集群重要性

ClusterSignificance包提供了一些工具来评估降维数据表示中的类簇是否与置换数据不同

生物导体版本：释放（3.18）

ClusterSignificance包提供了一些工具，用于评估降维数据表示中的类簇是否与置换数据不同。这里的术语类簇是指表示数据中已知类的点簇。这对于确定变量子集（例如特定路径中的基因）是否能够单独将样本分为这些既定类别特别有用。ClusterSignificance通过将所有点投影到一维线上来实现这一点。然后对聚类分离进行打分，并使用置换方法评估由于偶然性导致的可见分离的概率。

作者：杰森·T·塞尔维斯〔aut，cre〕，杰斯珀·R·加丁〔aut〕

维护人员：杰森·瑟维斯（Jason T Serviss）

引文（从R中输入引文（“ClusterSignificance”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“ClusterSignificance”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“集群重要性”）

集群重要性渐晕	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	分类,群集,主要组件,软件,统计方法
版本	1.30.0
在生物导体中	生物多样性3.3（R-3.3）（8年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.3.0）
进口	方法，pracma，princurve（>=2.0.5），scatterplot3d，RColorBrewer，grDevices，graphics，utils，stats
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance网站/
错误报告	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/issues

建议	针织者，rmarkdown，测试者，仿生风格、ggplot2、plsgenomics、covr
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	集群重要性_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	集群显著性_1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	集群重要性_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	集群重要性_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterSignificance网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/ClusterSignificance
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Cluster重要性/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/ClusterSignificance网站/
软件包下载报告	下载统计信息