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X射线衍射
2.61Ω分辨率

人SUMO E1~SUMO1-AMP四面体中间物模拟物

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb3kyd/pdb
PDB入口3 kyd，由链条着色，前视图。
PDB入口3码，由链条着色，侧视图。
PDB入口3 kyd，由链条着色，顶视图。
来源生物： 智人
主要出版物：
活性位点重塑伴随着SUMO E1中硫酯键的形成。
奥尔森 SK公司,卡皮利 AD公司,卢 X（X）,棕褐色 DS公司,利马 光盘
自然 463906-12 (2010)
项目管理标识号：20164921

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
序列域：

结构分析 细节

组件组成：
异三聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-159021（首选）
录入内容：
3种不同的多肽分子
大分子（3种不同）：
SUMO-激活酶亚单位1 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：346个氨基酸
理论重量：38.5千达
来源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：问题9UBE0 （残留物：1-346；覆盖率：100%）
基因名称： AOS1型,SAE1公司,SUA1公司,UBLE1A公司
序列域： ThiF家族
结构域： NAD（P）-结合Rossmann-like结构域
SUMO激活酶亚基2 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：551个氨基酸
理论重量：61.56千达
来源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：问题9UBT2 （残留物：1-549；覆盖率：86%）
基因名称： HRIHFB2115型,SAE2型,UBA2型,UBLE1B公司
序列域：
结构域：
小泛素相关修饰物1 链条：D
分子细节›
链条：D类
长度：115个氨基酸
理论重量：13.21千达
来源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：第63165页 （残留物：1-96；覆盖率：95%）
基因名称： OK/SW-cl.43号机组,SMT3C型,SMT3H3型,相扑1,UBL1型
序列域： 泛素-2类Rad60 SUMO类
结构域： 磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基；链A，域1

配体和环境

3个结合配体：
配体EDO 3个EDO
配体ZN 1 x ZN
配体VMX 1个VMX
无改良残留物

实验和验证 细节

入学百分位数分数
X射线源： APS梁线24-ID-C
空间组： P（P）21212
单位单元格：
a： 101.717Å b： 115.608欧 c： 90.837奥
α: 90° β: 90° γ: 90°
R值：
对 对工作 对自由的
0.23 0.227 0.284
表达式系统： 大肠杆菌

快速链接

引文

37条评论引文

SUMO途径：形成特异性、结合和识别的新机制。
Gareau等人（2010年）
还有36个

14次未被引用

泛素样蛋白结合：结构、化学和机制。
Cappadocia等人（2018年）
还有13个