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PDBsum条目5ybc
转至PDB代码:
结构蛋白
PDB id
5个月
加载。。。
目录
蛋白质
链
公元91年。
配体
高尔夫球
PDB id:
5个月
链接
PDBe公司
RCSB公司
MMDB公司
耶拿图书馆
蛋白质体
CATH公司
范围
PDBSWS公司
PDBePISA公司
项目SAT
姓名:
结构蛋白
职务:
ergp55天然ets结构域的X射线结构
结构:
转录调节因子erg.链:c,a.片段:ets结构域,unp残基317-408。
同义词:转化蛋白erg.工程:是
资料来源:
智人。
人类。
有机体_出租车:9606。
基因:erg。表达于:肠杆菌噬菌体l1。
表达_系统_轴:268588
分辨率:
2.50Å
R系数:
0.224
无R:
0.257
作者:
A.K.Saxena,S.P.Gangwar公司
密钥参考:
R.夏尔马
等。
(2018).
ERG3及其与E74启动子DNA序列复合物ETSi结构域的比较结构分析。
晶体生物学学报
,
74
,
656-663.
PubMed编号:
30279318
内政部:
10.1107/S2053230X1801110X
日期:
2017年9月4日
发布日期:
2018年9月19日
PROCHECK检查
标题
工具书类
蛋白质链
?
第11308页
(ERG_HUMAN)-
智人转录调节因子ERG
序号:
结构:
公元479年。
公元91年。
密钥:
PfamA域
二级结构
酶反应
酶类:
等等。?
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
DOI编号:
10.1107/S2053230X1801110X
晶体生物学学报
74
:656-663
(2018)
PubMed编号:
30279318
ERG3及其与E74启动子DNA序列复合物ETSi结构域的比较结构分析。
R.Sharma,
S.P.Gangwar,
A.K.Saxena公司。
摘要
ERG3(ETS相关基因)是ETS(成红细胞)的成员
转化特异性)转录因子家族,其含有高度
保守的DNA结合域。
ETS转录因子家族的不同之处在于
它们与启动子DNA序列的结合及其DNA序列的机制
人们对歧视知之甚少。
在当前的研究中,ETSi的晶体
空间群中的域(包含CID基序的ERG3的ETS域)
第4页
1
2
1
2及其与E74 DNA序列的复合物
(DNA
9
)在空间组C222中
1
获得了及其
确定了结构。
ETSi畴的比较结构分析
及其与DNA的复合物
9
具有先前确定的结构
空间ERGi结构域(包含抑制基序的ERG的ETS结构域)
P6组
5
2
1
2和ERGi-DNA
12
中的复数
空间组P4
1
2
1
进行了2次。
ETSi域是
在溶液和晶体学中观察到同二聚体
非对称单元。
ETSi畴结构与
ERGi结构域在C末端表现出主要的构象变化
DNA结合自身抑制(CID)基序,而在
ETSi域结构的循环区域。
ETSi-DNA
9
中的复数
空间组C222
1
形成一个与
ERG-DNA
12
空间群P4中的复数
1
2
1
2
在复合物叠加后,观察到主要的构象变化
在DNA的5'和3'端
9
,而核心GGA的构象
核苷酸非常保守。
ETSi-DNA的比较
9
ETS 1类蛋白-DNA复合物已知结构的结构表明
启动子DNA结合和特异性的相似性和差异
1类ETS蛋白。
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