两个列表之间的grep

Question

我的Linux机器上有两个文件。第一个“list.txt”包含对象列表（2649个对象），而第二个“list_interactors.txt”包含一个较短的列表，其中包含之前列表中的一些对象（719个对象）。对于每个对象，其他列中都有一些相关联的变量。我想在文件“list_interactors”中列出所有对象（2649）以及特定对象的相关变量。

例子：

文件列表.txt

6轮胎_A_002__________2009年2月7日__________2001年9月3日__________第二轮5_D_2-3__________

文件列表交互器.txt

6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX

输出.txt

6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA7年2月_009日__________3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX第二轮5_D_2-3__________

我对编程语言不太熟悉。我尝试将函数grep与此脚本一起使用：

grep-f列表.txt列表_交互器.txt

但输出是一个类似文件“listinteractors.txt”的文件。

你能帮我吗？

Answer 1

$join-a 1<（sort list.txt）<（sort-list_interactors.txt）第二轮5_D_2-3__________3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA7年2月_009日__________

这使用参加在两个文件之间执行关系JOIN操作。默认情况下，第一个字段将用作联接键。

这个-a 1个期权使参加输出第一个文件中的所有行，即使第二个文件中没有匹配项（它执行“左连接”）。

输入数据到参加需要进行排序，我们通过调用分类在命令行上进行两次进程替换，分别在每个文件上执行。您还可以选择预先分类文件。

如果数据以制表符分隔，则可能需要添加-t$“\t”到的开始参加命令的参数。这将使输出保留现有的选项卡分隔符。

通过添加重定向输出>输出.txt如果要将其存储在文件中，则返回到命令末尾。

Answer 2

如果你想保持排序，你可以使用awk公司:

哎呀'FNR==NR{s[1]=$0}FNR=NR｛如果（s[$1]）打印s[$1]；否则打印$0｝'list_interactors.txt列表.txt

输出：

6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA2009年2月7日__________3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX第二轮5_D_2-3__________

Answer 3

$awk'NR==FNR{a[$1]=$0；next}{print（$1 in a？a[$1]：$0）}'list_interactors.txt list.txt6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA7年2月_009日__________3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX第二轮5_D_2-3__________

Answer 4

Perl一行程序还可以执行以下操作：

$perl-ane'{chomp；$s{$F[0]}=$_；}结束{打印“$s{$_}\n”进行排序（键（%s））}'list.txt list_interactors.txt第2天D_2-3__________3erf_1_001 __________ 3erf2_B质量6R XXXXX6tyr_A_002 __________ 6tyr1_B QRT54R AAAAA2009年2月7日__________