命运

创建扩散贴图


生物导体版本:释放(3.19)

创建和打印扩散贴图。

作者:菲利普·安格勒、拉勒·哈格沃尔迪(Laleh Haghverdi)[ctb]、马伦·贝特纳(Maren Büttner)[ctb],费边·泰斯[ctb],卡斯滕·马尔,弗洛里安·比特纳

维护人员:菲利普·安格勒(Philipp Angerer)

引文(从R中输入引文(“命运”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“命运”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“命运”)
命运2.0带来了扩散伪时间(DPT)类 HTML格式 R脚本
命运主小插曲:从这里开始! HTML格式 R脚本
用命运3检测相关基因 HTML格式 R脚本
用提供的数据再现扩散贴图渐晕图() HTML格式 R脚本
全局与局部内核的效果 HTML格式 R脚本
tidyverse和ggplot与命运的整合 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,细胞生物学,聚类,软件,可视化
版本 3.18.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.4.0)
进口 方法、图形、grDevices、网格、utils、stats、矩阵、Rcpp(>=0.10.3)、RcppEigen、RSpectra(>=0.14-0)、irlba、,pca方法,博科生物,生物遗传学,摘要实验,单细胞实验,ggplot2,ggplot.multiposts,rlang,tidyr,tidyselect,ggthemes,VIM,knn.convertree,proxy,RcppHNSW,smooler,scales,scatterplot3d
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址 https://theislab.github.io/destine/ https://github.com/theislab/destine/ https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny(赫尔姆霍兹-穆恩琴) https://bioconductor.org/packages/destiny网站 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715
错误报告 https://github.com/theislab/destry/issues
查看更多
建议 knitr、rmarkdown、igraph、testtat、FNN、tidyverse、gridExtra、cowplot、冲突、绿色、rgl、,scRNA序列,组织管理例会.db,尖叫声,代表
链接到 Rcpp、RcppEigen、grDevices
增强功能 rgl、,单细胞实验
取决于我
导入我 苯丙氨酸脱氢酶
建议我 赛利德,CellTrails公司,单片眼镜
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 目的地_3.18.0.tar.gz
Windows二进制 目的地_3.17.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 目的地_3.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 目的地_3.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/命运
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/destain(https://code。biocondustor.org/blowse/distain)/
包短Url https://bioconductor.org/packages/destiny网站/
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