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PDBsum条目1oze
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酶类: |
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E.C.1.14.18标准
-血红素加氧酶(胆绿素生成)。
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反应: |
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血红素b+3 O2+3还原[NADPH-血蛋白还原酶]=胆绿素IXα+CO+Fe2++H(H)++3 H2O+3氧化[NADPH--血蛋白还原酶]
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血红素b
结合配体(Het群名称=) 相似性为95.45%的匹配
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+
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三×氧气
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+
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三×还原型[NADPH--血蛋白还原酶]
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=
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胆绿素IXα
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+
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一氧化碳
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+
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铁(2+)
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+
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H(+)
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+
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三×水
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+
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三×氧化[NADPH--血蛋白还原酶]
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DOI编号:
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分子生物学杂志
330:527-538(2003) |
PubMed编号:
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人血红素加氧酶-1的Asp140Ala突变体的铁、亚铁和亚铁-NO形式的晶体结构:催化意义。
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L.拉德,
J.Wang,
H.李,
J.Friedman,
B.Bhaskar,
P.R.Ortiz de Montellano公司,
T.L.普洛斯。
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摘要 |
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定点突变研究表明,人和大鼠体内的Asp140血红素加氧酶-1对酶的活性至关重要。这里,我们报告D140AFe(III)和Fe(II)氧化还原态的突变晶体结构以及Fe(II)-NO络合物作为Fe(Ⅱ)-氧络合物的模型。这些结构是与相应的野生型结构相比。突变型和野生型除了远端血红素袋溶剂外,结构非常相似结构。在Fe(III)D140A突变体中,一个水分子取代了缺少Asp140羧酸侧链和第二个水分子突变体,结合在远端口袋中。在还原到Fe(II)状态时沿着血红素一面运行的远端螺旋在两种情况下都靠近血红素野生型和突变型结构因此收紧了活性位点。NO与结合弯曲构象中的野生型和突变型,定向NO O原子朝向α-亚甲基血红素碳原子。水分子网络提供NO配体的氢键网络,表明可能存在质子穿梭途径需要激活氧气进行催化。在野生型结构中,Asp140展示了两种构象,表明Asp140在穿梭中具有动态作用质子从本体溶剂通过水网络到达铁-氧络合物。根据这些结构,我们考虑为什么D140A突变体是非活性的作为血红素加氧酶,但作为过氧化物酶具有活性。
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所选图形 |
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图5。 图5。2F[o]-F[c]电子密度分布图野生型和D140A Fe(II)-NO复合物的1.5s。钥匙氢键相互作用显示为虚线。 |
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图7。 图7。拟议机制的表示人血红素加氧酶-1中的氧活化。注意,在Asp140缺乏稳定的氢键Wat1的侧链,一种默认的过氧化物酶(Fe(IV)-O)中间体已形成。黑色箭头表示增强Wat1的氢氧化能力。 |
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以上数字为重印经爱思唯尔许可:分子生物学杂志(2003,330,527-538)版权所有2003。
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数字是挑选出来的通过自动化流程。
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公共医疗id
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参考
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生物无机化学杂志,16,599-609. |
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PDB代码:
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在底物结合、静息状态的人血红素加氧酶中,远端氢键网络与外源配体的耦合。
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生物化学,48,11231-11242. |
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H.Ogura,
J.P.Evans,
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人血红素加氧酶叠氮底物复合物的轨道基态是远端氢键的指示:酶机制的含义。
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生物化学,48,3127-3137. |
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刘彦,
X.张,
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拉马政府(2009).
1H NMR研究可变配体对血红素加氧酶电子和分子结构的影响。
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血红素加氧酶催化中的异卟啉中间体。α-亚甲基-苯血红素的氧化。
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截短的人血红素加氧酶-2的载脂蛋白和血红素结合晶体结构的比较。
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PDB代码:
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血红素加氧酶的结构和催化机理。
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通过去除血红素而不是破坏远端氢键网络来改变人类血红素加氧酶-1的区域特异性。
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L.H.马,
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和
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脑膜炎奈瑟菌底物结合血红素加氧酶氢氧化物复合物磁性和电子结构的1H NMR研究:轴向水脱质子对远端氢键网络的影响。
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血红素和verdoheme血红素加氧酶-1复合物与FMN缺失的NADPH-细胞色素P450还原酶的反应。verdoheme氧化所需的电子可以通过不涉及FMN的途径进行转移。
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生物化学杂志,281,31659-31667. |
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刘彦,
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通过与底物接触的C末端的裂解,对来自病理细菌脑膜炎奈瑟菌的血红素加氧酶的自发“老化”进行表征。功能研究和晶体结构的含义。
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生物化学,45,3875-3886. |
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J.Wang,
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人类血红素加氧酶的区域特异性决定因素:R183E突变体对NADPH和抗坏血酸依赖性血红素的差异裂解。
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生物化学杂志,280,2797-2806页。 |
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PDB代码:
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L.拉德,
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人血红素加氧酶-1的G139A、G139A-NO和G143H突变体的晶体结构。一个微调的氢键网络控制着加氧酶和过氧化物酶的活性。
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生物无机化学杂志,10,138-146. |
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PDB代码:
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松井,
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远端天冬氨酸在白喉棒状杆菌血红素加氧酶中的作用,HmuO:一种水驱动的氧活化机制。
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PDB代码:
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Y.Higashimoto,
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PDB代码:
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PDB代码:
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PDB代码:
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脑膜炎奈瑟菌NO和CO结合血红素加氧酶的晶体结构。O2激活的含义。
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PDB代码:
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