt序列不同在1个残留物位置（黑色交叉）

DNA/RNA链

C-A-G-A-G-G-A-T-G-T-G-G-C-T-T-C 16个底座

G-A-A-G-C-C-A-A-A-T-C-C-T-C-T-T-G 16个底座

DOI编号：2016年10月10日/j.str.2020.11.012 结构 29:404(2021)

PubMed编号：33275876

密特拉霉素对致癌FLI1和ERG交易的变构干扰。

C.侯， A.曼达尔， J.Rohr， O.V.茨奥迪科夫。

摘要

ERG和FLI1的ETS家族转录因子在肿瘤发生中起关键作用通过结合调节性DNA位点和干扰其他因素的作用。Mithramycin（MTM）是一种抗癌药物，DNA结合天然产物，作为ERG和FLI1通过未知机制。我们展示了一系列的晶体结构ERG/FLI1的DNA结合域（DBD）达到高阶结构ERG/FLI1 DBD复合物、转录因子Runx2、核心结合因子β（Cbfβ）和DNA增强子位点上的MTM，以及支持DNA结合使用MTM及其类似物的研究。综合起来，这些数据提供了洞察力ERG和FLI1交易的变构机制及其MTM类似物的干扰。