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PDB总和条目1ow8
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PDB id:
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姓名: |
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转移酶
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标题:
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与黏着斑激酶的黏着靶向(脂肪)结构域结合的帕西林ld2基序 |
结构:
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粘着斑激酶1。链:a、b、c。片段:黏附靶向。同义词:fadk 1,pp125fak,蛋白酪氨酸激酶2。工程设计:是的。帕西林。链:d,f。片段:paxillin ld2基序。工程设计:是 |
资料来源:
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智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:ptk2或fak1或fak。表达单位:大肠杆菌bl21(de3)。表达式_系统_最大值:469008。合成:是的。Other_details:源自人类帕西林的序列 |
生物单位:
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贴片机(来自) |
分辨率:
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2.85Å |
R系数: |
0.237 |
无R: |
0.275 |
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作者:
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M.K.Hoellerer、M.E.M.Noble、G.Labesse、J.M.Werner、S.T.Arold |
密钥参考:
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M.K.Hoeller先生等。(2003).通过焦点粘附靶向结构域对paxillin LD基序的分子识别。结构,11,1207-1217.PubMed编号:
内政部:
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日期:
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2003年3月28日 |
发布日期: |
2003年10月21日 |
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2类酶: |
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链条A、B、C:
E.C.2.7.10.2段
-非特异性蛋白酪氨酸激酶。
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反应: |
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ATP+L-酪氨酸-[蛋白质]=ADP+H++O-磷酸-L-甲酰化-[蛋白质]
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列车自动防护系统
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+
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L-酪氨酸-[蛋白质]
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=
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ADP公司
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+
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H(+)
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+
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O-磷酸-L-甲酰化-[蛋白质]
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3类酶: |
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链条D、F:
电气控制。?
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注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
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DOI编号:
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结构
11:1207-1217(2003) |
PubMed编号:
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局部粘附靶向结构域对帕罗西汀LD基序的分子识别。
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M.K.Hoeller,
M.E.Noble,
G.拉巴斯,
I.D.Campbell,
J.M.沃纳,
S.T.阿罗德。
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摘要 |
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局灶性粘连(FA)是在位点形成的大型膜下信号复合物细胞与细胞外基质的粘附。LD基序的相互作用其靶标在FA的组装中起着重要作用。我们有通过以下方法确定了识别两个paxillin LD基序的分子基础使用X射线联合检测FA激酶的FAT靶向结构域结晶学、溶液核磁共振和同源建模。四螺旋FAT域显示了与LD结合的分子相对位置上的两个LD结合位点螺旋构象的肽。线程研究表明p95PKL的LD相互作用域与FAT共用一个四螺旋核长春花蛋白的结构域和尾部,定义了LD基序的一个结构家族绑定模块。
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所选图形 |
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图3。 图3。FAT与LD的相互作用主题带下划线的标签指LD肽(球状和棒状型号)。FAT域的表面表示为彩色按蓝色,基本;红色,酸性;绿色,疏水。(A)与FAT螺旋1-4结合的LD2和(B)LD4肽(左侧面板)和2-3(右侧面板)。图由伊索(M.E.M.Noble,未发布的数据)。 |
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上图为重印经Cell Press许可:结构(2003,11,1207-1217)版权所有2003。
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数字是挑选出来的通过自动化流程。
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公共医疗id
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参考
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P.D.梅斯,
Y.Wallez,
M.K.Dobaczewska,
J.J.Lee,
H.罗宾逊,
E.B.Pasquale公司,
和
S.J.里德尔(2011).
NSP-Cas蛋白结构揭示了细胞信号传导中的一个混杂相互作用模块。
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自然结构分子生物学,18,1381-1387. |
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PDB代码:
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|
D.S.哈伯格,
和
D.A.Calderwood公司(2009).
整合素信号一目了然。
|
|
细胞科学杂志,122,159-163. |
|
|
|
|
|
M.Harb,
M.M.贝克尔,
D.维图,
C.H.拜伦,
P.Vende,
S.C.布朗,
S.博尔特,
S.T.Arold,
和
D.庞塞(2008).
轮状病毒感染时细胞质多聚(A)结合蛋白的核定位涉及NSP3与eIF4G和RoXaN的相互作用。
|
|
J维罗尔,82,11283-11293. |
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|
|
|
N.O.迪肯,
和
C.E.特纳(2008).
帕西林成年了。
|
|
细胞科学杂志,121,2435-2444页。 |
|
|
|
|
|
S.Lorenz,
I.瓦科纳基斯,
E.D.Lowe,
I.D.Campbell,
M.E.Noble,
和
M.K.Hoeller先生(2008).
paxillin LD基序与alpha-parvin相互作用的结构分析。
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结构,16,1521-1531. |
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PDB代码:
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|
S.Rodius等人,
O.Chaloin,
M.Moes,
E.Schaffner-Reckinger,
I.兰德里欧,
G.Lippens,
林先生,
J.Zhang,
和
N.基弗(2008).
塔林棒IBS2{α}-螺旋与互动{测试}3通过建立电荷互补盐桥的整合素细胞质尾膜近螺旋。
|
|
生物化学杂志,283,24212-24223. |
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X.王,
K.Fukuda,
I.J.再见,
A.Velyvis,
C.吴,
A.Gronenborn,
和
J.秦(2008).
α-帕金森CH2-paxillin LD1复合物的结构揭示了一种新的黏着灶组装的模块化识别。
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生物化学杂志,283,21113-21119. |
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PDB代码:
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Z.M.Zhang,
J.A.Simmerman,
C.D.Guibao,
和
J.J.Zheng先生(2008).
GIT1 paxillin-binding结构域是一个四螺旋束,它结合paxillin LD2和LD4基序。
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生物化学杂志,283,18685-18693. |
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PDB代码:
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G.T.Nhieu,
和
T.伊扎德(2007年)。
通过螺旋加成机制在其闭合构象中结合文丘林。
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欧洲工商管理硕士J,26,4588-4596. |
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PDB代码:
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R.Schmalzigaug,
M.L.Garron,
J.T.罗斯曼,
Y.Xing,
C.E.Davidson,
S.T.Arold,
和
R.T.普雷蒙特(2007年)。
GIT1利用局部粘附靶向同源结构域结合帕西林。
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|
单元格信号,19,1733-1744. |
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|
S.Lee,
A.Joshi,
K.Nagashima,
E.O.自由,
和
J.H.赫尔利(2007年)。
病毒晚期结构域与Alix结合的结构基础。
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|
自然结构分子生物学,14,194-199. |
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PDB代码:
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T.Saitoh,
伊古拉先生,
T.Obita,
T.Ose,
R.小岛,
K.Maenaka,
T.恩多,
和
D.科达(2007年)。
Tom20通过多个结合态之间的动态平衡识别线粒体前序列。
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欧洲工商管理硕士J,26,4777-4787. |
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PDB代码:
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F.丁,
K.C.普鲁兹曼,
S.L.坎贝尔,
和
N.V.Dokholyan公司(2006).
蛋白质结构域交换的拓扑决定因素。
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结构,14,5 |
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A.J.伍兹,
T.Kantidakis,
H.Sabe等人,
D.R.Critchley,
和
J.C.诺曼(2005).
paxillin与聚(A)结合蛋白1的相互作用及其在局部粘附周转和细胞迁移中的作用。
|
|
分子细胞生物学,25,3763-3773. |
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C.M.贝托卢奇,
C.D.Guibao,
和
J.郑(2005).
焦黏附激酶-辅蛋白复合物的结构特征使我们能够深入了解焦黏附组装的动力学。
|
|
蛋白质科学,14,644-652. |
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|
K.Briknarová,
F.纳赛托拉比,
M.L.哈弗特,
E.Eggleston,
D.W.霍伊特,
C.李,
A.J.奥尔森,
K.Vuori,
和
K.R.Ely公司(2005).
Crk-相关底物(p130cas)的富含丝氨酸的结构域是一个四螺旋束。
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|
生物化学杂志,280,21908-21914. |
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PDB代码:
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|
J.M.Dunty,
V.Gabarra-Niecko,
M.L.金,
D.F.塞卡雷利,
M.J.Eck,
和
M.D.Schaller先生(2004).
FERM域相互作用促进FAK信号。
|
|
分子细胞生物学,24,5353-5368. |
|
|
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|
|
K.C.普鲁兹曼,
G·高,
M.L.金,
V.V.Iyer,
G.A.Mueller,
M.D.Schaller先生,
和
S.L.坎贝尔(2004).
粘着斑激酶的粘着靶向结构域包含调节酪氨酸926磷酸化的铰链区域。
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|
结构,12,881-891. |
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PDB代码:
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R.D.Dixon,
Y.Chen,
F.丁,
S.D.哈雷,
K.C.普鲁兹曼,
M.D.Schaller先生,
S.L.坎贝尔,
和
N.V.Dokholyan公司(2004).
基于FAT域折叠中间产物检测对FAK信号和定位的新见解。
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结构,12,2161-2171. |
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首先显示最新的参考文献。引用数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将包含越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。
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