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PDBsum条目1s4m

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蛋白质 配体 金属 蛋白质-蛋白质界面 链接
转移酶 PDB id
1S4米

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元277年。 *
配体
LUM(亮度单位) ×2
金属
_MG公司
水域 ×228
*残留物保存分析
PDB id:
1S4米
姓名: 转移酶
标题: 马里蒂纳热藻fad合成酶与黄素结合的晶体结构
结构: 核黄素激酶/fmn腺苷酸转移酶。链条:a、b。工程设计:是
资料来源: 海洋热藻。有机体_出租车:2336。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562
生理单位: 二聚体(来自PQS公司)
分辨率:
2.10Å     R系数:   0.212     无R:   0.259
作者: W.Wang,R.Kim,H.Yokota,S.-H.Kim,伯克利结构基因组中心(Bsgc)
密钥参考:
王伟(W.Wang)等。(2005).海洋热藻FAD合成酶结合黄素的晶体结构。蛋白质,58,246-248.PubMed编号:15468322 内政部:10.1002/保护.20207
日期:
2004年1月16日 发布日期:   2004年10月19日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
Q9WZW1型 (Q9WZW1_THEMA)-海热藻核黄素生物合成蛋白(菌株ATCC 43589/DSM 3109/JCM 10099/NBRC 100826/MSB8)
序号:
结构:
公元293年。
公元277年。
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域

酶反应
1类酶: E.C.2.7.1.26号文件 -核黄素激酶。
[国际酶] [执行PASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: ATP+核黄素=ADP+FMN+H+
列车自动防护系统
+
核黄素
结合配体(Het群名称=LUM(亮度单位))
匹配率为66.67%
= ADP公司
+ FMN(飞行管理号码)
+ H(+)
辅因子: 镁(2+)、锌(2+)或锰(2+)
2类酶: E.C.2.7.7.2段 -Fad合成酶。
[国际酶] [执行PASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: ATP+FMN+H+=二磷酸盐+FAD
列车自动防护系统
+
FMN(飞行管理号码)
结合配体(Het群名称=LUM(亮度单位))
相似度为58.06%的匹配
+ H(+)
= 二磷酸盐
+ 时尚
辅因子: 镁(2+)
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
从获取的.mol文件生成的分子图KEGG ftp站点

 

 
参考
 
 
DOI编号:10.1002/保护.20207 蛋白质 58:246-248(2005)
PubMed编号:15468322  
 
 
海洋热藻FAD合成酶结合黄素的晶体结构。
王伟, R.Kim, H.横田, S.H.金。
 
  摘要  
 
没有给出摘要。

 
  所选图形  
 
图1。
图1。TM379结构的带状图。彩虹颜色从N端逐渐应用到C端。这个ball模型表明黄素分子与蛋白质结合结构。
图3。
图3。黄素与活性位点的相互作用。每个虚线表示交互作用。洋红色表示氢键。黄色表示VDW触点。(a) 显示氢键仅限于交互。(b) 显示所有交互。
 
  以上数字为重印经John Wiley&Sons公司许可:蛋白质(2005,58,246-248)版权所有2005。  
  数字是挑选出来的通过自动化流程。  

引用此PDB文件关键参考的文献参考

  公共医疗id 参考
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黄烷酶的生物合成。
  Nat Prod代表,22,324-350.  
首先显示最新的参考文献。引文数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将会有越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。

 

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