› 6伏/加仑

X射线衍射
4.31Ω分辨率

人转录因子ERG、与核心结合因子β（Cbfb）结合的人Runx2和米特拉霉素与16mer DNA CAGAGTGTCTTC复合物的DNA结合域的晶体结构

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb6vgg/pdb
PDB入口6vgg，由链条着色，前视图。
PDB入口6vgg由链条着色，侧视图。
PDB入口6vgg由链条着色，顶视图。
源生物： 智人
主要出版物：
米特拉霉素对致癌FLI1和ERG交易的变构干涉。
侯 C类,曼达尔 A类,罗尔 J型,茨奥迪科夫 奥夫
结构 29404-412.e4（2021年）
PMID:33275876

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
序列域：

结构分析 细节

组件组成：
异五聚体(首选)
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-120775（首选）
录入内容：
3种不同的多肽分子
2种不同的DNA分子
大分子（5种不同）：
转录调节因子ERG 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：128个氨基酸
理论重量：14.93千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：第11308页 （残留物：306-419；覆盖率：24%）
基因名称： ERG公司
序列域： Ets-域
Runt-related转录因子2 链条：D
分子细节›
链条：D类
长度：177个氨基酸
理论重量：19.54千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：问题13950 （残留物：111-287；覆盖率：34%）
基因名称： AML3型,CBFA1公司,OSF2型,聚乙烯双酚2A,RUNX2（运行2）
序列域： 结构域
核心结合因子亚单位β 链条：G
分子细节›
链条：G公司
长度：156个氨基酸
理论重量：18.26千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：问题13951 （残留物：1-142；覆盖率：78%）
基因名称： CBFB公司
序列域： 核心结合因子β亚单位
DNA（5'-D（P*CP*AP*GP*AP*GP*GP*AP*TP*GP*GP*TP*GP*CP*TP*C）-3'） 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：16个核苷酸
理论重量：4.95千达
DNA（5'-D（P*GP*AP*AP*GP*CP*CP*AP*CP*AP*CP*AP*TP*CP*TP*G）-3'） 链条：C
分子细节›
链条：C类
长度：16个核苷酸
理论重量：4.84 KDa

配体和环境

2个结合配体：
配体QWP 2 x QWP
配体MG 1 x毫克
无改良残留物

实验和验证 细节

进入百分位分数
X射线源： APS梁线22-ID
空间组： P（P）6222
单位单元格：
a： 104.678欧 b： 104.678Å c： 322.836Å
α: 90° β: 90° γ: 120°
R值：
R（右） R（右）工作 R（右）自由的
0.253 0.251 0.285
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）

快速链接

引文

2篇评论引文

Fli-1在造血和恶性转化中作用的最新研究进展。
Ben-David等人（2022年）
还有1个

1次提及但未引用

米特拉霉素对致癌FLI1和ERG交易的变构干涉。
Hou等人（2021）