|
PDB总和条目1mkp
|
|
|
|
|
|
酶类1: |
|
E.C.3.1.3.16节
-蛋白-氨基酸/苏氨酸磷酸酶。
|
|
|
|
|
|
|
反应: |
|
1 |
H2O+O-磷酸-L-烯丙基-[蛋白质]=L-烯丙基-[蛋白质]+磷酸盐 |
2 |
H2O+O-磷酸-L-三甲酰基-[蛋白质]=L-苏氨酸-[蛋白质]+磷酸盐 |
|
|
|
|
|
|
水
|
+
|
O-磷酸-L-芳基-[蛋白质]
|
=
|
L-丝氨酸[蛋白质]
|
+
|
磷酸盐
|
|
|
|
|
|
|
水
|
+
|
O-磷酸-L-三酰-[蛋白质]
|
=
|
L-苏氨酸-[蛋白质]
|
+
|
磷酸盐
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2类酶: |
|
E.C.3.1.3.48代码
-蛋白酪氨酸磷酸酶。
|
|
|
|
|
|
|
反应: |
|
H2O+O-磷酸-L-酪氨酸-[蛋白质]=L-酪氨酸-(蛋白质)+磷酸盐
|
|
|
|
|
|
水
|
+
|
O-磷酸-L-甲酰化-[蛋白质]
|
=
|
L-酪氨酸-[蛋白质]
|
+
|
磷酸盐
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
DOI编号:
|
自然结构生物
6:174-181(1999) |
PubMed编号:
|
|
|
|
|
|
MAPK磷酸酶Pyst1催化域的晶体结构和调控活化的意义。
|
A.E.Stewart,
S.Dowd,
S.M.Keyse公司,
N.Q.McDonald公司。
|
|
|
|
|
摘要 |
|
|
|
|
MAPK磷酸酶Pyst1催化结构域的晶体结构(Pyst1-CD)已在2.35 A下测定。结构采用蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTPase)折叠有一个浅活性位点,显示在没有衬底的情况下几何畸变,与双特异性磷酸酶cdc25。Pyst1-CD的功能表征表明其足以在体外对活化的ERK2去磷酸化。运动的使用底物对硝基苯磷酸盐分析Pyst1和Pyst1-CD(pNPP)表明这两种分子在存在的情况下都会发生催化活化重组非活性ERK2,从低活性形式转换为高活性形式。位于活性位点远端5.5 A的Asp 262的突变表明它是对高活性ERK2依赖构象的催化至关重要Pyst1,但不适用于低活性ERK2依赖型,这表明ERK2诱导激活位点上的Asp 262环闭合,从而增强Pyst1催化效率。
|
|
|
|
|
|
所选图形 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
图3。 图3。氯离子显示为一个氰球,即氧水分子的原子作为红色球体和Trp 264对称相关分子被画成紫色。b、 叠加PTP−回路、假定的通用酸回路和变量Pyst1−CD(标准元素颜色)的插入顺序VHR的等效区域(绿色)。选定的侧链所示为Pyst1−CD和VHR,Pyst1–CD侧链为标记。磷酸结合Arg 130之间的氢键VHR和残基69和90中的羰基氧是展示。为了清楚起见,省略了Pyst1−CD的氯离子。c、,Pyst1−CD相同区域和侧链的叠加带PTP1B(紫色)。PTP1B的Arg 221触点Glu 115和残基110和179的羰基氧。d、 的叠加cdc25a与Pyst1−CD的等效区域,突出显示Cyscdc25a的430、Glu 431和Arg 436。尽管这些磷酸酶是相似的,它们的拓扑折叠是完全不同^[297]5.这两种结构具有r.m.s。55℃[298]α原子1.89℃的差值这个图使用SETOR^[299]32编制。 |
|
图6。 图6。Pyst1与ERK2.Pyst1−CD(绿色)的结构叠加在PTP1B(PDB登录代码1PTV)的坐标。残留Tyr185个活化的ERK2被叠加到磷酸化酪氨酸上PTP1B活性位点内的底物。这种转变然后应用于激活ERK2的整个坐标集(PDB登录代码2ERK)。磷酸化残基Thr 183和ERK2上突出显示了Tyr 185和Asp 319主干(青色)。果蝇Asp319突变为AsnSevenmaker MAPK导致MAPK抵抗和无法抵抗与Pyst1交互(10)。我们假设Pyst1−ND与Asp 319建立联系,正是这种相互作用受到塞文梅克变异株干扰。模型基于cdc25的Pyst1氨基−末端结构域(Pyst1−ND)结构(PDB登录代码1CD25)也显示为红色,将Pyst1−ND的非催化活性位点定位为联系Asp 319。连接回路(残留物148−203)在Pyst1−ND和Pyst1−CD域之间表示为白色圆点。 |
|
|
|
|
|
以上数字为重印经麦克米伦出版有限公司许可:自然结构生物(1999,6,174-181)版权所有1999。
|
|
|
数字是挑选出来的通过自动化流程。
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
引用此PDB文件关键参考的文献参考 |
谷歌学者 |
|
|
|
公共医疗id
|
|
参考
|
|
|
|
|
J.Pytela,
加藤,
和
桥本T(2010).
有丝分裂原激活的蛋白激酶磷酸酶PHS1通过核挤压信号依赖和独立机制保留在细胞质中。
|
|
植物,231,1311-1322. |
|
|
|
|
|
D.G.Jeong,
S.K.Jung,
T.S.Yoon,
吴振杰,
J.H.Kim,
卑诗省公园,
S.E.Ryu,
和
S.J.金(2009).
人类MKP-2催化结构域的晶体结构显示出24聚体组装。
|
|
蛋白质,76,763-767. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
G.莫利纳,
A.沃格特,
A.Bakan,
戴伟,
P.Queoz de Oliveira,
W.Znosko,
T.E.Smithgall,
I.巴哈,
J.S.拉佐,
B.W.日,
和
曾荫权(M.Tsang)(2009).
斑马鱼的化学筛选揭示了Dusp6的抑制剂,它可以扩展心脏细胞谱系。
|
|
自然化学生物,5,680-687. |
|
|
|
|
|
李连杰,
S.F.Chen,
和
刘彦(Y.Liu)(2009).
MAP激酶磷酸酶-1,先天免疫反应的关键负调节因子。
|
|
国际临床实验医学杂志,2,48-67. |
|
|
|
|
|
A.Bakan,
J.S.拉佐,
P.Wipf等人,
K.M.布鲁蒙德,
和
I.巴哈(2008年)。
对双特异性磷酸酶与底物相互作用的分子理解:基于结构的建模和高通量筛选的见解。
|
|
当前医学化学,15,2536-2544. |
|
|
|
|
|
J.A.Ralph,
和
E.F.Morand公司(2008年)。
MAPK磷酸酶作为类风湿关节炎的新靶点。
|
|
专家操作目标,12,795-808. |
|
|
|
|
|
J.K.马克,
R.A.Aubin,
S.Smith,
和
M.A.海福德(2008年)。
通过结构域间结合抑制有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶3的活性。
|
|
生物化学杂志,283,28574-28583. |
|
|
|
|
|
K.Lee,
E.H.宋,
H.S.Kim,
J.H.Yoo,
韩海杰,
M.S.Jung,
S.M.Lee,
K.E.Kim,
M.C.Kim,
M.J.Cho,
和
W.S.Chang公司(2008年)。
拟南芥中钙调蛋白对MAPK磷酸酶1(AtMKP1)的调节。
|
|
生物化学杂志,283,23581-23588. |
|
|
|
|
|
M.Ekerot,
M.P.斯塔夫里迪斯,
L.Delavaine,
M.P.米切尔,
C.装订,
D.M.Owens,
I.D.Keenan,
R.J.狄金森,
K.G.楼层,
和
S.M.凯斯(2008年)。
DUSP6/MKP-3对FGF信号的负反馈调节由ERK1/2驱动,并由与DUSP6/MKP-3基因启动子内保守位点结合的Ets因子介导。
|
|
生物化学杂志,412,287-298. |
|
|
|
|
|
R.J.Gruninger,
L.Brent Selinger,
和
S.C.莫西曼(2008年)。
离子强度和氧化对蛋白质酪氨酸磷酸酶样植酸酶(PhyAsr)P-loop构象的影响。
|
|
2月J日,275,3783-3792. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
S.Kurita,
渡边Y,
E.Gunji,
K.Ohashi,
和
K.瑞穗(2008年)。
Cofilin磷酸酶Slingshot底物识别和F-肌动蛋白介导活化机制的分子解剖。
|
|
生物化学杂志,283,32542-32552. |
|
|
|
|
|
A.K.诺德,
P.Rios,
A.高尔顿,
R.Pulido,
T.K.阿特伍德,
和
L.塔伯内罗(2007).
MAPK磷酸酶结构域的功能分配。
|
|
蛋白质,69,19-31. |
|
|
|
|
|
D.G.Jeong,
Y.H.Cho,
T.S.Yoon,
J.H.金,
S.E.Ryu,
和
S.J.金(2007).
人DUSP5催化结构域的晶体结构,DUSP5是一种双特异性MAP激酶蛋白磷酸酶。
|
|
蛋白质,66,253-258. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
D.M.Arnold,
C.福斯特,
D.M.Huryn,
J.S.拉佐,
P.A.Johnston,
和
P.擦拭(2007).
有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶抑制剂聚焦文库的合成和生物活性。
|
|
化学生物药物设计,69,23-30. |
|
|
|
|
|
D.M.欧文斯,
和
S.M.凯斯(2007).
双特异性蛋白磷酸酶对MAP激酶信号的差异调节。
|
|
癌基因,26,3203-3213. |
|
|
|
|
|
P.Chiarugi,
和
F.布里奇(2007).
蛋白质酪氨酸磷酸化和可逆氧化:翻译后的两种交叉修饰。
|
|
抗氧化剂氧化还原信号,9,1 |
|
|
|
|
|
S.J.Kim,
D.G.Jeong,
T.S.Yoon,
儿子J.H,
S.K.Cho公司,
S.E.Ryu,
和
J.H.金(2007).
人类TMDP的晶体结构,一种睾丸特异性双特异性蛋白磷酸酶:对底物特异性的影响。
|
|
蛋白质,66,239-245. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
S.K.Jung,
D.G.Jeong,
T.S.Yoon,
J.H.金,
S.E.Ryu,
和
S.J.金(2007).
人弹弓磷酸酶2的晶体结构。
|
|
蛋白质,68,408-412. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
T.横田,
Y.Nara,
A.鹿岛,
K.Matsubara,
S.Misawa,
加藤(R.Kato),
和
S.Sugio公司(2007).
人类双特异性磷酸酶(JNK刺激性磷酸酶-1)的晶体结构,分辨率为1.5A。
|
|
蛋白质,66,272-278. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
X.陶,
和
L.Tong先生(2007).
人MKP5的MAP激酶结合结构域和催化结构域的晶体结构。
|
|
蛋白质科学,16,880-886. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
X.王,
和
刘彦(Y.Liu)(2007).
MAP激酶磷酸酶-1对先天性免疫反应的调节。
|
|
单元格信号,19,1372-1382. |
|
|
|
|
|
B.周,
J.Zhang,
刘S,
S.Reddy,
F.Wang,
和
Z.Y.Zhang先生(2006年)。
通过氢/氘交换质谱法绘制ERK2-MKP3结合界面。
|
|
生物化学杂志,281,38834-38844之间。 |
|
|
|
|
|
D.G.Jeong,
Y.H.Cho,
T.S.Yoon,
J.H.金,
儿子J.H,
S.E.Ryu,
和
S.J.Kim公司(2006年)。
双特异性蛋白酪氨酸磷酸酶家族成员人类DSP18的结构。
|
|
Acta Crystallogr D生物晶体仪,62,582-588. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
A.沃格特,
A.塔梅维茨,
J.Skoko,
R.P.西科尔斯基,
K.A.朱利亚诺,
和
J.S.拉佐(2005).
苯并[c]菲咯啶生物碱血根碱是一种有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶-1的选择性细胞活性抑制剂。
|
|
生物化学杂志,280,19078-19086. |
|
|
|
|
|
G.R.克里斯蒂,
D.J.威廉姆斯,
F.Macisaac,
R.J.狄金森,
I.罗斯韦尔,
和
S.M.凯斯(2005).
双特异性蛋白磷酸酶DUSP9/MKP-4对胎盘功能至关重要,但对正常胚胎发育来说不是必需的。
|
|
分子细胞生物学,25,8323-8333. |
|
|
|
|
|
吴建杰,
L.Zhang,
和
A.M.贝内特(2005).
有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶1的非催化氨基末端指导核靶向和血清反应元件转录调控。
|
|
分子细胞生物学,25,4792-4803. |
|
|
|
|
|
M.Mandl,
D.N.Slack公司,
和
S.M.凯斯(2005).
诱导型双特异性蛋白磷酸酶DUSP5对细胞外信号调节激酶2的特异性失活和核锚定。
|
|
分子细胞生物学,25,1830-1845. |
|
|
|
|
|
S.Marchetti,
C.吉蒙德,
J.C.Chambard,
T.图布尔,
D.鲁,
J.Pouysségur,
和
G.帕格斯(2005).
细胞外信号调节激酶磷酸化丝氨酸159和197处丝氨酸活化蛋白激酶磷酸酶3/DUSP6,这两个位置对其蛋白酶体降解至关重要。
|
|
分子细胞生物学,25,854-864. |
|
|
|
|
|
T.S.Yoon,
D.G.Jeong,
J.H.金,
Y.H.Cho,
儿子J.H,
J.W.Lee,
S.E.Ryu,
和
S.J.金(2005).
人类VHY催化域的晶体结构,一种双特异性蛋白磷酸酶。
|
|
蛋白质,61,694-697. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
A.阿隆索,
S.Burkhalter,
J.Sasin,
L.Tautz,
J.Bogetz,
H.Huynh,
M.C.布雷默,
L.J.霍尔辛格,
A.Godzik,
和
T.马斯特林(2004).
新型16-kDa VH1样磷酸酶VHZ揭示了基于半胱氨酸的蛋白酪氨酸磷酸酶的最小基本核心。
|
|
生物化学杂志,279,35768-35774. |
|
|
|
|
|
A.Kar-Roy,
H.Korkaya,
R.Oberoi,
S.K.Lal,
和
S.Jameel公司(2004).
戊型肝炎病毒开放阅读框3蛋白通过结合和抑制MAPK磷酸酶激活ERK。
|
|
生物化学杂志,279,28345-28357. |
|
|
|
|
|
G.科兹洛夫,
J.Cheng,
E.Ziomek,
D.Banville,
K.Gehring,
和
一、伊基尔(2004).
转移相关磷酸酶PRL-3分子功能的结构见解。
|
|
生物化学杂志,279,11882-11889. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
M.Karlsson,
J.Mathers,
R.J.Dickinson,
M.Mandl,
和
S.M.凯斯(2004).
双特异性磷酸酶MKP-3的核-细胞质穿梭及其在细胞质中锚定MAP激酶的能力均由保守的核输出信号介导。
|
|
生物化学杂志,279,41882-41891. |
|
|
|
|
|
A.沃格特,
K.A.Cooley,
布里森先生,
M.G.塔普利,
P.Wipf、,
和
J.S.拉佐(2003).
通过高含量筛选确定的细胞活性双特异性磷酸酶抑制剂。
|
|
化学生物学,10,733-742. |
|
|
|
|
|
J.Zhang,
B.周,
C.F.Zheng先生,
和
Z.Y.Zhang先生(2003).
ERK2被其同源调节物和底物识别的双重机制。
|
|
生物化学杂志,278,29901-29912. |
|
|
|
|
|
Y.Kim,
A.E.赖斯,
和
J.M.德努(2003).
MKP3对ERK的分子内脱磷作用。
|
|
生物化学,42,15197-15207. |
|
|
|
|
|
A.狄奥多西,
和
A.阿什沃思(2002).
MAP激酶磷酸酶类。
|
|
基因组生物学,3,审查3009。 |
|
|
|
|
|
Z.Y.Zhang先生(2002).
蛋白质酪氨酸磷酸酶:结构和功能、底物特异性和抑制剂开发。
|
|
药物毒理学年鉴,42,209-234. |
|
|
|
|
|
Z.Y.Zhang,
B.周,
和
谢立群(L.Xie)(2002).
蛋白磷酸酶和抑制剂对蛋白激酶信号的调节。
|
|
药物治疗学,93,307-317. |
|
|
|
|
|
A.Farooq,
查图尔维迪,
S.Mujtaba,
O.Plotnikova,
曾立群,
C.Dhalluin,
R.阿什顿,
和
M.M.周(2001).
MAPK磷酸酶MKP-3 ERK2结合域的溶液结构:ERK2激活MKP-3的结构见解。
|
|
分子电池,7,387-399. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
H.Song,
N.Hanlon,
N.R.布朗,
M.E.Noble,
L.N.约翰逊,
和
D.巴福德(2001).
激酶相关磷酸酶与磷酸化CDK2复合物的晶体结构揭示了磷酸蛋白与蛋白质的相互作用。
|
|
分子电池,7,615-626. |
|
PDB代码:
|
|
|
|
|
|
|
J.D.Rigas,
R.H.霍夫,
A.E.赖斯,
A.C.恒格,
和
J.M.德努(2001).
细胞外调节激酶完全激活双特异性磷酸酶MKP3的Asp-262通用酸碱催化剂的过渡态分析和要求。
|
|
生物化学,40,4398-4406. |
|
|
|
|
|
T·张,
M.W.Wolfe,
和
M.S.罗伯逊(2001).
促性腺激素释放激素诱导的有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶2基因表达需要一个早期生长反应蛋白(Egr)1顺式元件。
|
|
生物化学杂志,276,45604-45613. |
|
|
|
|
|
B.O.Krogh,
和
S.舒曼(2000).
DNA拓扑异构酶IB的催化机理。
|
|
分子电池,5,1035-1041. |
|
|
|
|
|
C.C.Fjeld,
A.E.赖斯,
Y.Kim,
K.R.Gee,
和
J.M.德努(2000).
细胞外信号调节激酶催化活化丝裂原活化蛋白激酶磷酸酶3的机制基础。
|
|
生物化学杂志,275,6749-6757. |
|
|
|
|
|
S.M.Keyse公司(2000).
蛋白磷酸酶和有丝分裂原激活的蛋白激酶信号的调节。
|
|
Curr Opin细胞生物学,12,186-192. |
|
|
|
|
|
S.Zolnierowicz,
和
M.Bollen先生(2000).
蛋白质磷酸化和蛋白质磷酸酶。比利时De Panne,1999年9月19日至24日。
|
|
欧洲工商管理硕士J,19,483-488之间。 |
|
|
|
|
|
B.周,
和
Z.Y.Zhang先生(1999).
ERK2激活有丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶-3的机制。
|
|
生物化学杂志,274,35526-35534. |
|
|
|
|
首先显示最新的参考文献。引文数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将包含越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。
|
');
}
}
|