垫片
垫片

PDBsum条目2lxt

转到PDB代码:
蛋白质 蛋白质-蛋白质界面 链接
转移酶/蛋白质结合 PDB id
2lxt(2lxt)

 

 

 

 

加载。。。

 
JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元87年。
公元19年。
公元34年。
PDB id:
2lxt(2lxt)
姓名: 转移酶/蛋白质结合
标题: kix结构域中的变构通讯通过疏水核心的动态重新封装进行
结构: Creb结合蛋白。链:a.片段:unp残基587-673。工程设计:是的。组蛋白赖氨酸n-甲基转移酶mll。链:b.片段:unp残基2840-2858。同义词:all-1,cxxc型锌指蛋白7,赖氨酸n-甲基转移酶2a,kmt2a,三羟类蛋白,锌指
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:crebbp,cbp。表达单位:大肠杆菌。Expression_system_taxid:562。基因:mll、all1、cxxc7、hrx、htrx、kmt2a、mll1、trx1。基因:creb1。
核磁共振结构: 20种型号
作者: S.Bruschweiler、P.Schanda、R.Konrat、M.Tollinger
密钥参考: S.Brüschweiler先生等。(2013).KIX结构域中的变构通讯通过疏水核心的动态重新包装进行。Acs化学生物,8,1600-1610.PubMed编号:23651431 内政部:10.1021/cb4002188
日期:
2012年8月31日 发布日期:   2013年6月12日
PROCHECK检查
转到PROCHECK摘要
 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
问题92793 (CBP_人类)-智人CREB结合蛋白
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元2442年。
公元87年。
蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
企03164 (KMT2A_HUMAN)-智人组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶2A
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元3969年。
公元19年。*
蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
第16220页 (CREB1_HUMAN)-智人环状AMP反应元件结合蛋白1
序号:
结构:
公元327年。
公元34年。
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同1个残留位置(黑色交叉)

酶反应
1类酶: 链条A: E.C.2.3.1节-  - ?????
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
2类酶: 链条A: E.C.2.3.1.48段 -组蛋白乙酰转移酶。
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: 乙酰辅酶A+L-赖氨酸-[蛋白质]=辅酶A+H++N个6-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
乙酰辅酶A
+ L-赖氨酸-[蛋白质]
= CoA公司
+ H(+)
+ N(6)-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
3类酶: 链条B: E.C.2.1.1-  - ?????
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
酶类别4: 链条B: E.C.2.1.1.364号文件 -[组蛋白H3]-赖氨酸(4)N-甲基转移酶。
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: L-赖氨酸4-[组蛋白H3]+S-腺苷-L-甲硫氨酸=H++N个6-甲基-L-赖氨酸4-[组蛋白H3]+S-腺苷-L-高半胱氨酸
L-赖氨酸(4)-[组蛋白H3]
+ S-腺苷-L-甲硫氨酸
= H(+)
+ N(6)-甲基-L-赖氨酸(4)-[组蛋白H3]
+ S-腺苷-L-高半胱氨酸
酶类别5: 链条C: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
从获取的.mol文件生成的分子图KEGG ftp站点

 

 
参考
 
 
DOI编号:10.1021/cb4002188 Acs化学生物 8:1600-1610(2013)
PubMed编号:23651431  
 
 
KIX结构域中的变构通讯通过疏水核心的动态重新包装进行。
S.Brüschweiler, R.Konrat, M.托林格。
 
  摘要  
 
转录辅激活子CREB结合蛋白(CBP)的KIX结构域协同调节转录因子之间的相互作用。的绑定转录因子混合白血病(MLL)诱导类似于KIX结构域构象的KIX低密度构象在第二个转录因子分子的存在下。核磁共振自旋弛豫以前的研究表明变构偶联通过连接两个结合位点的疏水核心残基网络。在这里,我们描述KIX二元络合物的高分辨率NMR溶液结构与MLL和KIX三元络合物形成并磷酸化CREB激酶诱导域(pKID)作为第二配体。我们展示了这种结合pKID到带有MLL的KIX的二元复数伴随着一个定义的蛋白质疏水核心中变构网络的重新包装。源自甲基(13)C化学位移的轮状体群体揭示了未被捕获的对重新打包过程的动态贡献结构坐标和变构的动力学性质示例KIX域中的通信。
 

 

垫片

垫片