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UniProtKB/Swiss-Prot变体页面

UniProtKB/Swiss-Prot公司第19320页:变体p.Gly413Ala

血管细胞粘附蛋白1
基因:VCAM1
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变量信息 变量位置: 帮助 413 氨基酸在UniProtKB标准蛋白序列上的位置改变。
变体类型: 帮助LB/B(磅/磅)变体分为三类:LP/P、LB/B和US。
  • LP/P:可能致病或致病。
  • LB/B:可能是良性的或良性的。
  • 美国:重要性不确定

残留物变化: 帮助从甘氨酸(G)到丙氨酸(A)位置413(G413A,p.Gly413Ala)。表示变体的氨基酸变化。UniProtKB/Swiss-Prot中使用的氨基酸的单字母和三字母代码是IUPAC-IUB生化命名委员会采用的代码。
理化性质: 帮助从甘氨酸(G)变为小尺寸和疏水性(A)参考和变异残基的物理化学性质以及所涉及的变化。
BLOSUM分数: 帮助0Blosum矩阵中相应野生型到变异氨基酸变化的得分。log-odds分数测量两种氨基酸偶然出现的可能性比率的对数。使用Blosum62替代矩阵。该替代矩阵包含一种氨基酸与另一种氨基酸之间所有可能交换的分数:
  • 最低得分:-4(替代概率低)。
  • 最高得分:11(替换概率高)。
有关更多信息,请访问下一页

其他资源: 帮助 链接到变体感兴趣的网站。


序列信息 变量位置: 帮助 413 氨基酸在UniProtKB标准蛋白序列上的位置改变。
蛋白质序列长度: 帮助 739 规范序列的长度。
序列上的位置: 帮助EKGIQVELYSFPRDPEIEMS公司G公司GLVNGSVTVSCKVPSVYPL公司残留物在序列上发生变化。除非变体位于蛋白质序列的开头或结尾,否则将显示变体上游(20)和下游(20)的残基。
残留物保存: 帮助 变异体周围区域与各种同源序列的多重比对。
人类EKGIQVELYSFPRDPEIEMS公司G公司GLVNGSVTVSCKVPSVYPL公司                              EKGIKVDLYSFPRDVEMS公司G公司LLVDGNPVTVSCEVPNYPS公司鼠标EKRTQVEVYSFPEDPVIKMS公司G公司PLVHGRPVTVNCTVPNYPF公司老鼠EKTIQVEVYSFPEDPEIEIS公司G公司PLVHGRPVTVNCTVPNYPF公司
邻域中的序列注释: 帮助 围绕变体的感兴趣区域或地点。通常,所列特征是翻译后修饰、结合位点、酶活性位点、局部二级结构或引用文献中报告的其他特征。“邻近序列注释”行具有固定格式:
  • 类型:序列特征的类型。
  • 位置:序列特征的端点。
  • 描述:包含有关功能的其他信息。
类型位置描述
链条 25 – 739 血管细胞粘附蛋白1
拓扑域 25 – 698 细胞外的
408–506 Ig-like C2-5型
糖基化 417 – 417 N-连接(GlcNAc…)天冬酰胺



文献引文
提交
SeattleSNP变异发现资源;
引用原因:核苷酸序列[基因组DNA];变体PHE-318;ALA-384;ALA-413和LEU-716;
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