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RNA形状

swMATH ID: 7960
软件作者: Steffen P.、VoßB.、Rehmsmeier M.、Reeder J.、Giegerich R
描述: RNAshapes:基于抽象形状的集成RNA分析包。我们介绍了RNAshapes,这是一个新的软件包,它基于抽象形状方法集成了三种RNA分析工具:形状代表分析、形状概率计算和一致形状方法。这个新包在C语言中完全重新实现,在运行时和内存需求方面大大超过了原始实现。此外,我们还添加了一些有用的功能,如具有正确悬挂能量的次优折叠、结构图输出、形状匹配和滑动窗口方法。
主页: http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnashapes网站/
相关软件: 百万倍法国皇家医学会Pfold(折叠)CONTRAfold公司DINAMelt公司Sfold公司tRNA扫描-SEARB公司EMBOS公司最小值埃米尔吉维也纳RNA标签清理器OligoWalk公司最优RNAi阿斯塔拉维斯塔预GPISPEPlip公司BaCelLo公司PolyA_DB公司
引用于: 6文件
更多出版物: http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnashapes/references.html

2篇连载文章中引用

5 数学生物学杂志
1 分子生物学方法

按年份列出的引文