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PDB总和条目1akv
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DOI编号:
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生物化学
41:10950-10962(2002) |
PubMed编号:
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天冬氨酸95在调节普通脱硫弧菌黄曲霉毒素氧化还原电位中作用的结晶研究。
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A.A.McCarthy,
M.A.Walsh,
C.S.维玛,
D.P.奥康奈尔,
M.Reinhold,
G.N.亚洛韦,
D.D’Arcy,
T.M.希金斯,
G.Voordouw,
S.G.梅休。
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摘要 |
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普通脱硫弧菌黄曲霉毒素中天冬氨酸95的侧链提供与蛋白质中结合FMN的N(1)最近的负电荷。使用定点突变替代丙氨酸、天冬酰胺或谷氨酸对这种氨基酸的影响,以评估这种电荷对FMN辅因子的半醌/对苯二酚氧化还原电位(E(1))。D95A突变使E(1)氧化还原电位正移16 mV,而负移氧化/半醌中点氧化还原电位发生23 mV的位移(E(2))。氧化型和半醌型的晶体结构突变体类似于野生型蛋白质的相应状态。在与野生型蛋白质相比,在氢醌形式的D95A突变体。Y98的侧链翻转为与边界FMN进行更有利的边对面交互。考虑到D95A突变体的结构变化分析FMN结合位点的静电相互作用表明pi-pi静电斥力对极低的E(1)只有很小的贡献FMN辅因子与脱黄素毒素结合时的氧化还原电位。替换含谷氨酸的D95只引起两个单电子的轻微扰动FMN辅因子的氧化还原电位。D95E突变体的结构揭示了60-环(残基60-64)从黄烷中的大量移动氧化结构。将该突变体还原为对苯二酚导致60-环的构造,以恢复到结构中发生的构造野生型蛋白质。D95E突变体的晶体结构表明95位侧链上羧酸盐之间的静电排斥Y98的酚环阻止了Y98侧链的旋转D95A突变体中出现的能量有利构象。更换D95和天冬酰胺对E(2)没有影响,但使E(1)变化45 mV。D95N突变体未能结晶。蛋白质FMN的K(d)值所有三种氧化还原状态下的络合物与野生型复合物。分子模拟表明蛋白质随氧化还原状态而变化,在质量上与观察到K(d)的变化,并允许FMN和周围各组对蛋白质进行定量。
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公共医疗id
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参考
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R.约翰逊,
E.激流,
D.伦丁,
J.Sprenger,
M.Sahlin,
B.M.Sjöberg,
和
D.T.洛根(2010).
氧化态和还原态黄蛋白NrdI的高分辨率晶体结构——一种罕见的黄曲霉毒素。结构生物学。
|
|
FEBS J公司,277,4265-4277. |
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PDB代码:
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|
M.麦地那(2009).
黄素蛋白的结构和机制方面:从光系统I到NADP+的光合电子转移。
|
|
FEBS J公司,276,3942-3958. |
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|
|
R.P.Joosten,
J.Salzemann,
V.布洛赫,
H.Stockinger,
A.C.Berglund,
C.布兰切特,
E.Bongcam-Rudloff,
C.组合,
A.L.Da Costa,
G.Deleage,
M.迪亚雷纳,
R.Fabbretti,
G.费塔希,
弗莱格尔,
A.Gisel,
V.卡萨姆,
T.科尔维宁,
E.Korpelainen,
K.马蒂拉,
M.Pagni,
M.Reichstadt,
V.布雷顿,
I.J.痒,
和
G.弗里德(2009).
PDB_REDO:PDB中X射线结构模型的自动重新定义。
|
|
应用结晶仪,42,376-384. |
|
|
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|
J.A.Cotruvo,
和
J.斯塔布(2008年)。
NrdI是一种黄曲霉毒素,参与维持大肠杆菌Ib类核糖核苷酸还原酶中的二铁-甲酰自由基辅因子。
|
|
美国国家科学院程序,105,14383-14388. |
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|
石黑浩(H.Ishikita)(2007年)。
蛋白质环境对贝氏梭菌黄曲霉毒素氧化还原电位的影响。
|
|
生物化学杂志,282,25240-25246. |
|
|
|
|
|
胡彦宏,
李彦宏,
X.张,
X.郭,
B.夏,
和
C.金(2006).
大肠杆菌载脂蛋白和Holo型黄曲霉毒素MioC的溶液结构和骨架动力学:对辅因子结合和电子转移的影响。
|
|
生物化学杂志,281,35454-35466之间。 |
|
PDB代码:
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|
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|
|
R.Artali,
N.Marchini,
F.梅内盖蒂,
D.Cavazzini,
A.卡塞塔,
和
C.萨索内(2005).
半醌状态下普通脱硫弧菌S35C黄曲霉毒素突变体的结构。
|
|
Acta Crystallogr D生物晶体仪,61,481-484. |
|
PDB代码:
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|
|
S.阿拉加拉特南,
G.van Pouderoyen,
T.Pijning,
B.W.Dijkstra,
D.Cavazzini,
G.L.罗西,
W.M.Van Dongen,
C.P.van Mierlo,
W.J.van Berkel,
和
G.W.集装箱(2005).
棕色固氮菌Cys69Ala黄曲霉毒素II的晶体学研究:氧化还原电位的结构决定因素。
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蛋白质科学,14,2284-2295. |
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PDB代码:
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最新的参考文献首先显示。引文数据部分来自CiteXlore公司和部分从自动收割过程中。请注意,这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而,我们正在不断建立引文数据因此,随着时间的推移,将会有越来越多的参考文献。当参考描述PDB结构时,PDB代码是如右图所示。
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