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X射线衍射
2.77º分辨率

自动禁用ERG Ets域-DNA复合物

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb4iri/pdb
PDB条目4iri由链条着色，前视图。
PDB条目4iri由链条着色，侧视图。
PDB入口4iri由链条着色，顶视图。
来源生物： 智人
主要出版物：
转录因子ERG的结构和动力学研究表明，DNA结合是变构自抑制的。
里根 MC公司,霍兰伊 PS（聚苯乙烯）,普赖尔 电气工程师,萨维尔 JL公司,卡菲索 DS公司,布什韦勒 金华
美国国家科学院程序 11013374-9 (2013)
PMID:23898196

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
  • 未指定的
序列域：

结构分析 细节

组件组成：
异三聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-117658型（首选）
录入内容：
1种不同的多肽分子
2种不同的DNA分子
大分子（3种不同）：
转录调节因子ERG 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：129个氨基酸
理论重量：14.87千达
来源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：第11308页 （残留物：280-405；覆盖率：26%）
基因名称： ERG公司
序列域： Ets-域
结构域： 翼螺旋状DNA结合域超家族/翼螺旋状DNA结合域
DNA（5'-D（*GP*AP*CP*CP*GP*GP*AP*GP*TP*GP*G）-3'） 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：12个核苷酸
理论重量：3.75千达
来源生物： 智人
表达式系统：未提供
DNA（5'-D（*CP*CP*AP*CP*TP*TP*CP*GP*GP*TP*C）-3'） 链条：C
分子细节›
链条：C类
长度：12个核苷酸
理论重量：3.57 KDa
来源生物： 智人
表达式系统：未提供

配体和环境

无结合配体
无改良残留物

实验和验证 细节

入学百分位数分数
X射线源： APS梁线22-ID
空间组： P（P）4122
单位单元格：
a： 51.486亿 b： 51.486亿 c： 141.313奥
α: 90° β: 90° γ: 90°
R值：
对 对工作 对自由的
0.191 0.191 0.21
表达式系统：
  • 大肠杆菌
  • 未提供

快速链接

引文

5篇评论引文

癌基因ERG：前列腺癌的关键因素。
Adamo等人（2016）
还有4个

13次未被引用

ERF突变揭示了控制前列腺癌发生的ETS因子的平衡。
Bose等人（2017）
还有12个