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溶液核磁共振

OCT1和SOX2转录因子DNA结合域与HOXB1调节元件19MER寡核苷酸的三元复合物

发布日期：
内政部： 10.2210/pdb1o4x/pdb
PDB入口1o4x，由链条着色，前视图。
PDB入口1o4x，由链条着色，侧视图。
PDB入口1o4x，由链条着色，顶视图。
源生物： 智人
主要出版物：
42-kDa Oct1.Sox2.Hoxb1-DNA三元转录因子复合物的溶液结构揭示了Oct1和Sox2协同转录激活的分子基础。
威廉姆斯 直流,蔡 M（M）,克隆 总经理
生物化学杂志 2791449-57 (2004)
PMID:14559893

功能与生物学 细节

生化功能：
生物过程：
蜂窝组件：
  • 未指定的
序列域：
结构域：

结构分析 细节

组件组成：
异四聚体(首选)
程序集名称：
PDBe综合体ID:
PDB-CPX-114296（首选）
条目内容：
2种不同的多肽分子
2种不同的DNA分子
大分子（4种不同）：
POU结构域，2类，转录因子1 链条：A
分子细节›
链条：A类
长度：167个氨基酸
理论重量：19.08千达
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：第14859页 （残留物：280-442；覆盖率：22%）
基因名称： 华侨城1号,OTF1型,POU2F1
序列域：
结构域：
转录因子SOX-2 链条：B
分子细节›
链条：B类
长度：88种氨基酸
理论重量：10.72 KDa
源生物： 智人
表达式系统： 大肠杆菌
UniProt公司：
  • 标准：第48431页 （残留物：39-121；覆盖率：26%）
基因名称： SOX2标准
序列域： HMG（高迁移率组）箱
结构域： 高移动性组盒域
5'-D（*TP*GP*TP*CP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*GPS*CP*TP*AP*AP*TP*G）-3’ 链条：C
分子细节›
链条：C类
长度：19个核苷酸
理论重量：5.82千达
5'-D（*CP*AP*TP*TP*AP*GP*CP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*AP*AP*AP*CP*A）-3’ 链条：D
分子细节›
链条：D类
长度：19个核苷酸
理论重量：5.83千达

配体与环境

无结合配体
无改良残留物

实验和验证 细节

入学百分位数分数
精炼方法： 联动刚体/扭角动力学
表达式系统： 大肠杆菌

快速链接

引文

21条评论引文

顺磁弛豫增强的理论、实践和应用，用于表征生物大分子及其复合物的瞬态低布居态。
Clore等人（2009年）
20多个

21次未被引用

SOX2蛋白生物化学在干细胞、重编程和癌症中的作用：PI3K/AKT/SOX2轴及其以外。
Schaefer等人（2020年）
20多个