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PDB总和条目1a8x
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美国国家科学院程序
95:4870-4875(1998) |
| PubMed编号：
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整合素α亚单位中β-螺旋桨结构域及其下表面钙结合位点的实验支持。
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C.Oxvig，
T.A.Springer公司。
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摘要 |
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整合素是一种在细胞中具有广泛重要性的大的异二聚体表面分子粘附。所有整合素α亚单位的N末端一半包含7个弱大约60个氨基酸的重复序列在配体中很重要结合，并被预测为合作折叠成单个具有七个β-表的β-螺旋桨域。我们提供证据支持该模型带有鼠抗人Mac-1单克隆抗体（alphaM beta2，CD11b/CD18）。这个抗体CBRM1/20与不同重复序列中的氨基酸残基结合在第一股之间的环中的一级结构中有94个残基和β-片5中的2个，以及β-片6的股3和股4之间的环。整合素中β片5-7的1-2个环具有EF手状Ca2+-结合图案。CBRM1/20在存在Ca2+或Sr2+的情况下与Mac-1结合，EC50为0.2 mM.Mg2+或Mn2+不能替代。其他表位的抗体Mac-1β-螺旋桨结构域在缺乏钙的情况下结合。单抗CBRM1/20可以不阻断配体结合。因此mAb CBRM1/20结合的β-螺旋桨结构域不结合配体，此外，不能结合其他整合素域，例如β亚基。
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所选图形 |
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图1。
图1。的拓扑结构 -螺旋桨整合素N端半的模型 -亚单位。每个-板材（W）包含四个反并联-股。Ws被压缩成环形，并围绕伪对称轴在一个中心腔中，每个W的股线为1用垂直虚线划分的FG-GAP重复是相对于Ws交错。假定钙结合环包含填充圆，并预测Mac-1的二硫键由水平条显示。I域插入连接W2和W3的回路。人和小鼠Mac-1氨基显示了W5的环1-2和W6的环3-4的酸序列。有助于单克隆抗体识别表位的残基CBRM1/20用星号表示。结扎的残留物Ca^2+通过侧链（1，3，5，9）或主链羰基O（7）inEF指针已编号。 |
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图3。
图3。这个-螺旋桨Mac-1的域-链条按照文本和图2所述进行建模。W1和W3为紫色、W2、W4和W7为红色，W5为黄色，W6为绿色。此视图显示了-螺旋桨含有取代后降低单克隆抗体结合力的残基白色CBRM1/20，并标有残留物和编号。残留物当被替换时，不影响装订的是彩色的绿松石和编号。抗体通常掩埋表面700-800μ2蛋白抗原（43,44）。实心圆区域中的700Ω2显示了单克隆抗体的近似大小CBRM1/20表位。周围必须有足够的可用空间包含抗体Fab结构域的表位。The dimensions of an抗体的V[H]V[L]结构域是 32 Å抗原结合面平面内的×42μl。画一个直径为42º的虚线圆圈以强调这个。 |
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数字是挑选出来的通过自动化流程。
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首先显示最新的参考文献。引文数据部分来自CiteXlore公司和部分来自自动收割程序。请注意，这可能是由于并非所有期刊都包含在任何一种方法。然而，我们正在不断建立引文数据因此，随着时间的推移，将会有越来越多的参考文献。
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