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X射线衍射
2.8°分辨率

与干扰素b增强子结合的NFkB、IRF7、IRF3的晶体结构

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb2o61/pdb
PDB条目2o61由链条着色，前视图。
PDB条目2o61由链条着色，侧视图。
PDB入口2o61被链条着色，顶视图。
源生物： 智人
主要出版物：
干扰素-β增强子体的原子模型。
窗格 天,亚蒂斯 吨,哈里森 联合国安全理事会
单元格 1291111-23 (2007)
项目管理标识代码：17574024

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
序列域：
结构域：

结构分析 细节

组件组成：
异四聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-115708型（首选）
录入内容：
2种不同的多肽分子
2种不同的DNA分子
大分子（4种不同）：
干扰素调节因子3；干扰素调节因子7；转录因子p65 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：540个氨基酸
理论重量：61.03千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：Q04206问题 （残留物：20-291；覆盖率：49%）
  • 标准：问题92985 （残留物：8-125；覆盖率：24%）
  • 标准：问题14653 （残留物：9-111；覆盖率：24%）
基因名称： 红外f3,IRF7型,NFKB3型,RELA公司
序列域：
结构域：
核因子NF-kappa-B p50亚单位 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：314种氨基酸
理论重量：35.18千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：第19838页 （残留物：40-352；覆盖率：32%）
基因名称： NFKB1型
序列域：
结构域：
2006年3月 链条：E
分子细节›
链条：E类
长度：36个核苷酸
理论重量：11.27千达
34年3月 链条：F
分子细节›
链条：F类
长度：34个核苷酸
理论重量：10.26千达

配体和环境

无结合配体
无修饰残留物

实验和验证 细节

入学百分位数分数
X射线源： ALS梁线8.2.1
空间组： P（P）212121
单位单元格：
a： 95.222奥 b： 116.37奥 c： 134.237欧
α: 90° β: 90° γ: 90°
R值：
R（右） R（右）工作 R（右）自由的
0.245 0.245 0.278
表达式系统： 大肠杆菌

快速链接

引文

99条评论引文

干扰素和病毒：诱导、信号传递、抗病毒反应和病毒对策之间的相互作用。
Randall等人（2008）
98个以上

未被引用的30次提及

缺少一个简单的代码：转录因子如何读取基因组。
Slattery等人（2014）
再增加29个