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X射线衍射
2.4º分辨率

人SUMO-1和人Ubc9之间的非共价复合物

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb2pe6/pdb
PDB入口2pe6由链条着色，前视图。
PDB入口2pe6由链条着色，侧视图。
PDB入口2pe6，按链条着色，俯视图。
源生物： 智人
主要出版物：
SUMO和Ubc9之间复合体的结构和分析说明了保守E2-Ubl相互作用的特征。
卡皮利 AD公司,利马 光盘
分子生物学杂志 369608-18 (2007)
PMID:17466333

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
序列域：
结构域：

结构分析 细节

组件组成：
异二聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-159004（首选）
录入内容：
2种不同的多肽分子
大分子（2种不同）：
SUMO-结合酶UBC9 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：161个氨基酸
理论重量：18.31千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：第63279页 （残留物：1-158；覆盖率：100%）
基因名称： UBC9公司,UBCE9大学,UBE2I公司
序列域： 泛素结合酶
结构域： 泛素结合酶
小泛素相关修饰物1 链条：B
分子细节›
链条：B
长度：97种氨基酸
理论重量：11.15千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：第63165页 （残留物：1-97；覆盖率：96%）
基因名称： OK/SW-cl.43号机组,SMT3C型,SMT3H3型,SUMO1公司,UBL1型
序列域： 泛素-2类Rad60 SUMO类
结构域： 磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基；链A，域1

配体和环境

无结合配体
无修饰残留物

实验和验证 细节

入学百分位数分数
X射线源： APS梁线24-ID-C
空间组： P（P）21212
单位单元格：
a： 86.7亿 b： 38.6亿 c： 83.4Å
α: 90° β: 90° γ： 90°
R值：
R（右） R（右）工作 R（右）自由的
0.225 0.225 0.25
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）

快速链接

引文

18条评论引文

SUMO途径：形成特异性、结合和识别的新机制。
Gareau等人（2010年）
还有17个

12次未被引用

泛素样蛋白结合：结构、化学和机制。
Cappadocia等人（2018年）
还有11个