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电子传输 PDB id
1i1o公司

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元147年。 *
配体
FMN(飞行管理号码)
水域×142
*残留物保存分析
PDB id:
1i1o公司
姓名: 电子传输
标题: 室温晶体结构黄曲霉毒素d.普通突变体y98h,分辨率2.0 ang
结构: 黄酮多辛。链:a.碎片:主链。工程设计:是的。突变:是
资料来源: 普通脱硫弧菌。生物体_抗原:881。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562
分辨率:
2.00Å     R系数:   0.172    
作者: R.A.Reynolds、W.Watt、K.D.Watenpaugh
密钥参考:
R.A.Reynolds公司等。(2001).黄曲霉毒素Y98H(2.0A)和Y98W(1.5A)突变体的结构与比较。Acta Crystallogr D生物晶体仪,57,527-535.PubMed编号:11264581 内政部:10.1107/S090744490102554
日期:
2001年2月2日 发布日期:   2001年4月4日
检查
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
P00323号 (FLAV_DESVH)-普通脱硫弧菌黄酮(ATCC 29579/DSM 644/NCIMB 8303/VKM B-1760/Hildenborough株)
序号:
结构:
公元148年。
公元147年。*
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同2个残留位置(黑色十字架)

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】

 

 
DOI编号:10.1107/S090744490102554 Acta Crystallogr D生物晶体仪 57:527-535(2001年)
PubMed编号:11264581  
 
 
黄曲霉毒素Y98H(2.0A)和Y98W(1.5A)突变体的结构与比较。
R.A.雷诺兹, 瓦特, K.D.Watenpaugh公司。
 
  摘要  
 
普通脱硫弧菌Tyr98位点两个突变体的结构黄曲霉毒素已被测定。第一种是酪氨酸对组氨酸(Y98H)变量,以2.0 A的中等高分辨率测定,而酪氨酸-色氨酸变体(Y98W)产生了非常高的分辨率数据(超过1.5 A)允许详细观察水结构,交替侧链FMN的构象和平面度。这两个结构都由求解以天然(P2A)坐标开始的分子替换点。普通D.vulgaris黄曲霉毒素的Y98H变异体在空间群中结晶P2(1)2(1)2中(1),单位-细胞参数a=41.96,b=61.45,c=57.04 a,而Y98W突变体采用空间群P2(1),a=41.29,b=55.82,c=32.52安,β=100.68度。利用PROLSQ对两个突变体进行优化其次,对于高分辨率Y98W结构,各向异性细化为在SHELXL中实施。Y98H突变体的最终R因子为17%获得了Y98W突变体。对于高分辨率(1.5 A)Y98W突变体,从单晶中收集了31010个独特的反射波。最终模型包括273个溶剂分子,八个侧链假设为多重构象。在这个分辨率下,FMN的详细构造可以是观察到,同时注意到弓形和扭转。以下是比较这两个突变体和天然黄曲霉毒素的不同氧化状态。尽管两个突变体都显示出相似的E(2)(氧化/半醌)单电子天然氧化还原电位,E(1)(半醌/对苯二酚)氧化还原Y98H突变体的潜力与Y98W突变体的潜能显著不同变体和天然蛋白质。褶皱的惊人相似性两个突变体之间的多肽链60-64和讨论了native。黄素中O61和N5之间的相互作用是因为这个回路的新构造而被讨论。
 
  所选图形  
 
图4。
图4 Y98W(D.vulgaris)FMN区域的立体叠加(蓝色)、G61A(D.vulgaris)(绿色)和C.beijerinckii(金色)。
图5。
图5 Val88周围电子密度的代表性视图具有基本上同等占据的交替构象。密度为2F[o]-F[c],等高线为1.
 
  以上数字为重印经IUCr许可:Acta Crystallogr D生物晶体仪(2001,57,527-535)版权所有2001。  
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引用此PDB文件关键参考的文献参考

  公共医疗id 参考
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工程化Tyr到Trp替代物的局部环境在探索FIS变性机制中的作用。
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