数据驱动的痴呆症理解方法| EMBL-EBI培训

EMBL-EBI课程

数据驱动的痴呆症理解方法

本课程为从事痴呆研究的个人提供访问和分析痴呆数据的技能。参与者将学习应用生物信息学方法，结合不同的数据类型，并利用相关的痴呆数据资源，提高他们在该领域的研究能力。

这门课是为谁准备的？

本课程面向在痴呆研究领域工作的个人，他们在生物信息学方面的经验最少。预计申请人在研究中使用生物信息学尚处于早期阶段，需要进一步发展他们的技能和知识。参与者需要了解Unix命令行和R统计软件包的基本知识。我们推荐以下免费教程：

Unix环境简介–https://swcarpentry.github.io/shell-novice/index.html
基本R概念–https://swcarpentry.github.io/r-新手炎症/

我将学到什么？

学习成果

定位和搜索公共可用的感兴趣的生物信息学数据，包括痴呆症专用资源
使用软件和工具操作和分析数据
将适当的生物信息学方法应用于研究项目
结合不同类型的数据以获得进一步的见解

课程内容

批量和单细胞RNA测序和监管信息数据库
从“组学”数据中提取痴呆相关机制的工具
痴呆症的生物成像
痴呆症数据资源：ADDI、AD Atlas、DPUK、AD知识门户
EMBL-EBI数据资源：基因表达图谱、ChEMBL、PRIDE、开放目标

培训师

马蒂亚斯·阿诺德
德国慕尼黑Helmholtz Zentrum

爱德华·阿维佐夫
英国痴呆研究所；英国剑桥大学

Sarah Bauermeister女士
英国痴呆症平台

加布里埃尔·马特乌斯·伯纳多·哈林顿
英国加的夫大学

安娜丽莎·布尼埃罗
EMBL-EBI公司

夏洛特·卡皮坦奇克
伦敦国王学院

西比拉·科贝特
EMBL-EBI公司

海伦娜·科努
EMBL-EBI公司

Valentina Escott价格
英国痴呆研究所；英国数据科学中心

马克·菲尔斯
荷兰鲁汶Katholieke大学

达里亚·加夫里奥基纳
英国痴呆研究所；英国痴呆平台

Deepti Jaiswal Kundu公司
EMBL-EBI公司

利奥拉·维莫夫斯基
EMBL-EBI公司

萨曼妮·库查基
英国萨里大学

克里希纳·库马尔·蒂瓦里
EMBL-EBI公司

艾布克·库普库·尤尔达斯
EMBL-EBI公司

皮埃尔·帕鲁托
英国痴呆研究所；英国剑桥大学

安妮塔·斯科内斯
厄勒姆研究所

艾米莉·西蒙兹
英国痴呆研究所；英国数据科学中心

艾比·范德·林登
Sage生物网络，美国西雅图

玛丽亚·乌尔默
Helmholtz Zentrum慕尼黑

莫妮卡·斯克洛格斯
阿尔茨海默病数据倡议（ADDI）

格雷厄姆·比尔登
阿尔茨海默病数据倡议（ADDI）

艾玛·戴维斯
弗朗西斯·克里克研究所

计划

时间	主题	教练
第一天–2024年4月8日星期一
10:00 – 10:30	注册和咖啡
10:30 – 11:30	EMBL-EBI课程欢迎和介绍	达扬·阿劳霍
11:30 – 12:30	单细胞RNAs-seq分析简介	安妮塔·斯科内斯
12:30 – 13:30	午餐与海报会议
13:30– 15:30	单细胞分析在痴呆研究中的应用：实践	马克·菲尔斯和艾玛·戴维斯
15:30 – 16:00	休息
16:00 – 17:00	表达图谱和单细胞表达图谱简介	利奥拉·维莫夫斯基
17:00 – 18:00	住宿登记
19:00	晚餐
第二天–2024年4月9日星期二
09:30 – 11:30	英国痴呆症平台	莎拉·鲍尔米斯特
11:30 – 12:00	休息
12:00 – 13:00	主题：机器学习在痴呆研究中的应用	萨曼妮·库查基
13:00 – 14:00	午餐与海报会议
14:00 – 15:00	从经济数据中提取信息：讲座	马特乌斯·贝尔纳多·哈林顿和夏洛特·卡皮坦奇克
15:00 – 15:30	休息
15:30 – 17:30	从组学数据中提取信息：实用	马特乌斯·贝尔纳多·哈林顿和夏洛特·卡皮坦奇克
17:30	一天结束
19:00	晚餐
第三天–2024年4月10日星期三
09:30 – 11:30	生物标记物和多基因风险评分	瓦伦蒂娜·埃斯科特-普莱斯和艾米莉·西蒙兹
11:30 – 12:00	休息
12:00 – 13:00	痴呆症数据资源：AD Atlas	马蒂亚斯·阿诺德和玛丽亚乌尔默
13:00 – 14:00	午餐
14:00 – 15:00	痴呆症数据资源：AD Atlas实用	马蒂亚斯·阿诺德和玛丽亚乌尔默
15:00 – 15:30	休息
15:30 – 17:30	广告知识门户	艾比·范德·林登
17:30	一天的结束
19:00	晚餐
第四天–2024年4月11日星期四
9:30 – 10:30	痴呆症的生物成像	爱德华·阿维佐夫和皮埃尔·帕鲁托
10:30 – 11:00	休息
11:00 – 13:00	图像实用	爱德华·阿维佐夫和皮埃尔·帕鲁托
13:00 – 14:00	午餐
14:00 – 15:00	空间转录组学	达里亚·加夫里奥基纳
15:00 – 15:30	休息
15:30 – 17:30	痴呆症数据资源：ADDI	Graham Bearden和Monica Scroggs
17:30	一天的结束
18:30	红狮餐厅晚餐
第五天–2024年4月12日星期五
09:30 – 10:30	开放式目标	海伦娜·科努和安娜丽莎·布尼埃罗
10点30分至11点	休息
11:00 – 12:00	骄傲	胡安·安东尼奥·维兹卡伊诺
12:00 – 13:00	午餐
13:00 – 14:00	ChEMBL公司	西比拉·科贝特
14:00 – 15:00	反应途径	克里希纳·蒂瓦里
15:00 – 15:30	休息
15:30 – 16:00	BioImage存档	艾布克·库普库·尤尔达斯
16:00 – 16:15	总结	达扬·阿劳霍
16:15	课程结束了
16:30	剑桥大学教练

本课程已结束

2024年4月8日至12日

欧洲生物信息研究所

大不列颠联合王国

850.00英镑，包括四晚住宿和餐饮，包括晚餐

联系人
胡安妮塔·里维罗斯

组织者

Dayane Rodrigues Araujo公司
EMBL-EBI公司
阿莫尼达·扎迪萨
英国痴呆研究所

与：

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