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转移酶 PDB id
1下8

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
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蛋白质
公元134年。 *
公元141年。 *
公元12年。 *
水域 ×41
*残留物保存分析
PDB id:
1下8
姓名: 转移酶
标题: 与黏着斑激酶的黏着靶向(脂肪)结构域结合的帕西林ld2基序
结构: 粘着斑激酶1。链:a、b、c。片段:黏附靶向。同义词:fadk 1,pp125fak,蛋白酪氨酸激酶2。工程设计:是的。帕西林。链:d,f。片段:paxillin ld2基序。工程设计:是
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:ptk2或fak1或fak。表达单位:大肠杆菌bl21(de3)。表达式_系统_最大值:469008。合成:是的。Other_details:源自人类帕西林的序列
生物单位: 贴片机(来自PQS公司)
分辨率:
2.85Å     R系数:   0.237     无R:   0.275
作者: M.K.Hoellerer、M.E.M.Noble、G.Labesse、J.M.Werner、S.T.Arold
密钥参考:
M.K.Hoeller先生等。(2003).通过焦点粘附靶向结构域对paxillin LD基序的分子识别。结构,11,1207-1217.PubMed编号:14527389 内政部:2016年10月10日/j.str.2003.08.010
日期:
2003年3月28日 发布日期:   2003年10月21日
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 标题
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蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
Q05397问题 (传真_胡曼)-智人黏附斑激酶1
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元1052年。
公元134年。
蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
Q05397问题 (传真_胡曼)-来自智人的粘着斑激酶1
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元1052年。
公元141年。
蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
第49023页 (巴基斯坦胡曼)-来自智人的帕西林
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元591年。
公元12年。
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域

酶反应
2类酶: 链条A、B、C: E.C.2.7.10.2段 -非特异性蛋白酪氨酸激酶。
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: ATP+L-酪氨酸-[蛋白质]=ADP+H++O-磷酸-L-甲酰化-[蛋白质]
列车自动防护系统
+ L-酪氨酸-[蛋白质]
= ADP公司
+ H(+)
+ O-磷酸-L-甲酰化-[蛋白质]
3类酶: 链条D、F: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
从获取的.mol文件生成的分子图KEGG ftp站点

 

 
添加了参考
 
 
DOI编号:2016年10月10日/j.str.2003.08.010 结构 11:1207-1217(2003)
PubMed编号:14527389  
 
 
局部粘附靶向结构域对帕罗西汀LD基序的分子识别。
M.K.Hoeller, M.E.Noble, G.拉巴斯, I.D.Campbell, J.M.沃纳, S.T.阿罗德。
 
  摘要  
 
局灶性粘连(FA)是在位点形成的大型膜下信号复合物细胞与细胞外基质的粘附。LD基序的相互作用其靶标在FA的组装中起着重要作用。我们有通过以下方法确定了识别两个paxillin LD基序的分子基础使用X射线联合检测FA激酶的FAT靶向结构域结晶学、溶液核磁共振和同源建模。四螺旋FAT域显示了与LD结合的分子相对位置上的两个LD结合位点螺旋构象的肽。线程研究表明p95PKL的LD相互作用域与FAT共用一个四螺旋核长春花蛋白的结构域和尾部,定义了LD基序的一个结构家族绑定模块。
 
  所选图形  
 
图3。
图3。FAT与LD的相互作用主题带下划线的标签指LD肽(球状和棒状型号)。FAT域的表面表示为彩色按蓝色,基本;红色,酸性;绿色,疏水。(A)与FAT螺旋1-4结合的LD2和(B)LD4肽(左侧面板)和2-3(右侧面板)。图由伊索(M.E.M.Noble,未发布的数据)。
 
  上图为重印经Cell Press许可:结构(2003,11,1207-1217)版权所有2003。  
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引用此PDB文件关键参考的文献参考

  公共医疗id 参考
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NSP-Cas蛋白结构揭示了细胞信号传导中的一个混杂相互作用模块。
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PDB代码: 第三章第六节 3t6克
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轮状病毒感染时细胞质多聚(A)结合蛋白的核定位涉及NSP3与eIF4G和RoXaN的相互作用。
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paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。
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PDB代码: 2伏零伏 2vzd型 2vzg 2vzi型
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塔林棒IBS2{α}-螺旋与互动{测试}3通过建立电荷互补盐桥的整合素细胞质尾膜近螺旋。
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α-帕金森CH2-paxillin LD1复合物的结构揭示了一种新的黏着灶组装的模块化识别。
  生物化学杂志,283,21113-21119.
PDB代码: 2千伏
18448431 Z.M.Zhang, J.A.Simmerman, C.D.Guibao, J.J.Zheng先生(2008).
GIT1 paxillin-binding结构域是一个四螺旋束,它结合paxillin LD2和LD4基序。
  生物化学杂志,283,18685-18693.
PDB代码: 2jx0个
17932491 G.T.Nhieu, T.伊扎德(2007年)。
通过螺旋加成机制在其闭合构象中结合文丘林。
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PDB代码: 2磅力
17467235 R.Schmalzigaug, M.L.Garron, J.T.罗斯曼, Y.Xing, C.E.Davidson, S.T.Arold, R.T.普雷蒙特(2007年)。
GIT1利用局部粘附靶向同源结构域结合帕西林。
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17277784 S.Lee, A.Joshi, K.Nagashima, E.O.自由, J.H.赫尔利(2007年)。
病毒晚期结构域与Alix结合的结构基础。
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PDB代码: 2ojq公司
17948058 T.Saitoh, 伊古拉先生, T.Obita, T.Ose, R.小岛, K.Maenaka, T.恩多, D.科达(2007年)。
Tom20通过多个结合态之间的动态平衡识别线粒体前序列。
  欧洲工商管理硕士J,26,4777-4787.
PDB代码: 2对1秒 2v1吨
16407060 F.丁, K.C.普鲁兹曼, S.L.坎贝尔, N.V.Dokholyan公司(2006).
蛋白质结构域交换的拓扑决定因素。
  结构,14,5  
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paxillin与聚(A)结合蛋白1的相互作用及其在局部粘附周转和细胞迁移中的作用。
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焦黏附激酶-辅蛋白复合物的结构特征使我们能够深入了解焦黏附组装的动力学。
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15795225 K.Briknarová, F.纳赛托拉比, M.L.哈弗特, E.Eggleston, D.W.霍伊特, C.李, A.J.奥尔森, K.Vuori, K.R.Ely公司(2005).
Crk-相关底物(p130cas)的富含丝氨酸的结构域是一个四螺旋束。
  生物化学杂志,280,21908-21914.
PDB代码: 1z23号机组
15169899 J.M.Dunty, V.Gabarra-Niecko, M.L.金, D.F.塞卡雷利, M.J.Eck, M.D.Schaller先生(2004).
FERM域相互作用促进FAK信号。
  分子细胞生物学,24,5353-5368.  
15130480 K.C.普鲁兹曼, G·高, M.L.金, V.V.Iyer, G.A.Mueller, M.D.Schaller先生, S.L.坎贝尔(2004).
粘着斑激酶的粘着靶向结构域包含调节酪氨酸926磷酸化的铰链区域。
  结构,12,881-891.
PDB代码: 1光伏3
15576030 R.D.Dixon, Y.Chen, F.丁, S.D.哈雷, K.C.普鲁兹曼, M.D.Schaller先生, S.L.坎贝尔, N.V.Dokholyan公司(2004).
基于FAT域折叠中间产物检测对FAK信号和定位的新见解。
  结构,12,2161-2171.  
首先显示最新的参考文献。引用数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将包含越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。

 

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