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X射线衍射
2.78Å分辨率

CD146 D4-D5/AA98工厂

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb6lyn/pdb
PDB入口6lyn，由链条着色，前视图。
PDB入口6lyn由链条着色，侧视图。
PDB入口6lyn被链条着色，顶视图。
源生物：
主要出版物：
AA98抑制CD146介导的内皮细胞活化的结构基础。
陈 X（X）,雁鸣声 H（H）,线路接口单元 D类,徐 问,段 H（H）,冯 J型,雁鸣声 X（X）,谢 C类
i科学 24102417 (2021)
PMID:33997697

功能与生物学 细节

生化功能：
  • 未指定的
生物过程：
  • 未指定的
蜂窝组件：
  • 未指定的
序列域：

结构分析 细节

组件组成：
异三聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-211221（首选）
录入内容：
3种不同的多肽分子
大分子（3种不同）：
AA98 Fab重链 链条：A、H
分子细节›
链：A、 H（H）
长度：217种氨基酸
理论重量：23.46千达
源生物： 小家鼠
表达式系统： 小家鼠
AA98 Fab轻链 链条：B、L
分子细节›
链：B、 L（左）
长度：218个氨基酸
理论重量：24.03千达
源生物： 小家鼠
表达式系统： 小家鼠
细胞表面糖蛋白MUC18 链条：C、D
分子细节›
链：C、 天
长度：184个氨基酸
理论重量：20.33千达
源生物： 智人
表达式系统： 灰仓鼠
UniProt公司：
  • 标准：第43121页 （残留物：336-519；覆盖率：30%）
基因名称： MCAM公司,MUC18型
序列域： 免疫球蛋白结构域

配体和环境

5个结合配体：
配体PO4 2 x PO4
配体GOL 3 x高尔夫
配体CL 4个CL
配体EPE 2个EPE
配体NAG 4个NAG
无改良残留物

实验和验证 细节

进入百分位分数
X射线源： SSRF梁线BL19U1
空间组： P（P）21
单位单元格：
a： 84.203奥 b： 88.387欧 c： 94.644欧
α: 90° β: 89.93° γ: 90°
R值：
R（右） R（右）工作 R（右）自由的
0.219 0.217 0.262
表达式系统：
  • 小家鼠
  • 灰仓鼠

快速链接

引文

4其他文章引用

与LCK结合的CD146促进小鼠T细胞受体信号传导和抗肿瘤免疫反应。
Duan等人（2021）
还有3个

1次提及但未引用

AA98抑制CD146介导的内皮细胞活化的结构基础。
Chen等人（2021）