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EMan公司

swMATH ID: 9056
软件作者: 史蒂文·卢特克(Steven J.Ludtke);菲利普·鲍德温(Philip R.Baldwin);华秋
描述: EMAN:用于高分辨率单粒子重建的半自动化软件。我们提出了EMAN(电子显微图像分析),这是一个从透射电子显微图像进行半自动单粒子重建的软件包。该项目的目标是提供能够执行10°以上单粒子重建的软件,以便获得此类高分辨率数据。实现了一个完整的单粒子重建算法。可以使用选项为无对称、单轴旋转对称或二十面体对称的粒子生成初始模型。模型细化是一个迭代过程,它利用基于模型的投影匹配进行分类。CTF(对比度传递函数)参数是使用一种新的范式来确定的,在这种范式中,多张显微照片的数据是同时拟合的。然后,振幅和相位CTF校正作为优化回路的一部分自动执行。它提供了一个图形用户界面,因此即使那些没有多少图像处理经验的人也可以开始执行重建。高级用户可以直接使用低级shell命令,甚至可以利用EMAN的广泛图像处理库扩展包。该软件包是用C++从头开始编写的,并在我们的网站上免费提供。我们概述了该包,并用模拟数据进行了几个一致性测试。
主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S10478477999941746
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引用于: 15文件

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