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电子传输 PDB id
1千伏

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元147年。 *
配体
二氧化硫 ×4
FMN(飞行管理号码)
水域 ×125
*残留物保存分析
PDB id:
1千伏
姓名: 电子传输
标题: 普通石斛D95a半醌黄曲霉毒素突变体
结构: 黄酮多辛。链条:a.工程设计:是的。突变:是的。其他_详细信息:半醌
资料来源: 普通脱硫弧菌亚种。希尔登堡Vulgaris街。有机体_出租车:882。菌株:希尔登堡。细胞_位置:细胞质。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562。
分辨率:
2.00Å R系数:   0.200     无R:   0.250
作者: A.Mccarthy、M.Walsh、T.Higgins
密钥参考:
A.A.麦卡锡等。(2002).天冬氨酸95在调节普通脱硫弧菌黄曲霉毒素氧化还原电位中作用的结晶研究。生物化学,41,10950-10962.PubMed编号:12206666 DOI(操作界面):10.1021/bi020225小时
日期:
1997年5月27日 发布日期:   1998年12月2日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
P00323号 (FLAV_DESVH)-普通脱硫弧菌黄酮(ATCC 29579/DSM 644/NCIMB 8303/VKM B-1760/Hildenborough株)
序号:
结构:
公元148年。
公元147年。*
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同1个残留位置(黑色交叉)

酶反应
酶类: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG] 【布伦达】

 

 
DOI编号:10.1021/bi020225小时 生物化学 41:10950-10962(2002)
PubMed编号:12206666  
 
 
天冬氨酸95在调节普通脱硫弧菌黄曲霉毒素氧化还原电位中作用的结晶研究。
A.A.McCarthy, M.A.Walsh, C.S.维玛, D.P.奥康奈尔, M.Reinhold, G.N.亚洛韦, D.D’Arcy, T.M.希金斯, G.Voordouw, S.G.梅休。
 
  摘要  
 
普通脱硫弧菌黄曲霉毒素中天冬氨酸95的侧链提供与蛋白质中结合FMN的N(1)最近的负电荷。使用定点突变替代丙氨酸、天冬酰胺或谷氨酸对这种氨基酸的影响,以评估这种电荷对FMN辅因子的半醌/对苯二酚氧化还原电位(E(1))。D95A突变使E(1)氧化还原电位正移16 mV,而负移氧化/半醌中点氧化还原电位发生23 mV的位移(E(2))。氧化型和半醌型的晶体结构突变体类似于野生型蛋白质的相应状态。与野生型蛋白质相比,在氢醌形式的D95A突变体。Y98的侧链翻转为与边界FMN进行更有利的边对面交互。考虑到D95A突变体的结构变化分析FMN结合位点的静电相互作用表明pi-pi静电斥力对极低的E(1)只有很小的贡献FMN辅因子与脱黄素毒素结合时的氧化还原电位。替换含谷氨酸的D95只引起两个单电子的轻微扰动FMN辅因子的氧化还原电位。D95E突变体的结构揭示了60-环(残基60-64)从黄烷中的大量移动氧化结构。将该突变体还原为对苯二酚导致60-环的构造,以恢复到结构中发生的构造野生型蛋白质。D95E突变体的晶体结构表明95位侧链上羧酸盐之间的静电排斥Y98的酚环阻止了Y98侧链的旋转D95A突变体中出现的能量有利构象。更换D95和天冬酰胺对E(2)没有影响,但使E(1)变化45 mV。D95N突变体未能结晶。蛋白质FMN的K(d)值所有三种氧化还原状态下的络合物与野生型复合物。分子模拟表明蛋白质随氧化还原状态而变化,在质量上与观察到K(d)的变化,并允许FMN和周围各组对蛋白质进行定量。
 

引用此PDB文件关键参考的文献参考

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PDB代码: 1年
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