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PDBsum条目6j4i

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免疫系统 PDB id
6j4i型

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元97年。
PDB id:
6j4i型
姓名: 免疫系统
标题: 相扑中保守且埋藏的边对面芳香相互作用对相扑途径至关重要
结构: 小泛素相关修饰物1。链:a.同义词:sumo-1,gap-modifying protein 1。工程设计:是的。突变:是
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:相扑1。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562
核磁共振结构: 20种型号
作者: K.S.Chatterjee,R.Das公司
密钥参考: K.S.Chatterjee公司等。(2019).小泛素样修饰体(SUMO)中的保守且埋藏的边对面芳香相互作用对SUMO的稳定性和功能有一定作用。生物化学杂志,294,6772-6784页。PubMed编号:30824543 内政部:10.1074/jbc。118.006642兰特
日期:
2019年1月9日 发布日期:   2019年3月13日
PROCHECK检查
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
第63165页 (SUMO1_HUMAN)-智人的小泛素相关修饰物1
序号:
结构:
公元101年。
公元97年。*
密钥: PfamA域 二级结构
* PDB和UniProt序列不同在1个残留物位置(黑色交叉)

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [执行PASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
DOI编号:10.1074/jbc。118.006642兰特 生物化学杂志 294:6772-6784(2019)
PubMed编号:30824543  
 
 
小泛素样修饰体(SUMO)中的保守且埋藏的边对面芳香相互作用对SUMO的稳定性和功能有一定作用。
查特吉, V.特里帕西, R.Das公司。
 
  摘要  
 
隐藏在蛋白质核心的芳香氨基酸通常参与相互作用成对相互作用。从头算能量计算强调了构象取向和取代的影响很重要对于芳香环之间稳定的芳香相互作用蛋白质的折叠和功能的背景是难以捉摸的。小泛素样修饰语(SUMO)是一种常见的翻译后修饰语,影响不同的细胞过程。在这里,我们报道了一种高度保守的芳香族三联体三种氨基酸,Phe36-提尔51-苯丙氨酸64,是一个唯一的SUMO标记,在其他泛素类同源折叠中缺失。我们发现提尔51-苯丙氨酸64一对相互作用的芳烃对SUMO的褶皱和稳定性。此外SUMO表面的SUMO相互作用基序(SIM)严重依赖于埋在核心的成对芳香相互作用。核磁共振结构研究揭示Tyr的扰动51-苯丙氨酸64构象破坏物SUMO中的几个长距离第三系接触,导致减弱SUMO酸化的动态蛋白在体外和细胞内。A类Tyr对Phe边对面构象的细微扰动替换显著降低了稳定性、SUMO/SIM亲和力和速率SUMO酰化。我们的结果强调了SUMO蛋白核心内的芳香对对其稳定性和功能。
 

 

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