PDB总和条目6t7b

核蛋白

PDB id

6t7b型

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			蛋白质链

					公元98年。


					公元84年。


					公元106年。


					公元95年。


					公元76年。

			DNA/RNA

PDB id：

6t7b型

链接

姓名：

核蛋白

标题：

人sox2转录因子与核小体复合物的结构

结构：

组蛋白h3.2。链：a，e.同义词：组蛋白h3/m，组蛋白h2/o。工程：是。组蛋白h4。链条：b，f。工程：是的。组蛋白h2a 1-b/e.链：c，g。

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：his2h3a、his2h3C、h3f2、h3fm、his2h2d。表达单位：大肠杆菌。表达式系统最大值：562。基因：hist1h4a、h4/a、h4fa、hist1h4b、h4/i、h4fi、histoh4c、h4/g、h4fg、histlh4d、h4/b、h4fb、histit1h4e、h4/j、h4fj、histih4f、h4/c、h4fc、histis1h4h、h4/h、h4fsh、histit1h4i、h4/m、h4fm、his1h4j、h4/e、，

作者：

S.O.Dodonova、F.Zhu、C.Dienemann、J.Taipale、P.Cramer

密钥参考：

S.O.Dodonova公司等。（2020年）。核小体结合的SOX2和SOX11结构阐明了先锋因子的功能。自然,580,669-672.PubMed编号：32350470 内政部：10.1038/s41586-020-2195年

日期：

2019年10月21日

发布日期：

20年4月29日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^?

Q71DI3型 （H32_人类）-智人组蛋白H3.2

序号：
结构：公元136年。
公元98年。*

蛋白质链

^?

第62805页 （H4_胡曼）-智人组蛋白H4

序号：
结构：公元103年。
公元84年。

蛋白质链

^?

P04908号 （H2A1B_人类）-智人组蛋白H2A 1-B/E型

序号：
结构：公元130年。
公元106年。

蛋白质链

^?

O60814型 （H2B1K_HUMAN）-智人组蛋白H2B 1-K型

序号：
结构：公元126年。
公元95年。

蛋白质链

^?

第48431页 （SOX2_胡曼）-智人转录因子SOX-2

序号：
结构：公元317年。
公元76年。

密钥： PfamA域二级结构
* PDB和UniProt序列不同在1个残留物位置（黑色交叉）

DNA/RNA链

C-T-A-A-T-T-T-A-T-T-A-G-T-T-T-T-G-T-A-G-C-G-T-A-T-A-A-C-T-T-T-C-T-T-A-A-A-A-T-C-T-T- 95个底座

C-G-T-A-G-G-C-A-T-A-A-A-A-T-A-G-C-T-A-A-C-C-C-A-A-A-G-C-A-C-A-A-G-A-A-A-C-A-T-A- 95个底座



		酶反应

酶类：

链条A、B、C、D、E、F、G、H、K：电气控制。？

[国际酶] [执行PASy] [KEGG]（KEGG）【布伦达】

DOI编号：10.1038/s41586-020-2195年 自然 580:669-672(2020)

PubMed编号：32350470

核小体结合的SOX2和SOX11结构阐明了先锋因子的功能。

S.O.Dodonova， F.朱， C.迪尼曼， J.Taipale， P.克拉默。

摘要

干细胞多能干细胞需要“先锋”转录因子分化与细胞重编程^1,2.先锋因素可以约束核小体DNA使基因组中的封闭区域能够表达基因染色质。SOX2是一个显著的先锋因子，对多能性至关重要胚胎干细胞的自我更新³。我们在这里报告SOX2及其DNA结合域的低温电镜结构与核小体结合的近同源SOX11。结构表明SOX因素可以在超螺旋位置2结合并局部扭曲DNA。这些因素也促进末端核小体DNA从组蛋白八聚体中分离，这增加了DNA的可及性。与核小体结合的SOX因子也可以导致组蛋白H4的N末端尾部重新定位，包括赖氨酸残基16。我们推测，这种重新定位与高阶核小体堆积，包括H4尾部与相邻核小体。我们的研究结果表明先锋转录因子可以利用结合能启动染色质开放，从而促进核小体重塑和随后的转录。