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PDBsum条目1xk2

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蛋白质 配体 蛋白质-蛋白质界面 链接
氧化还原酶 PDB id
1千2

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元214年。 *
配体
×2
水域 ×206
*残留物保存分析
PDB id:
1千2
姓名: 氧化还原酶
标题: NADPH和抗坏血酸支持的血红素加氧酶反应是不同的。r183e突变体对血红素裂解的区域特异性
结构: 血红素加氧酶1。Chain:a,b.同义词:ho-1。工程设计:是的。突变:是
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:hmox1,ho1,ho。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562
生物单位: 二聚体(来自PQS公司)
分辨率:
2.20Å     R系数:   0.220     无R:   0.230
作者: J.Wang、L.Lad、T.L.Poulos、P.R.Ortiz De Montellano
密钥参考:
J.Wang(王)等。(2005).人类血红素加氧酶的区域特异性决定因素:R183E突变体对NADPH和抗坏血酸依赖性血红素的差异裂解。生物化学杂志,280,2797-2806.PubMed编号:15525643 内政部:10.1074/jbc。M411229200
日期:
2004年9月26日 发布日期:   2004年11月9日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   ArchSchema(架构) ?
P09601号 (HMOX1_人类)-智人血红素加氧酶1
序号:
结构:
公元288年。
公元214年。*
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同1个残留位置(黑色交叉)

酶反应
酶类: E.C.1.14.18标准 -血红素加氧酶(胆绿素生成)。
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: 血红素b+3 O2+3还原[NADPH-血蛋白还原酶]=胆绿素IXα+CO+Fe2++H(H)++3 H2O+3氧化[NADPH--血蛋白还原酶]
血红素b
结合配体(Het群名称=)
相似性为95.45%的匹配
+ ×氧气
+ ×还原型[NADPH--血蛋白还原酶]
= 胆绿素IXα
+ 一氧化碳
+ 铁(2+)
+ H(+)
+ ×
+ ×氧化[NADPH--血蛋白还原酶]
从获取的.mol文件生成的分子图KEGG ftp站点

 

 
参考
 
 
DOI编号:10.1074/jbc。M411229200 生物化学杂志 280:2797-2806(2005)
PubMed编号:15525643  
 
 
人类血红素加氧酶的区域特异性决定因素:R183E突变体对NADPH和抗坏血酸依赖性血红素的差异裂解。
J.Wang, L.拉德, T.L.普洛斯, P.R.Ortiz de Montellano公司。
 
  摘要  
 
人血红素氧化酶-1(hHO-1)R183E突变体氧化血红素的能力在NADPH-细胞色素P450还原酶或抗坏血酸支持的反应中对酸进行了比较。NADPH依赖性反应,如野生型反应hHO-1只产生胆绿素IXalpha。相反,R183E突变体具有抗坏血酸作为还原剂产生胆绿素IXα(79+/-4%),IXdelta(19+/-3%)和微量IXbeta。在超氧化物歧化酶和过氧化氢酶,胆绿素IXdelta的产率降低到8+/-1%胆绿素IXα相应增加。光谱分析NADPH依赖反应表明R183E铁胆绿素复合物累积,因为铁的还原,这是连续的铁和胆绿素释放受损。位置183处的冲锋逆转使得铁的还原更加困难。R183E的晶体结构在铁和亚铁-NO结合形式中测定的突变体表明血红素主要采用与野生型hHO-1相同的方向。的结构铁(II)。NO复合物表明活性位点氢键发生改变网络支持R183E突变体中的催化作用。此外,Arg-183有助于对野生型酶的区域特异性,但其贡献不是关键。结果表明,抗坏血酸依赖反应区域化学控制程度低于NADPH依赖反应。抗坏血酸可能能够减少R183E铁和二价铁配合物不能被NADPH-细胞色素P450还原的活性位点构象还原酶。
 
  所选图形  
 
图1。
图1。催化反应序列的方案血红素加氧酶。这个-,-,-、和-中尺度的血红素的位置被标记。
图10。
图10。立体图显示NO复合物野生型和R183E突变体。关键氢键交互显示为虚线。
 
  以上数字为重印经ASBMB许可:生物化学杂志(2005,280,2797-2806)版权所有2005。  
  数字是挑选出来的作者。  

引用此PDB文件关键参考的文献参考

  公共医疗id 参考
17965015 C.M.比安切蒂, 李毅, S.W.Ragsdale公司, G.N.菲利普斯(2007).
截短的人血红素加氧酶-2的载脂蛋白和血红素结合晶体结构的比较。
  生物化学杂志,282,37624-37631.
PDB代码: 第2季度32 2个月 2千兆赫
17534530 M.Unno, 松井, M.Ikeda-Saito先生(2007).
血红素加氧酶的结构与催化机理。
  Nat Prod代表,24,553-570.  
16388581 J.Wang, J.P.Evans, H.Ogura, 拉马政府, P.R.Ortiz de Montellano公司(2006).
通过去除血红素而不是破坏远端氢键网络来改变人类血红素加氧酶-1的区域特异性。
  生物化学,45,61-73.  
首先显示最新的参考文献。引文数据部分来自CiteXlore公司和部分来自自动收割程序。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将会有越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。

 

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