EMan公司 swMATH ID: 9056 软件作者: 史蒂文·卢特克(Steven J.Ludtke);菲利普·鲍德温(Philip R.Baldwin);华秋 描述: EMAN:用于高分辨率单粒子重建的半自动化软件。我们提出了EMAN(电子显微图像分析),这是一个从透射电子显微图像进行半自动单粒子重建的软件包。该项目的目标是提供能够执行10°以上单粒子重建的软件,以便获得此类高分辨率数据。实现了一个完整的单粒子重建算法。可以使用选项为无对称、单轴旋转对称或二十面体对称的粒子生成初始模型。模型细化是一个迭代过程,它利用基于模型的投影匹配进行分类。CTF(对比度传递函数)参数是使用一种新的范式来确定的,在这种范式中,多张显微照片的数据是同时拟合的。然后,振幅和相位CTF校正作为优化回路的一部分自动执行。它提供了一个图形用户界面,因此即使那些没有多少图像处理经验的人也可以开始执行重建。高级用户可以直接使用低级shell命令,甚至可以利用EMAN的广泛图像处理库扩展包。该软件包是用C++从头开始编写的,并在我们的网站上免费提供。我们概述了该包,并用模拟数据进行了几个一致性测试。 主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S10478477999941746 相关软件: 冷冻SPARC;RELION公司;法语;XMIPP公司;IMAGIC公司;奇梅拉;cisTEM公司;运动Cor2;SPARX系列;crYOLO公司;深度选取器;冷冻-EM;DLMF公司;FINUFFT公司;阿斯卡隆;签名;Matlab公司;毕尔巴鄂结晶服务器;集群ES;TensorFlow公司 引用于: 15文件 全部的 前5名39位作者引用 三 还有,约阿金 三 歌手,阿米特 2 亚历克斯·H·巴内特。 2 塔米尔·本多利 2 阿米特·莫斯科 2 Rangan,Aaditya V。 2 斯皮瓦克,玛丽娜 1 阿尔贝托·巴特萨吉 1 拉杰库马尔·布亚 1 乔西·玛丽亚·卡拉佐 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 威廉·迪佩芬 1 彼得·多尔舒克(Peter C.Doerschuk)。 1 弗兰克·艾森哈伯 1 阿迪·沙沙·格瓦 1 Leslie F.Greengard。 1 阿米特·哈列维 1 京、朱翠 1 阿克塞尔·基登伯格 1 Lan、Ti-Yen 1 罗伊·R·莱德曼。 1 简·勒尔曼 1 李明 1 罗伯托·马拉比尼 1 尼古拉斯·马歇尔。 1 莱昂尼达斯·敏德里诺斯 1 奥赞·奥克坦 1 阿尔贝托·D·帕斯库阿尔·蒙塔诺。 1 安德拉斯·帕塔基 1 科塔吉里·拉马莫哈纳劳 1 艾丽斯·鲁克欣 1 谢尔斯,S.H.W。 1 奥特玛·谢泽尔 1 Schönlieb、Carola Bibiane 1 尤尔·什科尔尼斯基 1 Sorzano,首席运营官。 1 徐楠 1 于,贾 1 周,叶 全部的 前5名8篇连载文章中引用 5 反问题 三 SIAM成像科学杂志 1 运筹学年鉴 1 SIAM审查 1 SIAM科学计算杂志 1 数学建模与分析 1 反问题和成像 1 分子生物学方法 全部的 前5名在12个字段中引用 11 生物学和其他自然科学(92-XX) 6 信息与通信理论、电路(94-XX) 5 计算机科学(68至XX) 4 数值分析(65-XX) 三 统计学(62-XX) 2 积分变换,运算微积分(44-XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 实际功能(26年X月X日) 1 欧氏空间的调和分析(42至XX) 1 歧管和细胞复合体(57-XX) 1 光学、电磁理论(78-XX) 1 数学教育(97-XX) 按年份列出的引文