国际奥委会

X射线衍射
2.9Ω分辨率

人Senp2与RanGAP1-SUMO-1配合物的晶体结构

发布日期:
内政部: 10.2210/pdb2io2/pdb
源生物: 智人
主要出版物:
SENP2蛋白酶与SUMO前体和结合底物相互作用的结构基础。
自然结构分子生物学 131060-8 (2006)
PMID:17099700

功能与生物学 细节

结构分析 细节

组件组成:
异十二烷(首选)
PDBe复合体ID:
PDB-CPX-155414(首选)
录入内容:
3种不同的多肽分子
大分子(3种不同):
Sentrin-specific蛋白酶2 链条:A
分子细节›
链条:A类
长度:232个氨基酸
理论重量:27.34千达
源生物: 智人
表达式系统: 大肠杆菌
UniProt公司:
  • 标准:问题9HC62 (残留物:364-589;覆盖率:38%)
基因名称: KIAA1331号机组,传感器2
序列域: Ulp1蛋白酶家族,C末端催化结构域
结构域: 腺病毒蛋白酶;链条A
小泛素相关修饰物1 链条:B
分子细节›
链条:B类
长度:82种氨基酸
理论重量:9.47千达
源生物: 智人
表达式系统: 大肠杆菌
UniProt公司:
  • 标准:第63165页 (残留物:18-97;覆盖率:79%)
基因名称: OK/SW-cl.43号机组,SMT3C型,SMT3H3型,SUMO1公司,UBL1型
序列域: 泛素-2类Rad60 SUMO类
结构域: 磷脂酰肌醇3-激酶催化亚单位;链A,域1
Ran GTPase激活蛋白1 链条:C
分子细节›
链条:C类
长度:172个氨基酸
理论重量:18.67千达
源生物: 智人
表达式系统: 大肠杆菌
UniProt公司:
  • 标准:第46060页 (残留物:418-587;覆盖率:29%)
基因名称: 科威特航空公司1835,RANGAP1公司,标准偏差
序列域: RanGAP1 C端域
结构域: Ran-GTP酶激活蛋白1,C末端结构域

配体和环境

无结合配体
无改良残留物

实验和验证 细节

进入百分位分数
X射线源: APS梁线31-ID
空间组: P(P)6422
单位单元格:
a: 163.96欧 b: 163.96欧 c: 77.77欧
α: 90° β: 90° γ: 120°
R值:
R(右) R(右)工作 R(右)自由的
0.268 0.268 0.301
表达式系统: 大肠杆菌