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X射线衍射
2.1°分辨率

SUMO1-共轭胸腺嘧啶DNA糖苷酶的晶体结构

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb1wyw/pdb
PDB入口1wyw由链条着色，前视图。
PDB入口1wyw由链条着色，侧视图。
PDB入口1wyw由链条着色，顶视图。
源生物： 智人
主要出版物：
与SUMO-1偶联的胸腺嘧啶DNA糖苷酶的晶体结构。
爸爸 D类,迈塔 N个,Jee（杰伊） JG公司,内村 Y（Y）,Saitoh公司 H（H）,菅泽 K（K）,花冈 F类,Tochio公司 H（H）,弘毅 H（H）,白川方明 M（M）
自然 435979-82 (2005)
电话：15959518

功能与生物学 细节

催化反应： 
水解不匹配的双链DNA和多核苷酸，释放游离胸腺嘧啶
生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
序列域：
结构域：

结构分析 细节

组件组成：
异二聚体(首选)
程序集名称：
PDBe复合体ID：
PDB-CPX-159017（首选）
录入内容：
2种不同的多肽分子
大分子（2种不同）：
G/T错配特异性胸腺嘧啶DNA糖苷酶 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：230个氨基酸
理论重量：26.18千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：问题13569 （残留物：112-339；覆盖率：56%）
基因名称： TDG公司
序列域： 尿嘧啶DNA糖基化酶超家族
结构域： 尿嘧啶-DNA糖基化酶样结构域
小泛素相关修饰物1 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：97种氨基酸
理论重量：11.15千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）
UniProt公司：
  • 标准：第63165页 （残留物：1-97；覆盖率：96%）
基因名称： OK/SW-cl.43号机组,SMT3C型,SMT3H3型,SUMO1公司,UBL1型
序列域： 泛素-2类Rad60 SUMO类
结构域： 磷脂酰肌醇3-激酶催化亚单位；链A，域1

配体和环境

3个结合配体：
配体CL 3个CL
配体MG 5 x毫克
配体NA 1 x不适用
无改良残留物

实验和验证 细节

进入百分位分数
X射线源： 光子工厂光束线BL-6A
空间组： P（P）212121
单位单元格：
a： 42.212奥 b： 70.42Å c： 106.434奥
α: 90° β: 90° γ: 90°
R值：
R（右） R（右）工作 R（右）自由的
0.205 0.205 0.245
表达式系统： 大肠杆菌BL21（DE3）

快速链接

引文

28条评论引文

苏美化的概念：十年过去了。
Geiss-Friedlander等人（2007年）
还有27个

14次未被引用

DNA糖基化酶结构机制的研究进展。
Brooks等人（2013）
还有13个