MSstatsLiP公司
基于鸟枪质谱的蛋白质组学实验中的LiP显著性分析
生物导体版本:释放(3.18)
用于LiP肽和蛋白质显著性分析的工具。提供总结、估计LiP肽丰度和检测不同条件变化的功能。利用MSstats系列软件包的功能。
作者:德文·科勒[aut,cre],Tsung-Heng Tsai[aut],Ting Huang[aut],Mateusz Staniak[aut',Meena Choi[aut%],Valentina Cappeletti[aut]Liliana Malinovska[aut%],Olga Vitek[aut%'
维护人员:德文·科勒(Devon Kohler)<Kohler.d at东北部.edu>
引文(从R中输入引文(“MSstatsLiP”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MSstatsLiP”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“MSstatsLiP”)
详细信息
生物视图 |
差异表达式,免疫肿瘤学,质谱学,规范化,一个频道,蛋白质组学,质量控制,软件,双通道 |
版本 |
1.8.2 |
在生物导体中 |
生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
dplyr、gridExtra、stringr、ggplot2、grDevices、,MS统计,MS统计转换,数据表,生物串,MS统计PTM、Rcpp、checkmate、factoextra、ggpubr、purr、tibble、tidyr、tidyverse、scales、stats |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsLiP/issues网站 |
查看更多
建议 |
仿生风格、knitr、rmarkdown、covr、tinytest、gghighlight |
链接到 |
卢比 |
增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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链接到我 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。