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PDB总和条目1i1o
转至PDB代码:
电子传输
PDB id
1i1o公司
加载。。。
目录
蛋白质
链
公元147年。
*
配体
FMN(飞行管理号码)
水域
×142
*
残留物保存分析
PDB id:
1i1o公司
链接
PDBe公司
RCSB公司
MMDB公司
耶拿图书馆
蛋白质体
阴极
SCOP公司
PDBSWS公司
PDBePISA公司
ProSAT项目
姓名:
电子传输
标题:
室温晶体结构黄曲霉毒素d.普通突变体y98h,分辨率2.0 ang
结构:
黄酮多辛。
链:a.碎片:主链。
工程设计:是的。
突变:是
资料来源:
普通脱硫弧菌。生物体_抗原:881。
表达单位:大肠杆菌。
表达式系统最大值:562
分辨率:
2.00Å
R系数:
0.172
作者:
R.A.Reynolds、W.Watt、K.D.Watenpaugh
密钥参考:
R.A.Reynolds公司
等。
(2001).
黄曲霉毒素Y98H(2.0A)和Y98W(1.5A)突变体的结构与比较。
Acta Crystallogr D生物晶体仪
,
57
,
527-535.
PubMed编号:
11264581
内政部:
10.1107/S090744490102554
日期:
2001年2月2日
发布日期:
2001年4月4日
检查
标题
工具书类
蛋白质链
?
P00323号
(FLAV_DESVH)-
普通脱硫弧菌黄酮(ATCC 29579/DSM 644/NCIMB 8303/VKM B-1760/Hildenborough株)
序号:
结构:
公元148年。
公元147年。
*
密钥:
PfamA域
二级结构
CATH域
*
PDB和UniProt序列不同
2个残留位置(黑色
十字架)
酶反应
酶类:
电气控制。?
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
DOI编号:
10.1107/S090744490102554
Acta Crystallogr D生物晶体仪
57
:527-535
(2001年)
PubMed编号:
11264581
黄曲霉毒素Y98H(2.0A)和Y98W(1.5A)突变体的结构与比较。
R.A.雷诺兹,
瓦特,
K.D.Watenpaugh公司。
摘要
普通脱硫弧菌Tyr98位点两个突变体的结构
黄曲霉毒素已被测定。
第一种是酪氨酸对组氨酸(Y98H)
变量,以2.0 A的中等高分辨率测定,而
酪氨酸-色氨酸变体(Y98W)产生了非常高的分辨率数据(超过
1.5 A)允许详细观察水结构,交替侧链
FMN的构象和平面度。
这两个结构都由求解
以天然(P2A)坐标开始的分子替换
点。
普通D.vulgaris黄曲霉毒素的Y98H变异体在空间群中结晶
P2(1)2(1)2中(1),单位-细胞参数a=41.96,b=61.45,c=57.04 a,
而Y98W突变体采用空间群P2(1),a=41.29,b=55.82,c=
32.52安,β=100.68度。
利用PROLSQ对两个突变体进行优化
其次,对于高分辨率Y98W结构,各向异性细化为
在SHELXL中实施。
Y98H突变体的最终R因子为17%
获得了Y98W突变体。
对于高分辨率(1.5 A)Y98W突变体,
从单晶中收集了31010个独特的反射波。
最终模型
包括273个溶剂分子,八个侧链假设为多重
构象。
在这个分辨率下,FMN的详细构造可以是
观察到,同时注意到弓形和扭转。
以下是比较
这两个突变体和天然黄曲霉毒素的不同氧化状态。
尽管两个突变体都显示出相似的E(2)(氧化/半醌)单电子
天然氧化还原电位,E(1)(半醌/对苯二酚)氧化还原
Y98H突变体的潜力与Y98W突变体的潜能显著不同
变体和天然蛋白质。
褶皱的惊人相似性
两个突变体之间的多肽链60-64和
讨论了native。
黄素中O61和N5之间的相互作用是
因为这个回路的新构造而被讨论。
所选图形
图4。
图4 Y98W(D.vulgaris)FMN区域的立体叠加
(蓝色)、G61A(D.vulgaris)(绿色)和C.beijerinckii(金色)。
图5。
图5 Val88周围电子密度的代表性视图
具有基本上同等占据的交替构象。
密度为2F[o]-F[c],等高线为1
.
以上数字为
重印
经IUCr许可:
Acta Crystallogr D生物晶体仪
(2001,
57
,
527-535)
版权所有2001。
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引用此PDB文件关键参考的文献参考
公共医疗id
参考
21280122
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生物化学杂志
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首先显示最新的参考文献。
引用数据部分来自
CiteXlore公司
和部分
从自动收割过程中。
请注意,这可能是
由于并非所有期刊都包含在
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然而,我们正在不断建立引文数据
因此,随着时间的推移,将包含越来越多的参考文献。
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