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UniProtKB/瑞士Prot
第1215页
:变体p.Ala858Val
整合素α-M
基因:ITGAM
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变量信息
序列信息
文献引用
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变量信息
变量位置:
858
氨基酸在UniProtKB标准蛋白序列上的位置改变。
变体类型:
LB/B(磅/磅)
变体分为三类:LP/P、LB/B和US。
LP/P:可能致病或致病。
LB/B:可能是良性的或良性的。
美国:重要性不确定
残留物变化:
从丙氨酸(A)到缬氨酸(V)的位置
858
(A858V,p.Ala858Val)。
表示变体的氨基酸变化。
UniProtKB/Swiss Prot中使用的氨基酸的一个字母和三个字母代码是IUPAC-IUB生物化学命名委员会采用的代码。
理化性质:
从小尺寸和疏水(A)变为中等尺寸和疏水性(V)
参考和变异残基的物理化学性质以及所涉及的变化。
BLOSUM分数:
0
Blosum矩阵中相应野生型到变异氨基酸变化的得分。
log-odds分数测量两种氨基酸偶然出现的可能性比率的对数。
使用Blosum62替代矩阵。
该替代矩阵包含一种氨基酸与另一种氨基酸之间所有可能交换的分数:
最低得分:
-4(替代概率低)。
最高得分:
11(替代概率高)。
有关更多信息,请访问
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其他资源:
链接到变体感兴趣的网站。
变型rs1143683[
数据库SNP
|
合奏
]
序列信息
变量位置:
858
氨基酸在UniProtKB标准蛋白序列上的位置改变。
蛋白质序列长度:
1152
规范序列的长度。
序列上的位置:
RSQRSWRLACESSTEVSG公司
A类
LKSTSCSINHPIFPENSEVT公司
残留物在序列上发生变化。
除非变体位于蛋白质序列的开头或结尾,否则将显示变体上游(20)和下游(20)的残基。
残留物保护:
变异体周围区域与各种同源序列的多重比对。
人类
RSQRSWRL-aesasstevsg公司
A类
LKSTSCSINHPIFPENSEVT公司
鼠标
LTKKPWFVKPAESSSEGHG公司
A类
LKSTTWNINHPIFPANSEV公司
邻域中的序列注释:
围绕变体的感兴趣区域或地点。
通常,所列特征是翻译后修饰、结合位点、酶活性位点、局部二级结构或引用文献中报告的其他特征。
“邻近序列注释”行具有固定格式:
类型:序列特征的类型。
位置:序列特征的端点。
描述:包含有关功能的其他信息。
类型
位置
描述
链条
17 – 1152
整合素α-M
拓扑域
17 – 1104
细胞外的
二硫键
847 – 864
文献引用
NIH全长cDNA项目的现状、质量和扩展:哺乳动物基因收集(MGC)。
MGC项目团队;
基因组研究14:2121-2127(2004)
引用原因:
核苷酸序列[LARGE SCALE MRNA](ISOFORM 1);
变体HIS-77;
THR-441;
VAL-858和SER-1146;
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